More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1486 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1486  cysteine desulfurase/aminotransferase, IscS/NifS family  100 
 
 		 392 aa  808    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0291  cysteine desulfurase  84.91 
 
 		 393 aa  695    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0265  cysteine desulfurase, putative  84.4 
 
 		 393 aa  694    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0238  putative cysteine desulfurase  83.63 
 
 		 393 aa  687    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1770  NifS family cysteine desulfurase  70.18 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.406981  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0042  NifS family cysteine desulfurase  70.51 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1696  cysteine desulfurase  68.72 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  70 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  67.44 
 
 		 396 aa  567  1e-161  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2008  aminotransferase, class V  60.1 
 
 		 404 aa  483  1e-135  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.475663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  45.67 
 
 		 407 aa  341  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  44.01 
 
 		 393 aa  341  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  43.98 
 
 		 389 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  44.88 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  44.36 
 
 		 384 aa  322  6e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  43.46 
 
 		 391 aa  322  9.000000000000001e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  44.62 
 
 		 400 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  43.46 
 
 		 389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  43.04 
 
 		 404 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  43.46 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  44.16 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  41.41 
 
 		 391 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  45.85 
 
 		 386 aa  317  3e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  42.45 
 
 		 391 aa  316  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  43.46 
 
 		 388 aa  316  5e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  43.9 
 
 		 400 aa  315  6e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  43.83 
 
 		 394 aa  315  9e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  41.99 
 
 		 396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  43.9 
 
 		 400 aa  312  7.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  43.7 
 
 		 402 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.73 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  41.54 
 
 		 392 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  42.26 
 
 		 402 aa  310  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  42.56 
 
 		 382 aa  310  2e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.22 
 
 		 404 aa  309  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  43.46 
 
 		 384 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  42.26 
 
 		 401 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  42.26 
 
 		 401 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  42.56 
 
 		 384 aa  306  6e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  43.83 
 
 		 402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  41.93 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.24 
 
 		 396 aa  302  5.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  43.68 
 
 		 397 aa  301  9e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  41.73 
 
 		 399 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  42.26 
 
 		 401 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  41.56 
 
 		 394 aa  297  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  40.73 
 
 		 404 aa  296  3e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  40.62 
 
 		 405 aa  295  7e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  42.82 
 
 		 388 aa  295  9e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.99 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  39.9 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  43.98 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  39.68 
 
 		 379 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  42.12 
 
 		 387 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  42.56 
 
 		 387 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  43.9 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  39.74 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  42.93 
 
 		 410 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  41.88 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  40.84 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  39.79 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  39.9 
 
 		 389 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  38.7 
 
 		 398 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  38.7 
 
 		 398 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  41.62 
 
 		 407 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  41.09 
 
 		 392 aa  285  8e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  39.9 
 
 		 398 aa  285  9e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  42.01 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  39.27 
 
 		 399 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  40.05 
 
 		 388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  40.52 
 
 		 398 aa  280  3e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  38.87 
 
 		 396 aa  280  4e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  39.32 
 
 		 393 aa  280  4e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  40.31 
 
 		 392 aa  279  6e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  37.86 
 
 		 414 aa  279  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  41.71 
 
 		 400 aa  279  7e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  39.04 
 
 		 417 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  40.1 
 
 		 388 aa  278  2e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  40.1 
 
 		 403 aa  276  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  39.06 
 
 		 382 aa  275  7e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  37.63 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  40 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  40.27 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  39.15 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  38.32 
 
 		 388 aa  272  6e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  41.56 
 
 		 404 aa  272  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  39.28 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  39.69 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  38.23 
 
 		 405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  39.51 
 
 		 1143 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  40.36 
 
 		 402 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  38.17 
 
 		 405 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  39.95 
 
 		 402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  38.92 
 
 		 396 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  38.48 
 
 		 407 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  38.77 
 
 		 1139 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  37.72 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.38 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  37.72 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  38.4 
 
 		 507 aa  264  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>