More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2227 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 891 aa  1839    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  39.1 
 
 		 729 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  37.92 
 
 		 745 aa  492  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  38.83 
 
 		 747 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  36.45 
 
 		 726 aa  422  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  36.84 
 
 		 731 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  33.83 
 
 		 739 aa  345  2e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  31.97 
 
 		 777 aa  342  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  32.93 
 
 		 698 aa  341  5e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  31.51 
 
 		 753 aa  334  5e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  33.06 
 
 		 744 aa  330  7e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  30.34 
 
 		 1055 aa  318  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  31.04 
 
 		 692 aa  316  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  33.15 
 
 		 700 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  31.82 
 
 		 747 aa  313  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  31.67 
 
 		 685 aa  313  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  31.49 
 
 		 794 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  29.54 
 
 		 776 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  31.61 
 
 		 756 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  31.41 
 
 		 1139 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  29.25 
 
 		 791 aa  272  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  30.91 
 
 		 1143 aa  271  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  29.86 
 
 		 711 aa  269  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  30.17 
 
 		 1135 aa  267  5.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  30.64 
 
 		 755 aa  266  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  27.67 
 
 		 734 aa  264  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  31.37 
 
 		 722 aa  263  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  32.54 
 
 		 791 aa  261  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  30.65 
 
 		 691 aa  258  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  30.65 
 
 		 691 aa  258  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  30.65 
 
 		 691 aa  258  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  29.24 
 
 		 749 aa  255  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  30.46 
 
 		 691 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  30.51 
 
 		 691 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  30.28 
 
 		 703 aa  253  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  29.44 
 
 		 691 aa  251  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  30.07 
 
 		 698 aa  250  7e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  29.8 
 
 		 698 aa  248  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  27.64 
 
 		 694 aa  247  4.9999999999999997e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  30.28 
 
 		 730 aa  247  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  30.14 
 
 		 691 aa  245  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  29.76 
 
 		 691 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  29.76 
 
 		 691 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  28.4 
 
 		 692 aa  242  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  29.99 
 
 		 691 aa  241  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  29.61 
 
 		 688 aa  238  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  28.03 
 
 		 758 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  28.17 
 
 		 758 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  30.43 
 
 		 670 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  28.98 
 
 		 692 aa  234  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  27.89 
 
 		 758 aa  234  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  27.61 
 
 		 666 aa  234  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  27.75 
 
 		 758 aa  234  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  28.86 
 
 		 695 aa  234  8.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  27.75 
 
 		 758 aa  233  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  28.82 
 
 		 690 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  29.55 
 
 		 695 aa  231  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  28.55 
 
 		 692 aa  231  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  28.12 
 
 		 695 aa  230  8e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  30.56 
 
 		 759 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  29.28 
 
 		 673 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  29.29 
 
 		 709 aa  229  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  29.29 
 
 		 703 aa  228  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.79 
 
 		 685 aa  225  3e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  28.55 
 
 		 688 aa  224  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  27.65 
 
 		 761 aa  223  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  28.84 
 
 		 731 aa  222  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.81 
 
 		 679 aa  221  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  28.41 
 
 		 684 aa  220  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  26.01 
 
 		 760 aa  220  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  25.82 
 
 		 764 aa  218  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  29.06 
 
 		 750 aa  218  5e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2725  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.69 
 
 		 792 aa  217  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  25.82 
 
 		 764 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  28.38 
 
 		 695 aa  218  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  28.47 
 
 		 673 aa  217  8e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  26.73 
 
 		 760 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2682  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.69 
 
 		 792 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  27.64 
 
 		 739 aa  216  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  29.12 
 
 		 692 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  25.85 
 
 		 764 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  29.05 
 
 		 728 aa  215  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  28.8 
 
 		 697 aa  215  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2900  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.43 
 
 		 792 aa  215  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2788  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.43 
 
 		 792 aa  215  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  28.97 
 
 		 700 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  27.95 
 
 		 671 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.81 
 
 		 893 aa  214  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  27.93 
 
 		 694 aa  214  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  27.08 
 
 		 691 aa  213  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  28.36 
 
 		 668 aa  213  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  25.63 
 
 		 754 aa  213  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  28.82 
 
 		 680 aa  213  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  29.27 
 
 		 688 aa  213  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  29.13 
 
 		 688 aa  213  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.53 
 
 		 893 aa  212  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  26.69 
 
 		 760 aa  211  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  26.41 
 
 		 760 aa  211  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2769  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.6 
 
 		 792 aa  211  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  27.95 
 
 		 698 aa  210  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>