More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2701 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  100 
 
 		 692 aa  1433    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  63.5 
 
 		 685 aa  901    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  32.52 
 
 		 729 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  32.72 
 
 		 698 aa  352  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  31.87 
 
 		 700 aa  337  3.9999999999999995e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  32.69 
 
 		 1139 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  31.63 
 
 		 1135 aa  318  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  31.04 
 
 		 891 aa  316  8e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  30.7 
 
 		 726 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  30.81 
 
 		 711 aa  312  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  30.45 
 
 		 1055 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  31.81 
 
 		 1143 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  28.98 
 
 		 745 aa  301  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  28.2 
 
 		 747 aa  296  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  30.22 
 
 		 731 aa  293  8e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  29.35 
 
 		 694 aa  291  4e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  31.53 
 
 		 739 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  28.47 
 
 		 749 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  28.27 
 
 		 761 aa  263  6.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  29.18 
 
 		 695 aa  262  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  27.27 
 
 		 791 aa  256  7e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  26.7 
 
 		 747 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  28.9 
 
 		 722 aa  250  6e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.26 
 
 		 688 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.34 
 
 		 677 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  27.74 
 
 		 753 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  26.01 
 
 		 760 aa  244  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  26.53 
 
 		 760 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.41 
 
 		 724 aa  244  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.95 
 
 		 685 aa  244  5e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  28.34 
 
 		 737 aa  243  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  28.51 
 
 		 794 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  29.55 
 
 		 691 aa  243  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  29.55 
 
 		 691 aa  243  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  29.55 
 
 		 691 aa  243  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  26.42 
 
 		 776 aa  242  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.98 
 
 		 893 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  28.93 
 
 		 698 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  26.84 
 
 		 687 aa  238  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  28.25 
 
 		 691 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  28.63 
 
 		 698 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.05 
 
 		 688 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.26 
 
 		 900 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.9 
 
 		 668 aa  235  3e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  29.32 
 
 		 691 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  28.45 
 
 		 698 aa  234  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  27.73 
 
 		 691 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  27.31 
 
 		 899 aa  232  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.57 
 
 		 879 aa  232  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  27.54 
 
 		 744 aa  232  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  26.18 
 
 		 760 aa  231  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  27.81 
 
 		 745 aa  231  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  28.63 
 
 		 691 aa  231  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  27.99 
 
 		 691 aa  231  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  27.99 
 
 		 691 aa  231  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.55 
 
 		 920 aa  231  4e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  28.4 
 
 		 691 aa  230  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  28.11 
 
 		 756 aa  229  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.84 
 
 		 686 aa  228  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.7 
 
 		 687 aa  228  3e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.75 
 
 		 674 aa  228  4e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  25.76 
 
 		 777 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.57 
 
 		 893 aa  226  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.68 
 
 		 933 aa  226  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.47 
 
 		 893 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  28.09 
 
 		 750 aa  226  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.4 
 
 		 688 aa  225  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  28.61 
 
 		 670 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.68 
 
 		 674 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  27.39 
 
 		 692 aa  225  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  25.69 
 
 		 758 aa  224  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  26.94 
 
 		 738 aa  224  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.84 
 
 		 676 aa  224  6e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.7 
 
 		 676 aa  224  6e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.56 
 
 		 676 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.53 
 
 		 886 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  27.44 
 
 		 703 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  25.04 
 
 		 760 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.28 
 
 		 674 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  24.4 
 
 		 764 aa  220  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  24.22 
 
 		 764 aa  220  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.47 
 
 		 674 aa  220  7e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  26.74 
 
 		 737 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.22 
 
 		 917 aa  219  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  24.4 
 
 		 764 aa  219  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  25.83 
 
 		 756 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  24.61 
 
 		 760 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.79 
 
 		 963 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.53 
 
 		 927 aa  218  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.89 
 
 		 688 aa  218  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  26.76 
 
 		 739 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.93 
 
 		 689 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  26.93 
 
 		 692 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  26.74 
 
 		 791 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  24.47 
 
 		 764 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.21 
 
 		 988 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  26.56 
 
 		 759 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  24.36 
 
 		 764 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.77 
 
 		 989 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  28.06 
 
 		 673 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>