More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18490 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  100 
 
 		 763 aa  1600    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  34.08 
 
 		 734 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  34.9 
 
 		 728 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  34.9 
 
 		 718 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  34.63 
 
 		 718 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  34.63 
 
 		 718 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  34.12 
 
 		 708 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  35.06 
 
 		 691 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  33.66 
 
 		 708 aa  372  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  33.14 
 
 		 688 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  34.32 
 
 		 691 aa  363  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  34.32 
 
 		 691 aa  363  6e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  34.32 
 
 		 691 aa  363  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  33.85 
 
 		 703 aa  363  9e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  32.91 
 
 		 690 aa  358  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  31.43 
 
 		 673 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  32.57 
 
 		 691 aa  353  8e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  32.57 
 
 		 691 aa  353  8e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  32.86 
 
 		 691 aa  353  8.999999999999999e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  32.67 
 
 		 697 aa  352  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  32.54 
 
 		 703 aa  351  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  32.42 
 
 		 691 aa  350  6e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  32.61 
 
 		 691 aa  349  9e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  31.81 
 
 		 684 aa  349  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  32.81 
 
 		 691 aa  348  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  32.28 
 
 		 709 aa  342  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  32.06 
 
 		 698 aa  342  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  32.65 
 
 		 670 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  31.77 
 
 		 698 aa  339  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  31.68 
 
 		 692 aa  334  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  31.68 
 
 		 674 aa  333  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  31.35 
 
 		 727 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  31.64 
 
 		 710 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  31.32 
 
 		 720 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  31.15 
 
 		 763 aa  329  1.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  30.42 
 
 		 701 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  30.77 
 
 		 692 aa  328  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  30.48 
 
 		 733 aa  326  9e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  31.25 
 
 		 692 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  30.5 
 
 		 692 aa  325  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  31.21 
 
 		 705 aa  325  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  31.82 
 
 		 688 aa  324  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  30.93 
 
 		 698 aa  324  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  29.83 
 
 		 733 aa  323  7e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  30.99 
 
 		 712 aa  320  6e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  32.14 
 
 		 695 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  30.26 
 
 		 726 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  30.54 
 
 		 726 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  31.77 
 
 		 703 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  29.85 
 
 		 726 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  30.67 
 
 		 688 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  30.56 
 
 		 688 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  29.69 
 
 		 738 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  30.17 
 
 		 694 aa  300  8e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  30.95 
 
 		 707 aa  299  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  29.51 
 
 		 662 aa  297  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  28.84 
 
 		 737 aa  294  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  31.86 
 
 		 680 aa  293  8e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  29.77 
 
 		 679 aa  293  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  30.99 
 
 		 676 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.97 
 
 		 671 aa  290  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  29.55 
 
 		 737 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  29.81 
 
 		 674 aa  286  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  29.62 
 
 		 671 aa  282  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  27.22 
 
 		 693 aa  277  5e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  28.76 
 
 		 666 aa  273  9e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  29.02 
 
 		 668 aa  269  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  29.49 
 
 		 667 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  29.02 
 
 		 667 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  28.88 
 
 		 667 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  28.49 
 
 		 668 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  27.88 
 
 		 666 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  27.21 
 
 		 669 aa  251  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  27.71 
 
 		 677 aa  251  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0064  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  26.88 
 
 		 635 aa  249  2e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  26.46 
 
 		 693 aa  243  7.999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  27.17 
 
 		 706 aa  241  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  28.17 
 
 		 679 aa  241  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  26.59 
 
 		 703 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  29.42 
 
 		 751 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  26.76 
 
 		 695 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  27.88 
 
 		 732 aa  239  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  27.68 
 
 		 708 aa  237  7e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  27.38 
 
 		 708 aa  236  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  27.19 
 
 		 710 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.92 
 
 		 759 aa  235  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  27.99 
 
 		 677 aa  233  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.49 
 
 		 759 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.49 
 
 		 759 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.49 
 
 		 759 aa  231  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  28.55 
 
 		 743 aa  230  7e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  27.85 
 
 		 673 aa  224  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  26.45 
 
 		 702 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  27.58 
 
 		 758 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  26.18 
 
 		 703 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  26.51 
 
 		 712 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  23.29 
 
 		 662 aa  220  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  26.47 
 
 		 720 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  25.58 
 
 		 647 aa  219  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  28.36 
 
 		 704 aa  219  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>