More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0880 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  62.11 
 
 		 666 aa  803    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  100 
 
 		 671 aa  1358    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  78.39 
 
 		 671 aa  1090    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  54.79 
 
 		 662 aa  718    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  63.42 
 
 		 667 aa  814    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  59.52 
 
 		 669 aa  800    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  67.27 
 
 		 668 aa  921    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  63.27 
 
 		 667 aa  820    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  67.97 
 
 		 668 aa  917    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  62.97 
 
 		 667 aa  818    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  71.71 
 
 		 676 aa  994    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  44.61 
 
 		 691 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  45.63 
 
 		 691 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  44.9 
 
 		 691 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  44.9 
 
 		 691 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  44.41 
 
 		 691 aa  537  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  43.47 
 
 		 690 aa  531  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  44.61 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  43.09 
 
 		 692 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  43.88 
 
 		 691 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  43.64 
 
 		 691 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  43.88 
 
 		 691 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  43.88 
 
 		 691 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  44.33 
 
 		 697 aa  514  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  45.91 
 
 		 688 aa  512  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  44.85 
 
 		 703 aa  511  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  44.46 
 
 		 670 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  42.79 
 
 		 692 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  42.21 
 
 		 692 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  44.46 
 
 		 692 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  44.13 
 
 		 688 aa  489  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  44.13 
 
 		 688 aa  488  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  43.17 
 
 		 698 aa  486  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  42.36 
 
 		 698 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  43.11 
 
 		 703 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  42.51 
 
 		 701 aa  482  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  40.17 
 
 		 708 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  41.79 
 
 		 698 aa  482  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  39.02 
 
 		 708 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  42.22 
 
 		 684 aa  465  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  38.18 
 
 		 710 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  41.06 
 
 		 688 aa  463  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  38.2 
 
 		 726 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  38.2 
 
 		 726 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  42.02 
 
 		 694 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  41.68 
 
 		 679 aa  455  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  38.2 
 
 		 726 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  40.89 
 
 		 727 aa  448  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  40.21 
 
 		 705 aa  448  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  41.77 
 
 		 695 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  39.56 
 
 		 680 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  39.47 
 
 		 674 aa  436  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  37.32 
 
 		 720 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  39.79 
 
 		 674 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  37.36 
 
 		 709 aa  435  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  37.69 
 
 		 718 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  37.69 
 
 		 718 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  37.83 
 
 		 718 aa  436  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  39.16 
 
 		 703 aa  432  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  38.07 
 
 		 677 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  36.38 
 
 		 712 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  37.96 
 
 		 728 aa  432  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  40.17 
 
 		 707 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  39.26 
 
 		 673 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  38.91 
 
 		 693 aa  417  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  39.47 
 
 		 689 aa  398  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  38.24 
 
 		 703 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4922  molybdopterin oxidoreductase  38.02 
 
 		 700 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400406  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3302  molybdopterin oxidoreductase  35.79 
 
 		 697 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  38.03 
 
 		 708 aa  392  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  38.36 
 
 		 679 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  37.45 
 
 		 720 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  35.82 
 
 		 695 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  36.4 
 
 		 702 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  36.83 
 
 		 703 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  32.75 
 
 		 734 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4362  molybdopterin oxidoreductase  38.42 
 
 		 699 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  36.46 
 
 		 703 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  33.53 
 
 		 733 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  33.67 
 
 		 733 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1053  molybdopterin oxidoreductase  35.07 
 
 		 701 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  34.78 
 
 		 712 aa  362  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  34.09 
 
 		 704 aa  356  5.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  34.06 
 
 		 734 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.67 
 
 		 708 aa  348  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  33.52 
 
 		 708 aa  347  4e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  34.68 
 
 		 706 aa  342  9e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  33.57 
 
 		 737 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  33.09 
 
 		 710 aa  333  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  31.55 
 
 		 738 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  32.78 
 
 		 737 aa  327  5e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  32.05 
 
 		 693 aa  325  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  30.44 
 
 		 666 aa  319  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  28.45 
 
 		 763 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0064  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  29.43 
 
 		 635 aa  306  8.000000000000001e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  29.97 
 
 		 763 aa  289  1e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  33.29 
 
 		 678 aa  288  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  31.09 
 
 		 673 aa  270  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  30.86 
 
 		 677 aa  269  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  31.18 
 
 		 647 aa  269  1e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>