More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2122 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  81.55 
 
 		 401 aa  668    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  100 
 
 		 401 aa  822    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  77.92 
 
 		 400 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  81.55 
 
 		 401 aa  668    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  76.26 
 
 		 400 aa  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  74.69 
 
 		 402 aa  628  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  74.19 
 
 		 399 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  74.81 
 
 		 398 aa  610  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  63.97 
 
 		 404 aa  518  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  64.14 
 
 		 389 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  64.4 
 
 		 389 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  63.87 
 
 		 389 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  63.75 
 
 		 396 aa  510  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  63.02 
 
 		 391 aa  500  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  64.14 
 
 		 394 aa  500  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  61.46 
 
 		 391 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  63.59 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  61.21 
 
 		 393 aa  495  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  60.1 
 
 		 391 aa  494  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  62.89 
 
 		 384 aa  491  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  60.99 
 
 		 407 aa  485  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  60.21 
 
 		 388 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  59.64 
 
 		 402 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  59.54 
 
 		 402 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  59.44 
 
 		 397 aa  472  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  58.59 
 
 		 404 aa  460  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  56.73 
 
 		 386 aa  449  1e-125  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  57.44 
 
 		 400 aa  450  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  58.95 
 
 		 402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  59.64 
 
 		 400 aa  441  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  57.37 
 
 		 400 aa  441  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  56.4 
 
 		 388 aa  439  9.999999999999999e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  56.05 
 
 		 396 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  56.48 
 
 		 387 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  55.75 
 
 		 388 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  55.7 
 
 		 387 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  59.42 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  56.66 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  53.89 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  54.38 
 
 		 410 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  53.45 
 
 		 407 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  53.28 
 
 		 399 aa  403  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  52.63 
 
 		 384 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  55.47 
 
 		 379 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  52.62 
 
 		 414 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  53.35 
 
 		 407 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  50.77 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  52.65 
 
 		 384 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  53.66 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  53.66 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  51.71 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  56.58 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  52.65 
 
 		 392 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  51.58 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  51.58 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  53.14 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  50.65 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  51.71 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  51.31 
 
 		 400 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  51.81 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  50.13 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  50.53 
 
 		 382 aa  375  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  52.74 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  49.22 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  52.07 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  50.63 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  49.21 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  52.76 
 
 		 378 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  49.87 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  49.6 
 
 		 382 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  48.35 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  49.87 
 
 		 409 aa  363  4e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  48.84 
 
 		 393 aa  362  6e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  50.4 
 
 		 386 aa  362  8e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  50.27 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  46.84 
 
 		 403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  53.17 
 
 		 380 aa  354  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  46.46 
 
 		 394 aa  353  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  48.49 
 
 		 405 aa  352  5e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  49.22 
 
 		 403 aa  350  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  44.06 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  49.36 
 
 		 395 aa  347  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  46.07 
 
 		 383 aa  342  5e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  47.12 
 
 		 383 aa  342  5.999999999999999e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  49.61 
 
 		 388 aa  339  5e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  45.89 
 
 		 410 aa  338  9.999999999999999e-92  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  45.13 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  46.49 
 
 		 417 aa  336  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  49.47 
 
 		 1139 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  47.36 
 
 		 406 aa  335  5.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  47.36 
 
 		 407 aa  335  7e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  48.56 
 
 		 408 aa  335  7e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  45.69 
 
 		 405 aa  334  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  49.18 
 
 		 1143 aa  333  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  46.58 
 
 		 407 aa  333  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  45.57 
 
 		 407 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  46.58 
 
 		 421 aa  333  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  45.32 
 
 		 407 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  47.81 
 
 		 404 aa  333  4e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  46.48 
 
 		 436 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>