More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4032 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  62.84 
 
 
698 aa  871    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  63.57 
 
 
698 aa  878    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  65.31 
 
 
703 aa  903    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  63.61 
 
 
691 aa  875    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  60.09 
 
 
691 aa  839    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  62.61 
 
 
698 aa  873    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  52.75 
 
 
692 aa  678    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  62.34 
 
 
692 aa  862    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  63.21 
 
 
691 aa  862    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  60.55 
 
 
691 aa  844    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  77.07 
 
 
703 aa  1120    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
705 aa  1462    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  61.18 
 
 
692 aa  851    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  65.21 
 
 
701 aa  900    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  59.97 
 
 
691 aa  833    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  60.26 
 
 
691 aa  832    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  71.74 
 
 
727 aa  1024    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  60.5 
 
 
692 aa  839    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  60.4 
 
 
691 aa  843    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  59.97 
 
 
691 aa  833    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  74.56 
 
 
695 aa  1046    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  60.42 
 
 
670 aa  810    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  66.52 
 
 
707 aa  891    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  76.29 
 
 
688 aa  1083    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  75.52 
 
 
694 aa  1077    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  76.14 
 
 
688 aa  1082    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  74.75 
 
 
688 aa  1082    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  70.67 
 
 
680 aa  972    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  63.61 
 
 
691 aa  875    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  63.61 
 
 
691 aa  875    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  51.82 
 
 
690 aa  696    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  45.94 
 
 
684 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  43.52 
 
 
708 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  43.08 
 
 
708 aa  550  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  41.97 
 
 
726 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  42.72 
 
 
718 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  41.94 
 
 
726 aa  532  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  42.58 
 
 
718 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  42.38 
 
 
726 aa  531  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  42.58 
 
 
718 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  42.21 
 
 
673 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  41.31 
 
 
728 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  42.79 
 
 
674 aa  519  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  43.13 
 
 
688 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  43.08 
 
 
703 aa  514  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  42.82 
 
 
697 aa  510  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  40.83 
 
 
720 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  42 
 
 
679 aa  503  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  40.98 
 
 
712 aa  495  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  39.86 
 
 
710 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  39.42 
 
 
709 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  41.01 
 
 
674 aa  491  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  40.54 
 
 
693 aa  464  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  40.59 
 
 
662 aa  450  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  40.21 
 
 
671 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  38.39 
 
 
671 aa  438  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  38.03 
 
 
676 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  34.29 
 
 
734 aa  432  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  38.03 
 
 
668 aa  428  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  38.86 
 
 
666 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  39.97 
 
 
667 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  37.39 
 
 
668 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  39.59 
 
 
667 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  39.3 
 
 
667 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  35.99 
 
 
669 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  35.59 
 
 
677 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  38.16 
 
 
689 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  36.29 
 
 
710 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  34.25 
 
 
702 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  35.15 
 
 
720 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  34.19 
 
 
703 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4922  molybdopterin oxidoreductase  36.69 
 
 
700 aa  364  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400406  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4362  molybdopterin oxidoreductase  37.43 
 
 
699 aa  363  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481133  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  34.71 
 
 
712 aa  362  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  35.43 
 
 
703 aa  359  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  34.25 
 
 
695 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1053  molybdopterin oxidoreductase  34.29 
 
 
701 aa  356  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62402  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  37.16 
 
 
679 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  35.51 
 
 
706 aa  355  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  33.86 
 
 
704 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  35.02 
 
 
708 aa  350  4e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  33.78 
 
 
734 aa  350  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3302  molybdopterin oxidoreductase  32.95 
 
 
697 aa  349  8e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  33.72 
 
 
693 aa  349  1e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  34.01 
 
 
703 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.53 
 
 
708 aa  341  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  33.38 
 
 
708 aa  337  5e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  30.23 
 
 
733 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  31.51 
 
 
738 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  30.09 
 
 
733 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  31.21 
 
 
763 aa  325  2e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  29.44 
 
 
763 aa  324  4e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  32.07 
 
 
737 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  32.02 
 
 
737 aa  320  6e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  30.97 
 
 
666 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  30.03 
 
 
732 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  31.05 
 
 
647 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  31.88 
 
 
673 aa  272  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  29.96 
 
 
691 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2933  Nitrate reductase  31.73 
 
 
677 aa  265  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.529596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>