More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0104 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 
724 aa  1499    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.71 
 
 
879 aa  620  1e-176  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.45 
 
 
677 aa  595  1e-169  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.23 
 
 
893 aa  586  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.71 
 
 
893 aa  576  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.47 
 
 
893 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.83 
 
 
917 aa  574  1.0000000000000001e-162  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  42.13 
 
 
713 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.38 
 
 
898 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.44 
 
 
676 aa  572  1e-161  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.15 
 
 
676 aa  568  1e-161  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.05 
 
 
676 aa  569  1e-161  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  41.83 
 
 
695 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  43.76 
 
 
745 aa  563  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.64 
 
 
674 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.26 
 
 
945 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.98 
 
 
900 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.5 
 
 
674 aa  560  1e-158  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.35 
 
 
674 aa  558  1e-158  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  43.15 
 
 
899 aa  561  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.03 
 
 
688 aa  555  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  41.91 
 
 
687 aa  555  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  42.03 
 
 
689 aa  553  1e-156  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.01 
 
 
901 aa  555  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.13 
 
 
674 aa  552  1e-156  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.86 
 
 
688 aa  549  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.51 
 
 
904 aa  549  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.55 
 
 
688 aa  547  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.94 
 
 
723 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.49 
 
 
685 aa  547  1e-154  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.16 
 
 
716 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.47 
 
 
927 aa  543  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.59 
 
 
715 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.57 
 
 
937 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  41.59 
 
 
715 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.59 
 
 
689 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  41.59 
 
 
715 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  41.45 
 
 
715 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.45 
 
 
715 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.25 
 
 
925 aa  536  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.59 
 
 
886 aa  536  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1383  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.29 
 
 
716 aa  537  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.627092  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.79 
 
 
687 aa  537  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  41.45 
 
 
715 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.01 
 
 
716 aa  534  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.58 
 
 
688 aa  531  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.71 
 
 
716 aa  530  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.26 
 
 
1440 aa  527  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  41.58 
 
 
715 aa  528  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  41.44 
 
 
715 aa  525  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.5 
 
 
905 aa  526  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.08 
 
 
1406 aa  523  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.29 
 
 
715 aa  524  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.68 
 
 
668 aa  523  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.21 
 
 
1428 aa  521  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.78 
 
 
933 aa  521  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  39.6 
 
 
716 aa  520  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.5 
 
 
686 aa  522  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.29 
 
 
920 aa  521  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.69 
 
 
1421 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.97 
 
 
1425 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.06 
 
 
957 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.81 
 
 
1424 aa  515  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.24 
 
 
911 aa  514  1e-144  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.02 
 
 
1410 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.69 
 
 
1425 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.65 
 
 
900 aa  514  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.18 
 
 
1432 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.55 
 
 
1432 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.54 
 
 
1432 aa  514  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.94 
 
 
989 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.2 
 
 
988 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.69 
 
 
1425 aa  512  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.89 
 
 
989 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.77 
 
 
1440 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.89 
 
 
718 aa  509  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.14 
 
 
988 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.2 
 
 
988 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.58 
 
 
955 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.66 
 
 
963 aa  507  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.73 
 
 
906 aa  507  9.999999999999999e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.09 
 
 
686 aa  504  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.2 
 
 
989 aa  500  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.04 
 
 
685 aa  501  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.2 
 
 
989 aa  500  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.84 
 
 
924 aa  500  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.13 
 
 
961 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.1 
 
 
963 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3269  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.79 
 
 
942 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.68 
 
 
924 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0997  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.46 
 
 
953 aa  488  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.46 
 
 
903 aa  483  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2823  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.31 
 
 
949 aa  484  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156592  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  39.51 
 
 
1385 aa  483  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.9 
 
 
979 aa  482  1e-134  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.83 
 
 
754 aa  479  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  38.69 
 
 
1387 aa  477  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  38.67 
 
 
1412 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.48 
 
 
929 aa  478  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.06 
 
 
994 aa  478  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>