More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1823 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
726 aa  1507    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  61.32 
 
 
710 aa  911    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  57.75 
 
 
708 aa  852    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  57.12 
 
 
709 aa  848    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  58.92 
 
 
718 aa  865    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  61.23 
 
 
720 aa  920    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  57.18 
 
 
708 aa  841    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  95.18 
 
 
726 aa  1451    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  61.63 
 
 
712 aa  909    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  58.92 
 
 
718 aa  865    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  94.9 
 
 
726 aa  1446    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  58.92 
 
 
718 aa  863    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  46.28 
 
 
690 aa  641    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  57.77 
 
 
728 aa  850    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  44.7 
 
 
703 aa  601  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  44.21 
 
 
701 aa  598  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  44.44 
 
 
698 aa  593  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  43.34 
 
 
698 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  43.3 
 
 
698 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  43.59 
 
 
691 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  43.02 
 
 
691 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  42.88 
 
 
691 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  44.02 
 
 
688 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  42.88 
 
 
691 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  42.74 
 
 
692 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  43.02 
 
 
691 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  43.02 
 
 
691 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  43.54 
 
 
692 aa  559  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  42.78 
 
 
688 aa  560  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  44.14 
 
 
684 aa  558  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  42.59 
 
 
692 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  42.59 
 
 
691 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  42.59 
 
 
691 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  43.73 
 
 
688 aa  557  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  42.31 
 
 
691 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  42.36 
 
 
691 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  42.96 
 
 
674 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  41.74 
 
 
692 aa  548  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  42.88 
 
 
694 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  42.34 
 
 
670 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  42.63 
 
 
673 aa  537  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  41.94 
 
 
705 aa  532  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  41.99 
 
 
727 aa  532  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  41.61 
 
 
703 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  42.57 
 
 
703 aa  510  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  40.23 
 
 
680 aa  505  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  42.02 
 
 
695 aa  502  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  41.75 
 
 
688 aa  502  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  40.99 
 
 
697 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  39.94 
 
 
707 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  38.2 
 
 
671 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  37.16 
 
 
662 aa  451  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  34.05 
 
 
734 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  37.78 
 
 
679 aa  442  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  36.12 
 
 
671 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  35.46 
 
 
674 aa  426  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  36.21 
 
 
693 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  36.44 
 
 
676 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  35.46 
 
 
669 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  36.51 
 
 
668 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  35.85 
 
 
668 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  35.8 
 
 
666 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  35.51 
 
 
677 aa  391  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  35.91 
 
 
667 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  35.91 
 
 
667 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  35.91 
 
 
667 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  33.85 
 
 
703 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  34.23 
 
 
703 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  34.76 
 
 
708 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  34.9 
 
 
689 aa  375  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  33.71 
 
 
702 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  33.01 
 
 
720 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  33.98 
 
 
695 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  33.81 
 
 
712 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  32.67 
 
 
734 aa  360  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1053  molybdopterin oxidoreductase  32.77 
 
 
701 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62402  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  34.14 
 
 
679 aa  355  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  31.77 
 
 
693 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4922  molybdopterin oxidoreductase  34.23 
 
 
700 aa  352  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400406  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  33.14 
 
 
703 aa  351  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3302  molybdopterin oxidoreductase  31.44 
 
 
697 aa  350  5e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  32.77 
 
 
704 aa  349  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  33.94 
 
 
710 aa  348  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4362  molybdopterin oxidoreductase  34.13 
 
 
699 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481133  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  29.51 
 
 
733 aa  334  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  29.37 
 
 
733 aa  332  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  29 
 
 
763 aa  331  2e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  31.41 
 
 
706 aa  320  6e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  30.94 
 
 
737 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  30.62 
 
 
737 aa  310  8e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  29.46 
 
 
738 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  29.85 
 
 
763 aa  306  8.000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3420  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  60.7 
 
 
234 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  30 
 
 
708 aa  306  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  29.86 
 
 
708 aa  301  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  30.67 
 
 
666 aa  300  6e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  31.99 
 
 
678 aa  297  6e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  31.26 
 
 
677 aa  290  9e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  30.11 
 
 
732 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  30.23 
 
 
743 aa  282  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>