More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0753 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0753  Nitrate reductase  100 
 
 
639 aa  1306    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3195  molybdopterin oxidoreductase  44.81 
 
 
637 aa  508  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0177  molybdopterin oxidoreductase  44.19 
 
 
633 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1523  molybdopterin oxidoreductase  43.01 
 
 
642 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2090  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  40.94 
 
 
645 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0448  molybdopterin oxidoreductase  38.76 
 
 
661 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  32.06 
 
 
654 aa  273  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  28.7 
 
 
666 aa  272  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  27.04 
 
 
662 aa  256  8e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1799  molybdopterin oxidoreductase  27 
 
 
662 aa  251  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  30.42 
 
 
668 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1215  Nitrate reductase  27.72 
 
 
643 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0607485  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3449  molybdopterin oxidoreductase  29.31 
 
 
650 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  25.15 
 
 
669 aa  234  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  27.94 
 
 
947 aa  226  9e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  28.57 
 
 
691 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  28.36 
 
 
673 aa  220  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2933  Nitrate reductase  29.97 
 
 
677 aa  216  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.529596  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  28.74 
 
 
698 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  29.85 
 
 
662 aa  213  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  25.54 
 
 
732 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  27.87 
 
 
684 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  26.79 
 
 
677 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  27.55 
 
 
698 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  27.6 
 
 
698 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  28.84 
 
 
679 aa  200  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  27.3 
 
 
674 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  28.45 
 
 
701 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  26.45 
 
 
673 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  28.45 
 
 
691 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  28.11 
 
 
692 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  28.45 
 
 
691 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  28.45 
 
 
691 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  27.88 
 
 
703 aa  194  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  28.65 
 
 
727 aa  194  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  28.2 
 
 
691 aa  193  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  27.57 
 
 
692 aa  193  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  26.29 
 
 
703 aa  190  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  27.17 
 
 
691 aa  190  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  26.24 
 
 
688 aa  189  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  27.22 
 
 
674 aa  187  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  27.64 
 
 
703 aa  187  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  28.87 
 
 
695 aa  187  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  27.92 
 
 
691 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  27.58 
 
 
692 aa  187  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  28.61 
 
 
666 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  26.85 
 
 
697 aa  187  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  26.74 
 
 
678 aa  187  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  28.15 
 
 
705 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  26.92 
 
 
676 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  27.33 
 
 
692 aa  184  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0478  molybdopterin oxidoreductase  27.06 
 
 
670 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  24.38 
 
 
751 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  25.33 
 
 
743 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  28.03 
 
 
688 aa  182  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  27.13 
 
 
691 aa  181  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  25.46 
 
 
709 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  27.88 
 
 
688 aa  180  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  28.47 
 
 
688 aa  179  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0064  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  22.85 
 
 
635 aa  178  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  26.35 
 
 
669 aa  177  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  27.19 
 
 
693 aa  176  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  27.23 
 
 
691 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  27.23 
 
 
691 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  27.23 
 
 
691 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0550  Nitrate reductase  28.12 
 
 
680 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  27.99 
 
 
734 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  23.18 
 
 
758 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  28.3 
 
 
667 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  27.27 
 
 
694 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  25.52 
 
 
759 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  25.11 
 
 
759 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  28.11 
 
 
667 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2348  molybdopterin oxidoreductase  29.24 
 
 
663 aa  171  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.316134  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  25.26 
 
 
759 aa  170  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  24.96 
 
 
759 aa  170  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  25.31 
 
 
718 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  25.48 
 
 
690 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  25.31 
 
 
718 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  25.31 
 
 
718 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  25.25 
 
 
726 aa  169  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  24.71 
 
 
677 aa  169  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1026  molybdopterin oxidoreductase  29.44 
 
 
630 aa  167  4e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0299626 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  27.9 
 
 
667 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  26.97 
 
 
670 aa  165  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  27.43 
 
 
689 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  27.15 
 
 
679 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  29.6 
 
 
680 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  24.93 
 
 
726 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2242  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  22.95 
 
 
750 aa  163  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.514414  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  27.77 
 
 
708 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  27.43 
 
 
707 aa  162  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  24.79 
 
 
726 aa  160  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  25.92 
 
 
708 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  25.68 
 
 
671 aa  159  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  24.55 
 
 
668 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  25.96 
 
 
712 aa  157  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.67 
 
 
671 aa  157  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  25.07 
 
 
734 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4922  molybdopterin oxidoreductase  26.13 
 
 
700 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>