More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1075 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  100 
 
 		 384 aa  795    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  66.58 
 
 		 396 aa  551  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  65.27 
 
 		 404 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  63.35 
 
 		 393 aa  530  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  65.27 
 
 		 394 aa  527  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  63.02 
 
 		 400 aa  524  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  63.09 
 
 		 407 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  60.89 
 
 		 402 aa  506  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  60.05 
 
 		 400 aa  500  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  61.78 
 
 		 399 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  60.21 
 
 		 389 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  61.4 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  60.42 
 
 		 402 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  60.57 
 
 		 402 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  61.46 
 
 		 398 aa  489  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  60.69 
 
 		 397 aa  484  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  61.98 
 
 		 401 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  60.05 
 
 		 404 aa  487  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  61.98 
 
 		 401 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  60.73 
 
 		 391 aa  484  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  60.47 
 
 		 388 aa  482  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  62.89 
 
 		 401 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  60.73 
 
 		 389 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  59.38 
 
 		 391 aa  478  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  60.99 
 
 		 389 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  60.36 
 
 		 400 aa  478  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  58.59 
 
 		 391 aa  477  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  57.96 
 
 		 386 aa  476  1e-133  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  58.75 
 
 		 400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  57.44 
 
 		 402 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  57.81 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  53.65 
 
 		 388 aa  437  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  58.64 
 
 		 404 aa  430  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  56.48 
 
 		 387 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  55.96 
 
 		 388 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  55.7 
 
 		 387 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  52.6 
 
 		 392 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  52.49 
 
 		 384 aa  408  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  56.66 
 
 		 404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  50.65 
 
 		 400 aa  401  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  55.12 
 
 		 410 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  51.7 
 
 		 396 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  51.97 
 
 		 384 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  55.79 
 
 		 407 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  55.38 
 
 		 407 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  52.62 
 
 		 399 aa  397  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  50.26 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  55.12 
 
 		 397 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  51.56 
 
 		 382 aa  391  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  52.48 
 
 		 390 aa  388  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  51.31 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  48.95 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  49.87 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  50.26 
 
 		 396 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  50 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  50 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  54.12 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  51.05 
 
 		 396 aa  381  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  52 
 
 		 379 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  48.96 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  51.46 
 
 		 378 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  48.03 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  50.52 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  49.74 
 
 		 398 aa  381  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  48.44 
 
 		 388 aa  381  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  48.69 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  49.61 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  48.83 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  47.63 
 
 		 382 aa  365  1e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  48.43 
 
 		 393 aa  363  3e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  46.89 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  50.13 
 
 		 409 aa  358  7e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  46.63 
 
 		 401 aa  358  9.999999999999999e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  49.1 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  45.74 
 
 		 401 aa  355  6.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  46.35 
 
 		 398 aa  352  5e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  47.37 
 
 		 403 aa  349  4e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  45.43 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  45.31 
 
 		 401 aa  345  7e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  46.86 
 
 		 388 aa  344  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  45.81 
 
 		 386 aa  343  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  47.2 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  44.79 
 
 		 398 aa  342  5.999999999999999e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  46.19 
 
 		 396 aa  341  1e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  46.48 
 
 		 405 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  46.48 
 
 		 405 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  46.68 
 
 		 380 aa  341  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  47.26 
 
 		 407 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1164  cysteine desulfurase IscS  46.77 
 
 		 402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000196201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  48.08 
 
 		 395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  47.12 
 
 		 380 aa  339  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  47.52 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  48.09 
 
 		 1143 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  46.21 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  45.13 
 
 		 403 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  47.52 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  47.52 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  45.76 
 
 		 405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  47.26 
 
 		 407 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>