More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2242 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  64.13 
 
 
759 aa  1043    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  64 
 
 
759 aa  1041    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  55.13 
 
 
751 aa  851    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  63.73 
 
 
759 aa  1039    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  64.27 
 
 
759 aa  1044    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  69.93 
 
 
758 aa  1122    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  76.75 
 
 
743 aa  1222    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2242  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  100 
 
 
750 aa  1572    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.514414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  52.55 
 
 
732 aa  816    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  38.68 
 
 
678 aa  516  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0550  Nitrate reductase  38.93 
 
 
680 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  38.39 
 
 
677 aa  505  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  36.44 
 
 
691 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2348  molybdopterin oxidoreductase  31.22 
 
 
663 aa  369  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.316134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0478  molybdopterin oxidoreductase  31.6 
 
 
670 aa  360  8e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  33.09 
 
 
669 aa  357  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  30.98 
 
 
666 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  32.64 
 
 
673 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1799  molybdopterin oxidoreductase  29.39 
 
 
662 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  30.09 
 
 
668 aa  297  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  29.5 
 
 
692 aa  296  8e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  28.82 
 
 
662 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  29.18 
 
 
734 aa  287  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  29.56 
 
 
690 aa  285  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  30.7 
 
 
691 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  30.63 
 
 
688 aa  283  8.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  29.84 
 
 
684 aa  283  9e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  29.94 
 
 
691 aa  283  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  29.23 
 
 
697 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  29.47 
 
 
691 aa  281  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  29.16 
 
 
727 aa  280  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  29.79 
 
 
703 aa  280  7e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  29.62 
 
 
698 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1215  Nitrate reductase  28.55 
 
 
643 aa  278  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0607485  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  30.54 
 
 
703 aa  278  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  29.46 
 
 
691 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  29.46 
 
 
691 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  29.46 
 
 
691 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  30.4 
 
 
691 aa  277  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  30.4 
 
 
691 aa  277  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  30.4 
 
 
691 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  29.56 
 
 
691 aa  276  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  30.51 
 
 
694 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  29.37 
 
 
698 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  31.29 
 
 
708 aa  275  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  29.35 
 
 
698 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  29.27 
 
 
673 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  29.04 
 
 
662 aa  270  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  28.38 
 
 
654 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  29.4 
 
 
688 aa  268  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  28.55 
 
 
710 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2933  Nitrate reductase  29.77 
 
 
677 aa  265  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.529596  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  30.32 
 
 
708 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  27.78 
 
 
709 aa  265  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  28.98 
 
 
947 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  28.34 
 
 
692 aa  263  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  29.67 
 
 
728 aa  263  8e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  29.81 
 
 
701 aa  263  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  29.25 
 
 
726 aa  262  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  29.12 
 
 
688 aa  262  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  28.03 
 
 
692 aa  263  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  29.64 
 
 
718 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  29.64 
 
 
718 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  30.43 
 
 
676 aa  262  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  29.12 
 
 
688 aa  261  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  29.64 
 
 
718 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  27.96 
 
 
692 aa  259  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  28.96 
 
 
726 aa  258  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  28.12 
 
 
670 aa  258  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  27.64 
 
 
737 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  29.35 
 
 
703 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  28.82 
 
 
726 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  28.72 
 
 
680 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.68 
 
 
671 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  28.35 
 
 
674 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  26.68 
 
 
733 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  28.59 
 
 
720 aa  251  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  29.58 
 
 
671 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  26.55 
 
 
733 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1612  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  29.05 
 
 
820 aa  248  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  29.7 
 
 
695 aa  248  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  28.67 
 
 
705 aa  248  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  26.89 
 
 
712 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  28.94 
 
 
679 aa  246  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  27.38 
 
 
737 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  27.07 
 
 
738 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  28.39 
 
 
674 aa  241  4e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1841  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  29.08 
 
 
811 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1674  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  29.34 
 
 
811 aa  237  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.666152  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1668  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  29.34 
 
 
811 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1609  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  29.21 
 
 
811 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1600  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  29.21 
 
 
811 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573894  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  28.13 
 
 
666 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  29.23 
 
 
668 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2563  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  30.09 
 
 
794 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000909986  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  28.32 
 
 
669 aa  233  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.23 
 
 
814 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.23 
 
 
814 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3449  molybdopterin oxidoreductase  26.94 
 
 
650 aa  232  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  28.09 
 
 
693 aa  231  3e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>