More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1229 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  55.11 
 
 		 732 aa  869    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  60.85 
 
 		 759 aa  991    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 758 aa  1589    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  60.99 
 
 		 759 aa  991    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  60.72 
 
 		 759 aa  988    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  57.89 
 
 		 751 aa  916    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2242  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  69.93 
 
 		 750 aa  1132    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.514414  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  60.72 
 
 		 759 aa  988    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  70.62 
 
 		 743 aa  1143    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0550  Nitrate reductase  39.86 
 
 		 680 aa  536  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  38.49 
 
 		 677 aa  510  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  37.3 
 
 		 678 aa  504  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  34.42 
 
 		 691 aa  472  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0478  molybdopterin oxidoreductase  32.77 
 
 		 670 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2348  molybdopterin oxidoreductase  32.21 
 
 		 663 aa  376  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.316134  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  31.37 
 
 		 669 aa  336  7.999999999999999e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  30.99 
 
 		 666 aa  334  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  30.22 
 
 		 673 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1799  molybdopterin oxidoreductase  29.78 
 
 		 662 aa  297  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  30.26 
 
 		 688 aa  295  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  30.92 
 
 		 673 aa  293  8e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  28.94 
 
 		 662 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  29.71 
 
 		 690 aa  292  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  29.86 
 
 		 703 aa  290  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  29.26 
 
 		 697 aa  286  7e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1215  Nitrate reductase  28.38 
 
 		 643 aa  285  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0607485  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  29.35 
 
 		 684 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  29.83 
 
 		 727 aa  283  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  29.24 
 
 		 668 aa  283  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  29.35 
 
 		 698 aa  280  9e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  30.23 
 
 		 662 aa  279  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  29.49 
 
 		 692 aa  279  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  29.44 
 
 		 691 aa  277  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  29.96 
 
 		 734 aa  277  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  30.17 
 
 		 703 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2933  Nitrate reductase  30.81 
 
 		 677 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.529596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  27.97 
 
 		 688 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  27.97 
 
 		 688 aa  274  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  28.07 
 
 		 691 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  28.15 
 
 		 691 aa  273  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  28.51 
 
 		 698 aa  270  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  27.3 
 
 		 694 aa  270  8.999999999999999e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  30.26 
 
 		 674 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  27.38 
 
 		 688 aa  268  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  29.09 
 
 		 701 aa  268  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  29.49 
 
 		 728 aa  267  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  28.31 
 
 		 691 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  28.31 
 
 		 691 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  28.31 
 
 		 691 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  30.42 
 
 		 671 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  30.81 
 
 		 708 aa  265  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  28.25 
 
 		 691 aa  264  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  27.33 
 
 		 733 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  27.82 
 
 		 698 aa  263  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  28.43 
 
 		 692 aa  263  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  29.35 
 
 		 708 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  29.05 
 
 		 718 aa  262  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  27.2 
 
 		 733 aa  262  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  29.05 
 
 		 718 aa  262  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  29.05 
 
 		 718 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  28.11 
 
 		 692 aa  260  9e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  28.07 
 
 		 691 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  28.07 
 
 		 691 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0064  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  30.03 
 
 		 635 aa  259  1e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  28.09 
 
 		 709 aa  258  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  27.85 
 
 		 691 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  28.73 
 
 		 720 aa  258  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  27.38 
 
 		 703 aa  257  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  28.81 
 
 		 737 aa  257  6e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  29.83 
 
 		 666 aa  257  6e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  27.82 
 
 		 692 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  27.56 
 
 		 695 aa  254  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  28.23 
 
 		 676 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.04 
 
 		 671 aa  252  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  27.74 
 
 		 947 aa  252  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  28.03 
 
 		 712 aa  252  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  27.6 
 
 		 670 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  29.71 
 
 		 667 aa  251  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  27.91 
 
 		 710 aa  250  6e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  29.15 
 
 		 667 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  29.57 
 
 		 763 aa  249  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  27.98 
 
 		 726 aa  249  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  28.55 
 
 		 737 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  29.42 
 
 		 667 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  28.09 
 
 		 738 aa  248  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  26.88 
 
 		 654 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  25.88 
 
 		 680 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  26.8 
 
 		 726 aa  241  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  28.17 
 
 		 674 aa  240  8e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  28.59 
 
 		 668 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  26.8 
 
 		 726 aa  239  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  26.58 
 
 		 705 aa  239  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.57 
 
 		 679 aa  238  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  28.49 
 
 		 669 aa  236  9e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  28.85 
 
 		 668 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3449  molybdopterin oxidoreductase  27.42 
 
 		 650 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  27.07 
 
 		 647 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1386  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE  27.37 
 
 		 799 aa  231  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  26.84 
 
 		 800 aa  231  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2563  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  29.04 
 
 		 794 aa  228  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000909986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>