More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0450 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  79.59 
 
 		 692 aa  1155    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  92.02 
 
 		 691 aa  1316    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  59.91 
 
 		 707 aa  797    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  58.95 
 
 		 695 aa  796    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  78.18 
 
 		 692 aa  1135    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  70.04 
 
 		 698 aa  1006    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  68.64 
 
 		 703 aa  965    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  82.9 
 
 		 691 aa  1201    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  53.77 
 
 		 690 aa  736    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  91.9 
 
 		 691 aa  1326    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  59.31 
 
 		 727 aa  829    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  61.72 
 
 		 688 aa  856    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  93.05 
 
 		 691 aa  1328    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  81.28 
 
 		 691 aa  1174    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  60.35 
 
 		 703 aa  836    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  97.61 
 
 		 670 aa  1345    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  60.4 
 
 		 705 aa  843    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  78.18 
 
 		 692 aa  1132    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  69.74 
 
 		 701 aa  990    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  93.49 
 
 		 691 aa  1333    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  57.98 
 
 		 692 aa  742    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 691 aa  1416    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  93.49 
 
 		 691 aa  1333    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  70.33 
 
 		 698 aa  1006    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  61.34 
 
 		 694 aa  855    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  61.57 
 
 		 688 aa  855    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  63.38 
 
 		 688 aa  877    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  62.28 
 
 		 680 aa  843    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  82.9 
 
 		 691 aa  1201    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  82.9 
 
 		 691 aa  1201    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  70.48 
 
 		 698 aa  1019    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  48.61 
 
 		 684 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  42.88 
 
 		 726 aa  579  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  43.52 
 
 		 708 aa  578  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  43.4 
 
 		 708 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  42.88 
 
 		 726 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  42.92 
 
 		 718 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  42.92 
 
 		 718 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  42.64 
 
 		 718 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  42.36 
 
 		 728 aa  568  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  42.88 
 
 		 726 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  44.27 
 
 		 673 aa  556  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  41.54 
 
 		 709 aa  542  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  44.44 
 
 		 674 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  43.65 
 
 		 697 aa  535  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.61 
 
 		 671 aa  531  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  42.72 
 
 		 703 aa  532  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  43.08 
 
 		 688 aa  528  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  40.08 
 
 		 710 aa  527  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  40.17 
 
 		 720 aa  528  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  41.42 
 
 		 671 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  41.85 
 
 		 662 aa  506  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  38.87 
 
 		 712 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  41.94 
 
 		 674 aa  504  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  41.57 
 
 		 676 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  41.43 
 
 		 679 aa  501  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  41.08 
 
 		 693 aa  493  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  41.37 
 
 		 668 aa  487  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  35.63 
 
 		 734 aa  482  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  41.25 
 
 		 669 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  41.96 
 
 		 668 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  40.67 
 
 		 666 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  42.34 
 
 		 667 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  42.13 
 
 		 667 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  42.19 
 
 		 667 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  39.31 
 
 		 689 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  38.77 
 
 		 679 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  36.81 
 
 		 703 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  36.2 
 
 		 702 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4922  molybdopterin oxidoreductase  37.25 
 
 		 700 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400406  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  36.45 
 
 		 703 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3302  molybdopterin oxidoreductase  35.65 
 
 		 697 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  35.72 
 
 		 695 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  35.94 
 
 		 677 aa  391  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4362  molybdopterin oxidoreductase  37.78 
 
 		 699 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  36.45 
 
 		 708 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1053  molybdopterin oxidoreductase  35.57 
 
 		 701 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  35.23 
 
 		 712 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  36.09 
 
 		 720 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  36.76 
 
 		 708 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  35.61 
 
 		 703 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  34.3 
 
 		 734 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  36.55 
 
 		 708 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  35.82 
 
 		 706 aa  365  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  30.99 
 
 		 763 aa  363  6e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  31.3 
 
 		 733 aa  363  8e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  31.15 
 
 		 733 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  33.57 
 
 		 710 aa  359  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  33.61 
 
 		 704 aa  357  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  32.95 
 
 		 693 aa  352  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  32.76 
 
 		 763 aa  350  7e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  31.44 
 
 		 737 aa  346  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  30.32 
 
 		 738 aa  336  9e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  31.13 
 
 		 737 aa  333  6e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  32.87 
 
 		 732 aa  325  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  31.14 
 
 		 666 aa  323  6e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  32.27 
 
 		 673 aa  319  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  29.5 
 
 		 759 aa  301  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  29.36 
 
 		 759 aa  300  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  31.51 
 
 		 647 aa  300  8e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>