More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4262 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  100 
 
 		 395 aa  783    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  89.82 
 
 		 409 aa  724    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  64.47 
 
 		 398 aa  505  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  58.06 
 
 		 394 aa  472  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  60.51 
 
 		 388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  56.56 
 
 		 384 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  55.84 
 
 		 389 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  55.53 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  54.06 
 
 		 394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  53.94 
 
 		 400 aa  443  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  56.63 
 
 		 398 aa  444  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  54.5 
 
 		 392 aa  440  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  58.16 
 
 		 388 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  54.2 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  55.5 
 
 		 396 aa  437  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  52.79 
 
 		 393 aa  429  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  51.78 
 
 		 404 aa  431  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  52.79 
 
 		 396 aa  427  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  54.34 
 
 		 392 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  55.87 
 
 		 399 aa  427  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  52.69 
 
 		 398 aa  425  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  53.32 
 
 		 402 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  53.59 
 
 		 403 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  53.28 
 
 		 398 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  53.28 
 
 		 398 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  53.32 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  54.85 
 
 		 392 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  52.28 
 
 		 393 aa  414  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  53.09 
 
 		 382 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  53.57 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  53.98 
 
 		 404 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  53.96 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  51.16 
 
 		 383 aa  391  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  50.64 
 
 		 383 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  46.67 
 
 		 382 aa  385  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  50.13 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  51.93 
 
 		 379 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  51.79 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  51.28 
 
 		 394 aa  381  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  50.13 
 
 		 381 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  51.16 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.26 
 
 		 388 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  52.94 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  51.41 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.98 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  49.36 
 
 		 417 aa  363  4e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  48.58 
 
 		 381 aa  360  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  49.23 
 
 		 403 aa  358  6e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  48.32 
 
 		 381 aa  358  7e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  48.32 
 
 		 381 aa  358  8e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  49.87 
 
 		 403 aa  358  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  48.32 
 
 		 381 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  50.38 
 
 		 403 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  50.13 
 
 		 380 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  48.72 
 
 		 405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  48.98 
 
 		 407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  50.38 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  48.98 
 
 		 407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  50.38 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  48.32 
 
 		 381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  49.23 
 
 		 407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  49.23 
 
 		 407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  49.23 
 
 		 407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  49.23 
 
 		 407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  49.23 
 
 		 407 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  46.19 
 
 		 402 aa  355  7.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  48.98 
 
 		 407 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  48.72 
 
 		 407 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  48.98 
 
 		 407 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  48.06 
 
 		 381 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  48.06 
 
 		 381 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  48.06 
 
 		 381 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  48.98 
 
 		 407 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  47.83 
 
 		 393 aa  354  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  47.53 
 
 		 381 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  48.84 
 
 		 401 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  48.33 
 
 		 389 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  48.98 
 
 		 407 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  48.47 
 
 		 400 aa  354  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  48.72 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  48.72 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  48.72 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  48.99 
 
 		 389 aa  352  5e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  47.29 
 
 		 381 aa  352  8e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  47.74 
 
 		 405 aa  351  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  50.51 
 
 		 408 aa  350  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  50.25 
 
 		 405 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  47.57 
 
 		 391 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  48.08 
 
 		 384 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  47.7 
 
 		 407 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  47.03 
 
 		 381 aa  350  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  47.84 
 
 		 388 aa  349  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  50.25 
 
 		 422 aa  349  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  47.96 
 
 		 406 aa  348  9e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  47.72 
 
 		 507 aa  348  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  47.56 
 
 		 401 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  47.31 
 
 		 407 aa  347  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  47.7 
 
 		 407 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  47.56 
 
 		 401 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.18 
 
 		 398 aa  346  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>