More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2375 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  45.38 
 
 
776 aa  656    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  57.2 
 
 
744 aa  930    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  58.25 
 
 
756 aa  938    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  46.93 
 
 
755 aa  674    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  45.01 
 
 
753 aa  647    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
747 aa  1561    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  45.32 
 
 
791 aa  681    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  46.06 
 
 
777 aa  629  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  43.97 
 
 
794 aa  628  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  34.85 
 
 
729 aa  405  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  32 
 
 
698 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  33.02 
 
 
739 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  31.91 
 
 
745 aa  351  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  33.91 
 
 
700 aa  342  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  31.82 
 
 
747 aa  340  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  31.51 
 
 
726 aa  316  9e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  31.82 
 
 
891 aa  313  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  33.04 
 
 
711 aa  310  6.999999999999999e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  28.76 
 
 
791 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  30.25 
 
 
1055 aa  301  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  30.35 
 
 
1139 aa  292  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  31.8 
 
 
1135 aa  290  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  29.55 
 
 
1143 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  30.35 
 
 
731 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  29.74 
 
 
749 aa  281  5e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  29.32 
 
 
734 aa  269  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  29.45 
 
 
694 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  29.28 
 
 
761 aa  264  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  26.7 
 
 
692 aa  253  8.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  28.32 
 
 
803 aa  252  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  29.16 
 
 
701 aa  248  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  28.16 
 
 
709 aa  247  6e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  27.72 
 
 
718 aa  247  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  29.05 
 
 
703 aa  246  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  27.51 
 
 
718 aa  246  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  27.51 
 
 
718 aa  246  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  29.32 
 
 
688 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  28.72 
 
 
691 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  28.72 
 
 
691 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  28.72 
 
 
691 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  28.63 
 
 
698 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  28.59 
 
 
691 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  28.22 
 
 
691 aa  238  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  28.35 
 
 
698 aa  238  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  29.54 
 
 
698 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  27.4 
 
 
685 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  28.67 
 
 
691 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  28.04 
 
 
728 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  28.17 
 
 
703 aa  235  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  28.65 
 
 
690 aa  234  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  28.85 
 
 
691 aa  233  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  28.46 
 
 
697 aa  232  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  29.15 
 
 
708 aa  231  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  29.05 
 
 
692 aa  230  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  28.38 
 
 
670 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  28.9 
 
 
708 aa  228  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  28.24 
 
 
691 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  28.24 
 
 
691 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  28.21 
 
 
692 aa  226  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  26.34 
 
 
666 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  28.59 
 
 
684 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  27.06 
 
 
720 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  26.86 
 
 
726 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  26.86 
 
 
726 aa  219  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  27.52 
 
 
691 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  26.81 
 
 
726 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  28.51 
 
 
692 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  27.49 
 
 
730 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  28.26 
 
 
712 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  27.72 
 
 
739 aa  213  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  27.66 
 
 
692 aa  213  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  27.09 
 
 
691 aa  211  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  27.21 
 
 
907 aa  210  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  27.84 
 
 
732 aa  210  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  26.52 
 
 
731 aa  207  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.41 
 
 
942 aa  207  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  28.12 
 
 
722 aa  207  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  26.34 
 
 
727 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2788  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.58 
 
 
792 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.64 
 
 
759 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2900  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.58 
 
 
792 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735186  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.5 
 
 
759 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.29 
 
 
759 aa  205  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.38 
 
 
676 aa  204  4e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2725  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.46 
 
 
792 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  27.19 
 
 
674 aa  204  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  25.13 
 
 
763 aa  204  5e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.6 
 
 
759 aa  204  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  27.17 
 
 
731 aa  203  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.27 
 
 
879 aa  202  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.94 
 
 
724 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  26.96 
 
 
759 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  26.12 
 
 
703 aa  201  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  26.1 
 
 
674 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2769  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.58 
 
 
792 aa  201  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  27.16 
 
 
673 aa  201  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  27.54 
 
 
898 aa  201  6e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2682  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.58 
 
 
792 aa  201  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.21 
 
 
685 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.56 
 
 
676 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>