More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1583 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  92.74 
 
 		 1143 aa  2083    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  100 
 
 		 1139 aa  2312    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  65.32 
 
 		 1135 aa  1491    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  44.21 
 
 		 711 aa  625  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  50.4 
 
 		 388 aa  368  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  48.42 
 
 		 392 aa  369  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  49.06 
 
 		 382 aa  367  1e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  52.15 
 
 		 394 aa  365  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  50.27 
 
 		 399 aa  364  4e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  48.01 
 
 		 400 aa  361  4e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  47.59 
 
 		 398 aa  359  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  48.94 
 
 		 392 aa  358  2.9999999999999997e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  47.87 
 
 		 384 aa  358  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  47.11 
 
 		 394 aa  356  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  47.87 
 
 		 384 aa  354  5e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  50.26 
 
 		 379 aa  353  8e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  47.33 
 
 		 394 aa  353  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  47.04 
 
 		 398 aa  350  1e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  47.04 
 
 		 398 aa  350  1e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  50.52 
 
 		 409 aa  347  7e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  50 
 
 		 390 aa  347  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  48.29 
 
 		 404 aa  343  7e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  45.48 
 
 		 396 aa  342  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  49.73 
 
 		 398 aa  342  2.9999999999999998e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  45.87 
 
 		 404 aa  341  4e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  52.03 
 
 		 395 aa  341  5e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  45.99 
 
 		 396 aa  340  9e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  46.01 
 
 		 386 aa  340  9e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  47.63 
 
 		 400 aa  340  9e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  46.21 
 
 		 396 aa  340  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  44.76 
 
 		 414 aa  339  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  46.13 
 
 		 393 aa  338  3.9999999999999995e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  46.54 
 
 		 384 aa  338  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  45.16 
 
 		 383 aa  337  7.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  47.62 
 
 		 399 aa  337  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  45.43 
 
 		 398 aa  336  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  50.26 
 
 		 401 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  44.92 
 
 		 393 aa  336  2e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  45.19 
 
 		 394 aa  336  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  46.58 
 
 		 398 aa  335  3e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.24 
 
 		 400 aa  334  5e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  47.23 
 
 		 392 aa  333  1e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  47.34 
 
 		 394 aa  332  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  44.89 
 
 		 402 aa  332  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  47.71 
 
 		 400 aa  330  7e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  32.2 
 
 		 744 aa  330  9e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  31.73 
 
 		 698 aa  330  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  46.36 
 
 		 393 aa  330  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  32.48 
 
 		 749 aa  328  3e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  46.51 
 
 		 383 aa  328  4.0000000000000003e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  47.04 
 
 		 383 aa  328  5e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  49.2 
 
 		 388 aa  327  7e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  45.31 
 
 		 402 aa  327  7e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  46.4 
 
 		 389 aa  327  9e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  48.41 
 
 		 401 aa  327  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  48.41 
 
 		 401 aa  327  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  46.26 
 
 		 397 aa  325  3e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  32.41 
 
 		 747 aa  324  7e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  46.54 
 
 		 401 aa  323  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  41.55 
 
 		 382 aa  323  9.999999999999999e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  45.26 
 
 		 396 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  43.01 
 
 		 386 aa  322  1.9999999999999998e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  44.97 
 
 		 391 aa  322  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  42.51 
 
 		 388 aa  322  3e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  32.16 
 
 		 761 aa  321  6e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  32.69 
 
 		 692 aa  320  7.999999999999999e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  44.76 
 
 		 389 aa  320  9e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  45.28 
 
 		 389 aa  320  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.01 
 
 		 398 aa  320  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 407 aa  320  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  45.01 
 
 		 389 aa  319  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  33.58 
 
 		 694 aa  319  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  42.86 
 
 		 391 aa  317  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0546  aminotransferase class V  51.77 
 
 		 400 aa  316  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0396718  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  47.04 
 
 		 402 aa  316  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  45.19 
 
 		 380 aa  315  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  45.95 
 
 		 381 aa  314  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  43.51 
 
 		 381 aa  314  5.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  46.58 
 
 		 383 aa  313  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  44.06 
 
 		 401 aa  313  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  45.69 
 
 		 400 aa  312  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  44.74 
 
 		 398 aa  312  2.9999999999999997e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  43.65 
 
 		 403 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  44.85 
 
 		 401 aa  311  4e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  43.17 
 
 		 381 aa  311  5e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  43.72 
 
 		 381 aa  310  9e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  43.67 
 
 		 381 aa  310  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  48.22 
 
 		 380 aa  310  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  43.44 
 
 		 381 aa  310  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  42.9 
 
 		 381 aa  309  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  42.67 
 
 		 388 aa  309  2.0000000000000002e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  42.9 
 
 		 381 aa  308  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  47.25 
 
 		 382 aa  308  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21090  cysteine desulfurase family protein  47.79 
 
 		 392 aa  308  4.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  30.6 
 
 		 729 aa  307  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  44 
 
 		 398 aa  307  7e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  43.17 
 
 		 381 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  43.17 
 
 		 381 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  46.05 
 
 		 382 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  43.04 
 
 		 391 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>