More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1811 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  100 
 
 
401 aa  824    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  78.06 
 
 
400 aa  646    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  81.55 
 
 
401 aa  668    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  76.26 
 
 
399 aa  647    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  75.69 
 
 
400 aa  650    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  100 
 
 
401 aa  824    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  74.18 
 
 
402 aa  622  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  75.51 
 
 
398 aa  616  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  65.03 
 
 
389 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  64.49 
 
 
389 aa  521  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  65.03 
 
 
389 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  64.23 
 
 
396 aa  518  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  63.97 
 
 
404 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  62.53 
 
 
393 aa  512  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  60.82 
 
 
391 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  61.86 
 
 
400 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  61.6 
 
 
391 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  64.25 
 
 
394 aa  501  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  59.69 
 
 
391 aa  498  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  61.98 
 
 
384 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  60.36 
 
 
388 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  63.16 
 
 
402 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  63.06 
 
 
397 aa  488  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  59.95 
 
 
407 aa  488  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  59.69 
 
 
402 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  58.85 
 
 
404 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  58.46 
 
 
400 aa  467  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  56.99 
 
 
386 aa  461  1e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  59.11 
 
 
402 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  57.44 
 
 
388 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  55.61 
 
 
400 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  59.84 
 
 
404 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  58.59 
 
 
400 aa  434  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  55.41 
 
 
388 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  55.73 
 
 
387 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  56.25 
 
 
387 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  53.28 
 
 
396 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  57.18 
 
 
397 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  53.87 
 
 
410 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  52.05 
 
 
392 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  52.17 
 
 
407 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  52.03 
 
 
407 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  54.13 
 
 
379 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  51.17 
 
 
399 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  51.84 
 
 
398 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  50.65 
 
 
414 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  51.85 
 
 
384 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  51.84 
 
 
384 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  51.16 
 
 
398 aa  398  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  54.76 
 
 
404 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  49.48 
 
 
392 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  51.04 
 
 
404 aa  387  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  50.39 
 
 
396 aa  385  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  51.57 
 
 
398 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  51.57 
 
 
398 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  49.22 
 
 
402 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  49.21 
 
 
400 aa  381  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  48.68 
 
 
394 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  49.22 
 
 
398 aa  379  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  48.58 
 
 
393 aa  379  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  48.19 
 
 
388 aa  375  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  48.96 
 
 
396 aa  375  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  48.41 
 
 
382 aa  375  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  49.87 
 
 
394 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  48.15 
 
 
382 aa  373  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  50.77 
 
 
392 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  49.22 
 
 
390 aa  371  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  50.26 
 
 
398 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  47.23 
 
 
389 aa  358  7e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  46.85 
 
 
394 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  46.42 
 
 
405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  47.64 
 
 
383 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  49.34 
 
 
378 aa  356  5e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  44.33 
 
 
388 aa  355  7.999999999999999e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  46.45 
 
 
396 aa  355  8.999999999999999e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  48.33 
 
 
409 aa  352  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  46.07 
 
 
383 aa  350  2e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  48.94 
 
 
394 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  48.55 
 
 
386 aa  350  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  45.79 
 
 
403 aa  350  4e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  46.75 
 
 
393 aa  349  5e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  47.14 
 
 
403 aa  346  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  48.07 
 
 
395 aa  344  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  47.56 
 
 
404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  50.26 
 
 
380 aa  343  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  47.3 
 
 
404 aa  342  5.999999999999999e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  47.56 
 
 
404 aa  341  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  45.83 
 
 
417 aa  342  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  46.72 
 
 
396 aa  340  2e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  47.3 
 
 
404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  48.82 
 
 
388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  46.79 
 
 
404 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  46.79 
 
 
404 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  46.79 
 
 
404 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  46.79 
 
 
404 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  46.79 
 
 
404 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  45.82 
 
 
421 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  45.82 
 
 
407 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  48.03 
 
 
380 aa  337  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  46.53 
 
 
404 aa  336  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>