More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4922 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  58.48 
 
 
679 aa  734    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  70.22 
 
 
703 aa  961    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  61.67 
 
 
708 aa  862    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  61.82 
 
 
708 aa  866    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  63.17 
 
 
710 aa  867    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  60.94 
 
 
706 aa  857    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  58.16 
 
 
689 aa  776    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4922  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
700 aa  1422    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400406  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  68.99 
 
 
702 aa  958    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3302  molybdopterin oxidoreductase  64.5 
 
 
697 aa  900    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1053  molybdopterin oxidoreductase  63.58 
 
 
701 aa  904    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62402  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  67.06 
 
 
720 aa  939    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  69.08 
 
 
703 aa  961    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  65.3 
 
 
703 aa  910    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  60.55 
 
 
734 aa  843    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  60.69 
 
 
712 aa  841    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4362  molybdopterin oxidoreductase  87.37 
 
 
699 aa  1225    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481133  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  68.35 
 
 
695 aa  955    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  64.99 
 
 
708 aa  914    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  62.12 
 
 
704 aa  869    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  44.72 
 
 
677 aa  551  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  40.54 
 
 
692 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  37.55 
 
 
662 aa  429  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  37.7 
 
 
692 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  36.83 
 
 
690 aa  419  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  39.57 
 
 
698 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  38.4 
 
 
691 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  38.12 
 
 
692 aa  415  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  39.12 
 
 
703 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  38.24 
 
 
691 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  37.07 
 
 
692 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  38.33 
 
 
701 aa  412  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  38.24 
 
 
691 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  38.24 
 
 
691 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  37.69 
 
 
691 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  38.17 
 
 
698 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  37.5 
 
 
691 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  38.02 
 
 
671 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  36.83 
 
 
691 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  37.83 
 
 
698 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  37.25 
 
 
691 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  35.86 
 
 
674 aa  402  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  39.42 
 
 
688 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  39.42 
 
 
688 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  37.68 
 
 
688 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  38.21 
 
 
666 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  36.92 
 
 
668 aa  395  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  36.69 
 
 
676 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  36.27 
 
 
691 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  36.15 
 
 
668 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  36.27 
 
 
691 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  36.2 
 
 
679 aa  395  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  35.69 
 
 
669 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  35.93 
 
 
693 aa  391  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  38.62 
 
 
694 aa  392  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  37.04 
 
 
670 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  38.31 
 
 
727 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  38.45 
 
 
667 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  35.92 
 
 
671 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  38.45 
 
 
667 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  36.46 
 
 
684 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  38.66 
 
 
695 aa  379  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  38.46 
 
 
667 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  36.69 
 
 
705 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  34.83 
 
 
708 aa  364  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  37.43 
 
 
680 aa  359  8e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  34.81 
 
 
703 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  34.23 
 
 
726 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  34.44 
 
 
673 aa  356  8.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  33.76 
 
 
726 aa  354  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  33.82 
 
 
708 aa  353  5e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  33.61 
 
 
726 aa  353  7e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  35.88 
 
 
697 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  36.27 
 
 
703 aa  350  5e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  33.97 
 
 
720 aa  349  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  33.96 
 
 
674 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  35.92 
 
 
707 aa  342  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  34.96 
 
 
688 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  34.22 
 
 
728 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  32.64 
 
 
709 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  33.58 
 
 
712 aa  334  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  34.58 
 
 
718 aa  333  6e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  31.85 
 
 
710 aa  331  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  34.44 
 
 
718 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  34.44 
 
 
718 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  28.86 
 
 
734 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  30.18 
 
 
693 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  29.74 
 
 
733 aa  259  9e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  29.6 
 
 
733 aa  257  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  28.49 
 
 
732 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  28.66 
 
 
737 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  27.39 
 
 
738 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  28.98 
 
 
678 aa  236  9e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  27.57 
 
 
737 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  27.06 
 
 
759 aa  231  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.86 
 
 
759 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.92 
 
 
759 aa  229  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.79 
 
 
759 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  28.25 
 
 
677 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  25.76 
 
 
666 aa  218  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>