More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2401 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  56.07 
 
 		 764 aa  911    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  56.46 
 
 		 760 aa  916    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  99.6 
 
 		 758 aa  1573    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  55.8 
 
 		 760 aa  904    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  55.94 
 
 		 760 aa  912    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  56.2 
 
 		 764 aa  919    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  56.2 
 
 		 764 aa  919    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  56.33 
 
 		 760 aa  922    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  55.8 
 
 		 764 aa  911    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  54.81 
 
 		 760 aa  880    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  53.33 
 
 		 756 aa  825    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  100 
 
 		 758 aa  1580    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  99.87 
 
 		 758 aa  1578    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  99.21 
 
 		 758 aa  1572    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  56.86 
 
 		 760 aa  918    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  56.46 
 
 		 758 aa  917    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  99.34 
 
 		 758 aa  1572    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  55.94 
 
 		 764 aa  910    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  40.18 
 
 		 761 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  41.25 
 
 		 764 aa  592  1e-167  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  38.61 
 
 		 757 aa  570  1e-161  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  38.87 
 
 		 754 aa  569  1e-161  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  35.35 
 
 		 695 aa  418  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  35.09 
 
 		 722 aa  408  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  32.37 
 
 		 730 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  33.15 
 
 		 731 aa  378  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  32.63 
 
 		 759 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  32.1 
 
 		 698 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  33 
 
 		 695 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  33.47 
 
 		 738 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  32 
 
 		 700 aa  353  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  33.29 
 
 		 739 aa  350  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  33.47 
 
 		 737 aa  349  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  30.25 
 
 		 695 aa  336  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  29.67 
 
 		 750 aa  332  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  30.62 
 
 		 731 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1076  thiosulfate reductase, putative  31.97 
 
 		 708 aa  330  7e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0345  nitrate reductase  31.28 
 
 		 731 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213856  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1667  Formate dehydrogenase  30.15 
 
 		 704 aa  316  9e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.982617  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  28.1 
 
 		 807 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  29.35 
 
 		 729 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  31.08 
 
 		 744 aa  302  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  30.38 
 
 		 731 aa  299  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  29.87 
 
 		 733 aa  281  3e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  28.89 
 
 		 731 aa  280  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  28.97 
 
 		 747 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  29.93 
 
 		 720 aa  277  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  29.4 
 
 		 741 aa  272  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  29.48 
 
 		 738 aa  270  7e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  29.01 
 
 		 739 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  27.87 
 
 		 747 aa  264  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  30.23 
 
 		 739 aa  261  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  28.04 
 
 		 745 aa  258  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27.51 
 
 		 734 aa  256  9e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  28.31 
 
 		 732 aa  243  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  29.03 
 
 		 729 aa  239  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  27.89 
 
 		 891 aa  237  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  28.07 
 
 		 812 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  26.71 
 
 		 685 aa  233  9e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  27.79 
 
 		 1143 aa  232  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  27.89 
 
 		 1139 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  26.53 
 
 		 791 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  28.47 
 
 		 1135 aa  222  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  27.51 
 
 		 711 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  28.21 
 
 		 749 aa  215  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 		 698 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  25.74 
 
 		 843 aa  212  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  26.28 
 
 		 833 aa  211  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  24.3 
 
 		 692 aa  210  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  27.25 
 
 		 711 aa  209  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  27.38 
 
 		 739 aa  206  9e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  26.54 
 
 		 879 aa  205  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0171  molybdopterin oxidoreductase  27.97 
 
 		 709 aa  204  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.662613  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  26.09 
 
 		 837 aa  204  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  25.9 
 
 		 734 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  26.87 
 
 		 700 aa  201  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  25.29 
 
 		 726 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  26.62 
 
 		 731 aa  201  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1386  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE  26.6 
 
 		 799 aa  200  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  26.78 
 
 		 879 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  25.49 
 
 		 855 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.67 
 
 		 808 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2043  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  26.67 
 
 		 808 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  27.07 
 
 		 777 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1613  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  26.79 
 
 		 808 aa  197  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01556  oxidoreductase subunit  26.67 
 
 		 808 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56782  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.99 
 
 		 685 aa  196  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01546  hypothetical protein  26.67 
 
 		 808 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838194  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  26.05 
 
 		 756 aa  195  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  26.33 
 
 		 747 aa  194  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0922  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain A  25.71 
 
 		 816 aa  194  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1773  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  25.96 
 
 		 808 aa  193  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1570  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain A  26.98 
 
 		 774 aa  193  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3394  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.71 
 
 		 816 aa  193  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1660  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  26.94 
 
 		 808 aa  192  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1794  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  26.67 
 
 		 808 aa  192  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2547  molybdopterin oxidoreductase  26.19 
 
 		 711 aa  192  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00181061  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3261  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.9 
 
 		 816 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  25.24 
 
 		 744 aa  192  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2725  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.02 
 
 		 792 aa  190  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>