More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1345 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
666 aa  1387    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  40.78 
 
 
669 aa  514  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  38.06 
 
 
668 aa  498  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  37.71 
 
 
673 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1799  molybdopterin oxidoreductase  36.31 
 
 
662 aa  438  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  35.77 
 
 
662 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2933  Nitrate reductase  36.14 
 
 
677 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.529596  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1215  Nitrate reductase  36.39 
 
 
643 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0607485  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3449  molybdopterin oxidoreductase  34.29 
 
 
650 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  33.85 
 
 
654 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  33.68 
 
 
947 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  33.82 
 
 
678 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  33.82 
 
 
690 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  32.08 
 
 
732 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  34.93 
 
 
688 aa  362  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  33.1 
 
 
708 aa  357  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  33.82 
 
 
691 aa  357  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  33.82 
 
 
691 aa  357  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  33.82 
 
 
691 aa  357  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  31.75 
 
 
759 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  33.38 
 
 
684 aa  354  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  34.49 
 
 
703 aa  355  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  33.57 
 
 
691 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  31.75 
 
 
759 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  33.09 
 
 
751 aa  353  5e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  31.9 
 
 
759 aa  353  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  31.61 
 
 
759 aa  353  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  31.5 
 
 
703 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  31.4 
 
 
698 aa  350  7e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  33.24 
 
 
708 aa  346  6e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  31.26 
 
 
698 aa  346  8e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  31.36 
 
 
698 aa  342  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  33.91 
 
 
697 aa  342  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  30.54 
 
 
701 aa  340  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2242  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  30.98 
 
 
750 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.514414  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  33.8 
 
 
728 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0550  Nitrate reductase  33.23 
 
 
680 aa  336  7.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  30.99 
 
 
758 aa  334  3e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  33.1 
 
 
718 aa  334  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  33.1 
 
 
718 aa  333  6e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  33.1 
 
 
718 aa  333  6e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  31.8 
 
 
691 aa  332  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  32.12 
 
 
691 aa  332  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  31.4 
 
 
691 aa  330  6e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  32.12 
 
 
688 aa  328  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  31.48 
 
 
692 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  29.96 
 
 
743 aa  327  5e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  31.73 
 
 
691 aa  327  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  31.73 
 
 
691 aa  327  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  31.87 
 
 
691 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  31.97 
 
 
688 aa  325  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  31.92 
 
 
709 aa  325  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  32.26 
 
 
692 aa  325  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  31.44 
 
 
688 aa  325  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  31.76 
 
 
734 aa  323  6e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  31.14 
 
 
691 aa  323  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  32.79 
 
 
662 aa  323  7e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.44 
 
 
671 aa  319  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  31.34 
 
 
692 aa  319  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  30.77 
 
 
692 aa  316  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  31.15 
 
 
670 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  31.47 
 
 
727 aa  313  9e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3195  molybdopterin oxidoreductase  30.43 
 
 
637 aa  310  4e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  31.91 
 
 
668 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  30.97 
 
 
705 aa  307  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  30.44 
 
 
720 aa  306  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  30.14 
 
 
694 aa  306  6e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  30.9 
 
 
712 aa  306  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  30.93 
 
 
671 aa  303  9e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  32.35 
 
 
668 aa  302  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  30.64 
 
 
693 aa  302  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  30.67 
 
 
726 aa  301  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  31.45 
 
 
695 aa  300  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0448  molybdopterin oxidoreductase  29.84 
 
 
661 aa  300  5e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  30.67 
 
 
726 aa  300  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  30.1 
 
 
726 aa  299  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  30.54 
 
 
710 aa  299  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  30.27 
 
 
673 aa  296  7e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  30.62 
 
 
676 aa  296  8e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  29.64 
 
 
677 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  31.14 
 
 
680 aa  293  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  30.26 
 
 
674 aa  291  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0177  molybdopterin oxidoreductase  31 
 
 
633 aa  290  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  29.2 
 
 
763 aa  290  5.0000000000000004e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  30.51 
 
 
679 aa  285  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1523  molybdopterin oxidoreductase  29.44 
 
 
642 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2348  molybdopterin oxidoreductase  29.41 
 
 
663 aa  281  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.316134  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  28.75 
 
 
737 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  31.04 
 
 
703 aa  279  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  27.48 
 
 
738 aa  278  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  27.96 
 
 
733 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  28.13 
 
 
737 aa  278  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0478  molybdopterin oxidoreductase  30.19 
 
 
670 aa  276  8e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  29.57 
 
 
674 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  27.82 
 
 
733 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  28.76 
 
 
763 aa  273  8.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0753  Nitrate reductase  28.7 
 
 
639 aa  272  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  28.67 
 
 
729 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  30.54 
 
 
669 aa  262  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  29.65 
 
 
666 aa  260  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>