More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0725 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  57.03 
 
 		 669 aa  749    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  67.97 
 
 		 671 aa  928    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  60.61 
 
 		 667 aa  800    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  65.28 
 
 		 671 aa  911    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  53.92 
 
 		 662 aa  704    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  94.31 
 
 		 668 aa  1300    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  60.91 
 
 		 667 aa  798    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  100 
 
 		 668 aa  1371    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  62.8 
 
 		 666 aa  822    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  60.61 
 
 		 667 aa  800    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  73.27 
 
 		 676 aa  1014    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  43.17 
 
 		 690 aa  526  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  42.48 
 
 		 692 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  42.52 
 
 		 691 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  41.75 
 
 		 691 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  42.54 
 
 		 691 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  41.75 
 
 		 691 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  41.75 
 
 		 691 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  41.51 
 
 		 691 aa  491  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  41.96 
 
 		 691 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  41.31 
 
 		 692 aa  487  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  41.43 
 
 		 691 aa  487  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  41.96 
 
 		 691 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  41.96 
 
 		 691 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  41.73 
 
 		 698 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  41.02 
 
 		 692 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  41.29 
 
 		 698 aa  485  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  41.15 
 
 		 698 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  41.46 
 
 		 688 aa  480  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  41.22 
 
 		 703 aa  478  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  41.48 
 
 		 692 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  40.23 
 
 		 697 aa  472  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  41.58 
 
 		 670 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  39.83 
 
 		 701 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  39.74 
 
 		 703 aa  458  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  41.3 
 
 		 679 aa  455  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  40.74 
 
 		 688 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  36.96 
 
 		 710 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  40.74 
 
 		 688 aa  445  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  38.93 
 
 		 684 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  38.12 
 
 		 708 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  38.54 
 
 		 708 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  38.79 
 
 		 694 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  39.35 
 
 		 688 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  37.54 
 
 		 677 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  39.5 
 
 		 727 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  36.13 
 
 		 726 aa  430  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  38.28 
 
 		 674 aa  426  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  36.86 
 
 		 720 aa  428  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  36.35 
 
 		 712 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  35.97 
 
 		 726 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  36.51 
 
 		 726 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  40 
 
 		 695 aa  425  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  35.88 
 
 		 709 aa  422  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  37.93 
 
 		 674 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  38.44 
 
 		 703 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  37.68 
 
 		 705 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  37.32 
 
 		 673 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  37.41 
 
 		 693 aa  408  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  36.59 
 
 		 680 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  36.31 
 
 		 718 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  35.3 
 
 		 695 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  36.56 
 
 		 702 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  36.55 
 
 		 720 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  36.31 
 
 		 703 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  36.03 
 
 		 718 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  36.03 
 
 		 718 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  35.54 
 
 		 728 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  36.64 
 
 		 703 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4362  molybdopterin oxidoreductase  37.86 
 
 		 699 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4922  molybdopterin oxidoreductase  36.92 
 
 		 700 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400406  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  36.61 
 
 		 708 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  37.81 
 
 		 689 aa  389  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  37.28 
 
 		 707 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3302  molybdopterin oxidoreductase  34.1 
 
 		 697 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1053  molybdopterin oxidoreductase  34.73 
 
 		 701 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  35.34 
 
 		 703 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  32.7 
 
 		 734 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  32.85 
 
 		 733 aa  362  9e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  32.7 
 
 		 733 aa  361  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  36.19 
 
 		 679 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  32.56 
 
 		 712 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  33.48 
 
 		 706 aa  353  7e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  31.69 
 
 		 734 aa  352  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  32.8 
 
 		 708 aa  347  5e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  32.8 
 
 		 708 aa  346  6e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  32.54 
 
 		 693 aa  343  5e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  31.74 
 
 		 704 aa  342  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  32.66 
 
 		 710 aa  337  5e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  31.11 
 
 		 738 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  32.32 
 
 		 737 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  32.13 
 
 		 737 aa  318  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  32.5 
 
 		 666 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  29.9 
 
 		 763 aa  304  3.0000000000000004e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  32.13 
 
 		 673 aa  282  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0064  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  28.55 
 
 		 635 aa  281  3e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  29.3 
 
 		 763 aa  273  6e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  30.93 
 
 		 647 aa  264  4.999999999999999e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  30.38 
 
 		 759 aa  263  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  30.53 
 
 		 759 aa  263  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>