More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3416 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  56.76 
 
 		 726 aa  836    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  57.75 
 
 		 726 aa  852    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  84.4 
 
 		 708 aa  1265    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 708 aa  1465    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  54.24 
 
 		 709 aa  794    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  57.32 
 
 		 718 aa  840    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  57.14 
 
 		 712 aa  844    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  49.5 
 
 		 690 aa  685    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  57.32 
 
 		 718 aa  840    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  55.97 
 
 		 720 aa  844    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  57.75 
 
 		 718 aa  844    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  57.04 
 
 		 726 aa  838    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  56.76 
 
 		 728 aa  830    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  54.86 
 
 		 710 aa  822    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  46.92 
 
 		 703 aa  624  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  46.71 
 
 		 701 aa  615  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  45.54 
 
 		 698 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  46.15 
 
 		 698 aa  608  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  45.68 
 
 		 698 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  45.87 
 
 		 684 aa  589  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  45.87 
 
 		 727 aa  590  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  44.54 
 
 		 692 aa  586  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  44.16 
 
 		 691 aa  585  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  45.31 
 
 		 692 aa  586  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  44.46 
 
 		 691 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  44.4 
 
 		 691 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  45.01 
 
 		 691 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  44.46 
 
 		 691 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  44.46 
 
 		 691 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  44.11 
 
 		 691 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  44.11 
 
 		 691 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  44.26 
 
 		 691 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  43.97 
 
 		 694 aa  578  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  44.05 
 
 		 692 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  43.4 
 
 		 691 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  44.74 
 
 		 688 aa  578  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  44.19 
 
 		 692 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  43.61 
 
 		 673 aa  566  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  45.85 
 
 		 688 aa  567  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  43.75 
 
 		 688 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  43.61 
 
 		 688 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  44.66 
 
 		 703 aa  559  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  44.93 
 
 		 697 aa  559  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  43.52 
 
 		 705 aa  556  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  42.29 
 
 		 674 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  43 
 
 		 670 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  44.38 
 
 		 703 aa  553  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  42.19 
 
 		 680 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  42.78 
 
 		 707 aa  525  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  42.88 
 
 		 695 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  39.6 
 
 		 662 aa  495  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  39.02 
 
 		 671 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  36.95 
 
 		 734 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  37.03 
 
 		 679 aa  465  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  37.03 
 
 		 674 aa  458  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  38.12 
 
 		 668 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  37.34 
 
 		 671 aa  445  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  36.66 
 
 		 693 aa  444  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  37.43 
 
 		 676 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  38.12 
 
 		 668 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  36.79 
 
 		 666 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  37.2 
 
 		 667 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  37.05 
 
 		 667 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  36.87 
 
 		 667 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  35.34 
 
 		 669 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  34.12 
 
 		 763 aa  376  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  33.52 
 
 		 677 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  33.24 
 
 		 695 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  35.14 
 
 		 689 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  33.57 
 
 		 703 aa  360  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  33.72 
 
 		 720 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  33.05 
 
 		 708 aa  356  6.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  33.57 
 
 		 703 aa  353  5e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  32.48 
 
 		 693 aa  352  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  33.24 
 
 		 702 aa  349  9e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  33.24 
 
 		 666 aa  346  7e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4922  molybdopterin oxidoreductase  33.82 
 
 		 700 aa  346  8e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400406  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1053  molybdopterin oxidoreductase  32.02 
 
 		 701 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  32.16 
 
 		 706 aa  343  5e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3302  molybdopterin oxidoreductase  31.92 
 
 		 697 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  30.58 
 
 		 763 aa  341  2.9999999999999998e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  29.65 
 
 		 733 aa  340  4e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  29.51 
 
 		 733 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  34.07 
 
 		 679 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4362  molybdopterin oxidoreductase  33.87 
 
 		 699 aa  328  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  30.75 
 
 		 738 aa  323  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  31.44 
 
 		 737 aa  320  5e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  30.6 
 
 		 712 aa  320  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  30.76 
 
 		 734 aa  319  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  30.5 
 
 		 703 aa  317  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.74 
 
 		 708 aa  317  5e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  30.9 
 
 		 737 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0064  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  29.69 
 
 		 635 aa  315  1.9999999999999998e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  33.52 
 
 		 732 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  31.33 
 
 		 710 aa  315  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  30.59 
 
 		 708 aa  314  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  29.96 
 
 		 704 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3420  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  59.19 
 
 		 234 aa  301  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  32.27 
 
 		 673 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  30.89 
 
 		 678 aa  300  6e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>