More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4918 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  100 
 
 
668 aa  1372    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  38.06 
 
 
666 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  37.05 
 
 
673 aa  415  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  35.41 
 
 
669 aa  404  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2933  Nitrate reductase  36.85 
 
 
677 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.529596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1799  molybdopterin oxidoreductase  33.09 
 
 
662 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  33.09 
 
 
662 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  31.79 
 
 
947 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  31.61 
 
 
732 aa  325  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3449  molybdopterin oxidoreductase  31.04 
 
 
650 aa  320  6e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1215  Nitrate reductase  31.22 
 
 
643 aa  316  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0607485  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  34.54 
 
 
654 aa  313  4.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  31.09 
 
 
759 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  31.23 
 
 
759 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0550  Nitrate reductase  33.23 
 
 
680 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  31.09 
 
 
759 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  30.95 
 
 
759 aa  306  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2242  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  30.09 
 
 
750 aa  297  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.514414  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  31.46 
 
 
678 aa  291  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  29.9 
 
 
743 aa  287  4e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  30.18 
 
 
673 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  29.45 
 
 
758 aa  283  9e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  29.84 
 
 
677 aa  281  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  31.77 
 
 
679 aa  280  6e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  30.21 
 
 
718 aa  280  9e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  30.21 
 
 
718 aa  280  9e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  30.21 
 
 
718 aa  279  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  30.91 
 
 
692 aa  278  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  30.75 
 
 
674 aa  277  6e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  29.52 
 
 
708 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  30.58 
 
 
693 aa  276  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  29.8 
 
 
751 aa  275  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3195  molybdopterin oxidoreductase  31.63 
 
 
637 aa  273  8.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  30.99 
 
 
703 aa  273  8.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  29.65 
 
 
690 aa  273  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  31.36 
 
 
662 aa  272  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  29.81 
 
 
688 aa  273  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  30.86 
 
 
684 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  29.81 
 
 
691 aa  270  8e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  28.14 
 
 
703 aa  270  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0177  molybdopterin oxidoreductase  31.34 
 
 
633 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0448  molybdopterin oxidoreductase  29.26 
 
 
661 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468926 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  29.01 
 
 
688 aa  265  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  30.11 
 
 
728 aa  263  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  28.63 
 
 
708 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  28.82 
 
 
671 aa  263  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  28.82 
 
 
691 aa  262  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  30.01 
 
 
697 aa  261  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2348  molybdopterin oxidoreductase  28.51 
 
 
663 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.316134  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  27.89 
 
 
691 aa  258  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  27.89 
 
 
691 aa  258  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  27.89 
 
 
691 aa  258  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  29.29 
 
 
676 aa  256  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  28.39 
 
 
726 aa  253  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  28.63 
 
 
691 aa  253  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  27.82 
 
 
691 aa  252  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  31.41 
 
 
666 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  28.88 
 
 
688 aa  251  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1523  molybdopterin oxidoreductase  29.13 
 
 
642 aa  251  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  28.88 
 
 
688 aa  251  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  28.92 
 
 
727 aa  251  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.19 
 
 
671 aa  250  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  29.45 
 
 
674 aa  250  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  27.54 
 
 
726 aa  249  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  27.54 
 
 
726 aa  248  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  28.18 
 
 
701 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  27.52 
 
 
694 aa  247  6e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  28.17 
 
 
691 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  28.17 
 
 
691 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  27.71 
 
 
691 aa  242  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  29.02 
 
 
734 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  27.65 
 
 
698 aa  242  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0753  Nitrate reductase  30.42 
 
 
639 aa  242  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  28.27 
 
 
691 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  27.38 
 
 
692 aa  239  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  28.63 
 
 
695 aa  236  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  27.29 
 
 
692 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2090  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  29.06 
 
 
645 aa  234  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  28.99 
 
 
669 aa  232  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  27.87 
 
 
709 aa  232  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  28.51 
 
 
710 aa  231  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  27 
 
 
698 aa  231  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  27.58 
 
 
720 aa  231  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  28.82 
 
 
668 aa  231  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  29.54 
 
 
667 aa  230  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  26.53 
 
 
698 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  27.55 
 
 
680 aa  229  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  28.87 
 
 
668 aa  229  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  27.55 
 
 
693 aa  228  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  25.36 
 
 
733 aa  228  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  29.6 
 
 
667 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  27.17 
 
 
712 aa  226  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  27.63 
 
 
670 aa  226  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  29.45 
 
 
667 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  25.21 
 
 
733 aa  225  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 
705 aa  224  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  28.79 
 
 
647 aa  223  8e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  26.04 
 
 
692 aa  221  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  27.63 
 
 
707 aa  221  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  27.16 
 
 
703 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>