More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2325 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  58.3 
 
 
734 aa  830    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  57.96 
 
 
706 aa  821    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  58.26 
 
 
708 aa  810    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  57.1 
 
 
689 aa  762    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  62.5 
 
 
702 aa  911    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3302  molybdopterin oxidoreductase  60.09 
 
 
697 aa  863    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1053  molybdopterin oxidoreductase  61.01 
 
 
701 aa  885    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62402  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  62.48 
 
 
720 aa  926    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  63.39 
 
 
703 aa  916    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  63.08 
 
 
695 aa  918    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  64.24 
 
 
703 aa  921    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  62.15 
 
 
703 aa  869    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  58.41 
 
 
708 aa  814    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4362  molybdopterin oxidoreductase  65.04 
 
 
699 aa  900    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481133  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  59.02 
 
 
712 aa  837    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  57.21 
 
 
704 aa  810    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  58.03 
 
 
710 aa  813    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4922  molybdopterin oxidoreductase  64.99 
 
 
700 aa  898    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400406  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
708 aa  1451    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  59.41 
 
 
679 aa  764    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  42.88 
 
 
677 aa  531  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  39.89 
 
 
692 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  37.11 
 
 
690 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  37.39 
 
 
691 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  37.39 
 
 
691 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  37.39 
 
 
691 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  37.31 
 
 
698 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  37.98 
 
 
688 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  36.08 
 
 
662 aa  396  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  37.59 
 
 
691 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  38.12 
 
 
694 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  37.98 
 
 
688 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  38.03 
 
 
671 aa  392  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  39.56 
 
 
698 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  37.24 
 
 
698 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  37.85 
 
 
727 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  36.45 
 
 
691 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  37.61 
 
 
703 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  35.74 
 
 
691 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  35.46 
 
 
668 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  36.74 
 
 
679 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  36.08 
 
 
692 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  36.8 
 
 
668 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  35.66 
 
 
692 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  36.35 
 
 
692 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  36.38 
 
 
691 aa  385  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  38.26 
 
 
701 aa  382  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  36.66 
 
 
669 aa  382  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  36.1 
 
 
671 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  34.76 
 
 
726 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  35.42 
 
 
691 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  35.31 
 
 
693 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  37.3 
 
 
684 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  35.46 
 
 
691 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  35.46 
 
 
691 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  35.88 
 
 
676 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  36.36 
 
 
688 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  37.44 
 
 
667 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  35.32 
 
 
703 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  37.32 
 
 
667 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  37.62 
 
 
695 aa  372  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  37.13 
 
 
667 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  34.25 
 
 
674 aa  368  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  37.22 
 
 
680 aa  369  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  36.5 
 
 
666 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  36.27 
 
 
670 aa  364  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  33.29 
 
 
726 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  33.15 
 
 
726 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  35.65 
 
 
708 aa  363  8e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  33.05 
 
 
708 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  35.45 
 
 
703 aa  353  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  35.36 
 
 
707 aa  353  5.9999999999999994e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  35.02 
 
 
705 aa  350  4e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  32.91 
 
 
709 aa  347  4e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  32.91 
 
 
720 aa  347  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  35.12 
 
 
674 aa  345  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  35.4 
 
 
697 aa  341  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  31.54 
 
 
710 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  32.53 
 
 
712 aa  337  5e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  31.81 
 
 
728 aa  336  9e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  34.48 
 
 
688 aa  335  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  32.49 
 
 
718 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  32.35 
 
 
718 aa  332  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  32.35 
 
 
718 aa  332  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  33.72 
 
 
673 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  31.39 
 
 
693 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  29.15 
 
 
734 aa  296  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  28.65 
 
 
733 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  29.09 
 
 
737 aa  263  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  28.51 
 
 
733 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  28.11 
 
 
738 aa  261  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  28.47 
 
 
737 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  29.78 
 
 
732 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  27.99 
 
 
759 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  27.99 
 
 
759 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  27.85 
 
 
759 aa  234  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  27.85 
 
 
759 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  28.1 
 
 
743 aa  233  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2242  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  25.87 
 
 
750 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.514414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  28.85 
 
 
677 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>