More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2015 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  80.56 
 
 		 391 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  80.56 
 
 		 391 aa  665    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  80.88 
 
 		 389 aa  672    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  79.38 
 
 		 389 aa  653    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  85.05 
 
 		 388 aa  698    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  79.84 
 
 		 389 aa  658    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  100 
 
 		 391 aa  804    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  67.45 
 
 		 393 aa  552  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  67.28 
 
 		 396 aa  537  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  65.97 
 
 		 404 aa  529  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  66.49 
 
 		 394 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  65.1 
 
 		 400 aa  525  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  61.54 
 
 		 407 aa  522  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  62.76 
 
 		 402 aa  501  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  61.15 
 
 		 400 aa  500  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  60.84 
 
 		 402 aa  498  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  62.14 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  63.06 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  59.29 
 
 		 400 aa  498  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  59.95 
 
 		 399 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  60.26 
 
 		 398 aa  489  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  59.69 
 
 		 401 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  59.69 
 
 		 401 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  60.26 
 
 		 386 aa  488  1e-136  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  60.73 
 
 		 384 aa  484  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  60.1 
 
 		 401 aa  484  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  59.63 
 
 		 402 aa  481  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  58.81 
 
 		 402 aa  475  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  60.16 
 
 		 400 aa  463  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  57.03 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  55.09 
 
 		 400 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  54.36 
 
 		 387 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  53.59 
 
 		 387 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  58.95 
 
 		 404 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  53.33 
 
 		 388 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  50.79 
 
 		 388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  56.15 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  57.44 
 
 		 404 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  49.74 
 
 		 396 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  56.02 
 
 		 410 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  48.83 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  53.95 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  48.84 
 
 		 398 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  53.28 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  49.35 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  47.51 
 
 		 384 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  49.22 
 
 		 414 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  49.1 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  50.53 
 
 		 379 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  48.18 
 
 		 398 aa  376  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  47.24 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  45.78 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  47.55 
 
 		 392 aa  368  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  48.47 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  46.92 
 
 		 398 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  46.92 
 
 		 398 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  47.14 
 
 		 394 aa  364  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  46.72 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  46.84 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  47.27 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  47.91 
 
 		 404 aa  359  5e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  48.44 
 
 		 399 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  47.92 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  46.51 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  47.12 
 
 		 393 aa  355  5e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  45.97 
 
 		 388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  46.32 
 
 		 382 aa  353  4e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  48.69 
 
 		 390 aa  351  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  50 
 
 		 378 aa  348  7e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  48.09 
 
 		 409 aa  348  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  45.29 
 
 		 393 aa  347  3e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  46.37 
 
 		 394 aa  345  7e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  47 
 
 		 382 aa  343  2e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  49.22 
 
 		 392 aa  341  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  47.24 
 
 		 388 aa  340  4e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  47.03 
 
 		 394 aa  339  5e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  44.33 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  46.28 
 
 		 394 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  48.09 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  43.31 
 
 		 389 aa  333  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  44.33 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1770  NifS family cysteine desulfurase  44.36 
 
 		 396 aa  332  9e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.406981  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  44.7 
 
 		 507 aa  331  1e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  46.23 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  45.6 
 
 		 401 aa  330  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  46.23 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  45.97 
 
 		 403 aa  329  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  43.04 
 
 		 396 aa  329  7e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  45.43 
 
 		 403 aa  328  7e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  43.44 
 
 		 403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  46.13 
 
 		 401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  45.97 
 
 		 403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0042  NifS family cysteine desulfurase  43.04 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2008  aminotransferase, class V  43.46 
 
 		 404 aa  326  3e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.475663  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  43.12 
 
 		 398 aa  323  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  44.13 
 
 		 502 aa  322  6e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  42.97 
 
 		 397 aa  322  6e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  43.3 
 
 		 405 aa  322  7e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1486  cysteine desulfurase/aminotransferase, IscS/NifS family  43.46 
 
 		 392 aa  322  9.000000000000001e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  44.18 
 
 		 380 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>