More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1523 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0448  molybdopterin oxidoreductase  57.19 
 
 
661 aa  722    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468926 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1523  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
642 aa  1301    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2090  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  48.34 
 
 
645 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3195  molybdopterin oxidoreductase  47.48 
 
 
637 aa  572  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0177  molybdopterin oxidoreductase  47.34 
 
 
633 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0753  Nitrate reductase  43.01 
 
 
639 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  33.07 
 
 
654 aa  291  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  30.68 
 
 
669 aa  287  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  29.44 
 
 
666 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  33.13 
 
 
947 aa  280  7e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2933  Nitrate reductase  33.83 
 
 
677 aa  278  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.529596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3449  molybdopterin oxidoreductase  31.35 
 
 
650 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  30.93 
 
 
673 aa  259  8e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  25.94 
 
 
662 aa  256  6e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  29.13 
 
 
668 aa  251  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1799  molybdopterin oxidoreductase  26.7 
 
 
662 aa  247  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1215  Nitrate reductase  28.39 
 
 
643 aa  242  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0607485  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  30.06 
 
 
674 aa  220  7e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  29.99 
 
 
684 aa  213  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  28.28 
 
 
678 aa  206  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  29.67 
 
 
674 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  28.91 
 
 
679 aa  204  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  28.93 
 
 
673 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  27.18 
 
 
691 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  27.87 
 
 
692 aa  191  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  29.61 
 
 
677 aa  191  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  28.78 
 
 
727 aa  191  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  28.51 
 
 
662 aa  191  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  28.35 
 
 
703 aa  187  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  28.91 
 
 
693 aa  186  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  28.28 
 
 
691 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  28.91 
 
 
694 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.6 
 
 
759 aa  183  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.6 
 
 
759 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.6 
 
 
759 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.44 
 
 
759 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  27.23 
 
 
691 aa  179  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  26.79 
 
 
692 aa  178  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  26.79 
 
 
691 aa  178  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  27.8 
 
 
688 aa  177  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  27.91 
 
 
698 aa  177  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  27.66 
 
 
688 aa  177  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.18 
 
 
671 aa  176  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  26.88 
 
 
669 aa  177  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  26.87 
 
 
692 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  27.63 
 
 
698 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  28.51 
 
 
667 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  26.65 
 
 
691 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  28.35 
 
 
708 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  27.01 
 
 
676 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  28.02 
 
 
695 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  22.72 
 
 
732 aa  174  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  28.87 
 
 
667 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  27.75 
 
 
698 aa  173  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  28.09 
 
 
688 aa  173  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  27.87 
 
 
701 aa  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 
690 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  26.53 
 
 
703 aa  171  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  26.69 
 
 
691 aa  170  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  26.69 
 
 
691 aa  170  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  26.83 
 
 
691 aa  170  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  30.01 
 
 
666 aa  170  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0064  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  24.89 
 
 
635 aa  170  7e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  27 
 
 
671 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 
718 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 
718 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 
718 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0550  Nitrate reductase  28.77 
 
 
680 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  26.72 
 
 
691 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  26.72 
 
 
691 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  26.72 
 
 
691 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  24.34 
 
 
758 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  27.19 
 
 
670 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  28.2 
 
 
708 aa  166  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  26.18 
 
 
705 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  27.96 
 
 
667 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  30.23 
 
 
703 aa  164  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  25.68 
 
 
743 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  30.55 
 
 
680 aa  162  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  29.25 
 
 
677 aa  161  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  26.87 
 
 
693 aa  160  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  26.85 
 
 
751 aa  160  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.17 
 
 
686 aa  160  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  26.38 
 
 
726 aa  157  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  29.21 
 
 
707 aa  157  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1026  molybdopterin oxidoreductase  27.99 
 
 
630 aa  156  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0299626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1053  molybdopterin oxidoreductase  26.45 
 
 
701 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62402  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  29.9 
 
 
697 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  23.53 
 
 
709 aa  155  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  27.44 
 
 
712 aa  154  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  27.32 
 
 
720 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  26.58 
 
 
668 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0478  molybdopterin oxidoreductase  26.64 
 
 
670 aa  153  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  25.8 
 
 
728 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2070  molydopterin dinucleotide-binding region  28.67 
 
 
618 aa  150  5e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.360567  normal  0.0416579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2242  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  23.58 
 
 
750 aa  150  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.514414  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3302  molybdopterin oxidoreductase  26.91 
 
 
697 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  25.76 
 
 
726 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  27.04 
 
 
668 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  25.95 
 
 
726 aa  148  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>