More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1518 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1799  molybdopterin oxidoreductase  96.53 
 
 
662 aa  1317    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
662 aa  1357    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  41.42 
 
 
669 aa  495  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  35.77 
 
 
666 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  33.09 
 
 
668 aa  388  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  32.09 
 
 
673 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2933  Nitrate reductase  32.04 
 
 
677 aa  362  1e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.529596  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1215  Nitrate reductase  34.26 
 
 
643 aa  354  4e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0607485  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  29.3 
 
 
678 aa  315  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0550  Nitrate reductase  30.94 
 
 
680 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  28.87 
 
 
947 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  28.94 
 
 
732 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  28.44 
 
 
759 aa  303  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  28.29 
 
 
759 aa  303  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  28.34 
 
 
759 aa  303  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  28.14 
 
 
759 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2242  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  28.82 
 
 
750 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.514414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  28.49 
 
 
743 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  28.59 
 
 
654 aa  292  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  28.94 
 
 
758 aa  292  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3449  molybdopterin oxidoreductase  28.14 
 
 
650 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  27.89 
 
 
751 aa  279  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  27.06 
 
 
684 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3195  molybdopterin oxidoreductase  28.01 
 
 
637 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  27.77 
 
 
692 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  28.77 
 
 
691 aa  272  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  27.22 
 
 
691 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  27.5 
 
 
708 aa  263  8.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  26.98 
 
 
691 aa  261  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  26.35 
 
 
673 aa  261  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  26.98 
 
 
691 aa  261  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  26.98 
 
 
691 aa  261  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  26.83 
 
 
691 aa  259  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  26.55 
 
 
688 aa  259  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  30.04 
 
 
734 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  28.45 
 
 
677 aa  258  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1523  molybdopterin oxidoreductase  25.94 
 
 
642 aa  256  6e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0753  Nitrate reductase  27.04 
 
 
639 aa  256  9e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  25.21 
 
 
698 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  26.56 
 
 
703 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0448  molybdopterin oxidoreductase  26.82 
 
 
661 aa  254  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  26.6 
 
 
691 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  26.02 
 
 
691 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  26.89 
 
 
670 aa  253  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  25.57 
 
 
698 aa  253  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  26.04 
 
 
691 aa  252  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  26.13 
 
 
690 aa  251  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  25.9 
 
 
692 aa  250  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  25.71 
 
 
698 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  26.5 
 
 
691 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  26.5 
 
 
691 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  26.18 
 
 
708 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  26.49 
 
 
701 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  26.11 
 
 
688 aa  245  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  25.95 
 
 
703 aa  243  7e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  25.33 
 
 
674 aa  239  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  25.88 
 
 
697 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  26.01 
 
 
712 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  25.47 
 
 
692 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  25.56 
 
 
720 aa  237  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  25.59 
 
 
662 aa  234  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  24.93 
 
 
679 aa  234  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0177  molybdopterin oxidoreductase  27.87 
 
 
633 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2090  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 
645 aa  233  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0064  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  29.53 
 
 
635 aa  232  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  25.91 
 
 
709 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  28.77 
 
 
718 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  28.72 
 
 
726 aa  228  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  26.07 
 
 
676 aa  227  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  24.34 
 
 
688 aa  227  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  28.55 
 
 
726 aa  226  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  28.42 
 
 
718 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  24.34 
 
 
688 aa  226  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  28.42 
 
 
718 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  25.64 
 
 
703 aa  223  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  25.11 
 
 
694 aa  223  7e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  25.58 
 
 
693 aa  223  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  27.84 
 
 
726 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  25.52 
 
 
710 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.29 
 
 
763 aa  221  5e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  26.06 
 
 
671 aa  220  7.999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.7 
 
 
671 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  25.07 
 
 
692 aa  219  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  24.46 
 
 
674 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  25.03 
 
 
728 aa  216  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2348  molybdopterin oxidoreductase  28.81 
 
 
663 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.316134  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  24.53 
 
 
727 aa  214  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1026  molybdopterin oxidoreductase  27.86 
 
 
630 aa  213  7.999999999999999e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0299626 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  25.63 
 
 
693 aa  213  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  24.67 
 
 
666 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0478  molybdopterin oxidoreductase  26.63 
 
 
670 aa  210  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  26.4 
 
 
738 aa  207  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  24.42 
 
 
695 aa  206  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  26.7 
 
 
737 aa  205  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  25.52 
 
 
680 aa  204  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  24.78 
 
 
705 aa  203  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  25.63 
 
 
647 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  24.92 
 
 
708 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  27.03 
 
 
677 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  26.47 
 
 
729 aa  200  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>