More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2741 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  61.04 
 
 		 692 aa  782    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  69.86 
 
 		 692 aa  1009    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  90.4 
 
 		 698 aa  1310    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  57.49 
 
 		 690 aa  795    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  79.31 
 
 		 703 aa  1142    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  70.97 
 
 		 691 aa  1021    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  70.91 
 
 		 691 aa  1032    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  69.57 
 
 		 692 aa  1009    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  70 
 
 		 691 aa  1003    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  60.55 
 
 		 703 aa  841    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  63.04 
 
 		 705 aa  875    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  70.14 
 
 		 692 aa  1015    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  79.25 
 
 		 701 aa  1160    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  70.33 
 
 		 691 aa  1011    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  61.67 
 
 		 727 aa  863    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  64.41 
 
 		 688 aa  894    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 698 aa  1434    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  70.33 
 
 		 691 aa  1017    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  70.33 
 
 		 691 aa  1011    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  62.95 
 
 		 707 aa  830    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  70.71 
 
 		 691 aa  1028    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  64.87 
 
 		 694 aa  895    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  64.41 
 
 		 688 aa  895    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  64.48 
 
 		 688 aa  889    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  65.22 
 
 		 680 aa  891    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  62.41 
 
 		 695 aa  841    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  70.97 
 
 		 691 aa  1021    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  70.97 
 
 		 691 aa  1021    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  69.99 
 
 		 670 aa  981    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  98.71 
 
 		 698 aa  1416    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  70.33 
 
 		 691 aa  1010    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  45.68 
 
 		 708 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  44.77 
 
 		 708 aa  605  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  47.26 
 
 		 684 aa  596  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  43.3 
 
 		 726 aa  588  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  42.96 
 
 		 726 aa  588  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  42.96 
 
 		 726 aa  586  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  43.04 
 
 		 720 aa  571  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  43 
 
 		 728 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  42.25 
 
 		 710 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  42.86 
 
 		 718 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  42.72 
 
 		 718 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  42.72 
 
 		 718 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  42.76 
 
 		 712 aa  558  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  43.92 
 
 		 673 aa  553  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  39.7 
 
 		 709 aa  533  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  42.47 
 
 		 674 aa  524  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  41.51 
 
 		 674 aa  513  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  42.26 
 
 		 688 aa  514  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  43.04 
 
 		 697 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  42.67 
 
 		 679 aa  511  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  42.06 
 
 		 703 aa  504  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  42.36 
 
 		 671 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  41.1 
 
 		 662 aa  488  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  37.55 
 
 		 734 aa  488  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  41.7 
 
 		 693 aa  481  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  41.35 
 
 		 676 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  40.29 
 
 		 671 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  41.29 
 
 		 668 aa  478  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  40.43 
 
 		 668 aa  477  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  41.24 
 
 		 666 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  38.78 
 
 		 669 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  40.55 
 
 		 667 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  40.84 
 
 		 667 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  40.55 
 
 		 667 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  38.51 
 
 		 689 aa  411  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4362  molybdopterin oxidoreductase  39.38 
 
 		 699 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4922  molybdopterin oxidoreductase  38.2 
 
 		 700 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400406  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  37.8 
 
 		 708 aa  399  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  37.06 
 
 		 712 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  35.77 
 
 		 695 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  39.31 
 
 		 679 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  36.14 
 
 		 734 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  36.01 
 
 		 703 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  34.9 
 
 		 677 aa  391  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3302  molybdopterin oxidoreductase  35.44 
 
 		 697 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1053  molybdopterin oxidoreductase  35.92 
 
 		 701 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  33.43 
 
 		 733 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  33.57 
 
 		 733 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  35.93 
 
 		 703 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  35.4 
 
 		 704 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  35.81 
 
 		 708 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.81 
 
 		 708 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  35.79 
 
 		 706 aa  372  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  35.55 
 
 		 702 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  36.15 
 
 		 703 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  33.99 
 
 		 693 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  35.04 
 
 		 710 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  34.65 
 
 		 720 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  31.46 
 
 		 666 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  29.57 
 
 		 763 aa  346  8e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  31.77 
 
 		 763 aa  340  4e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  32.18 
 
 		 737 aa  340  5e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  30.7 
 
 		 738 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  32.48 
 
 		 737 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  31.55 
 
 		 647 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  30.79 
 
 		 732 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  29.05 
 
 		 669 aa  302  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0064  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  28.88 
 
 		 635 aa  299  1e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  30.84 
 
 		 673 aa  298  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>