More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4875 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  62.35 
 
 
691 aa  859    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  63.27 
 
 
670 aa  845    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  56.67 
 
 
692 aa  712    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  74.15 
 
 
695 aa  1013    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  65.75 
 
 
698 aa  900    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  64.09 
 
 
703 aa  876    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  63.32 
 
 
691 aa  875    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  63.17 
 
 
691 aa  878    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  63.97 
 
 
691 aa  877    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  51.47 
 
 
690 aa  689    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  72.91 
 
 
703 aa  1048    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  64.19 
 
 
698 aa  889    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  74.75 
 
 
705 aa  1082    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  61.48 
 
 
692 aa  858    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  63.99 
 
 
701 aa  876    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  62.5 
 
 
691 aa  862    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  62.79 
 
 
691 aa  869    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  64.19 
 
 
698 aa  884    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  63.38 
 
 
691 aa  877    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  61.92 
 
 
692 aa  859    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  62.5 
 
 
691 aa  862    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  72.7 
 
 
727 aa  1037    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  77.84 
 
 
694 aa  1113    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  78.22 
 
 
688 aa  1100    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
688 aa  1410    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  78.37 
 
 
688 aa  1102    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  69.33 
 
 
680 aa  943    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  63.32 
 
 
691 aa  875    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  63.32 
 
 
691 aa  875    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  68.15 
 
 
707 aa  907    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  62.06 
 
 
692 aa  862    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  47.02 
 
 
684 aa  581  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  44.74 
 
 
708 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  43.34 
 
 
726 aa  565  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  44.27 
 
 
708 aa  567  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  43.2 
 
 
726 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  42.78 
 
 
726 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  42.48 
 
 
673 aa  537  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  44.54 
 
 
688 aa  529  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  42.36 
 
 
674 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  42.37 
 
 
718 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  40.89 
 
 
728 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  42.23 
 
 
718 aa  522  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  42.23 
 
 
718 aa  522  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  40.71 
 
 
720 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  43.85 
 
 
697 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  43.21 
 
 
703 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  41.69 
 
 
674 aa  504  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  40.14 
 
 
710 aa  504  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  39.38 
 
 
709 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  40.03 
 
 
712 aa  498  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  42.69 
 
 
662 aa  495  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  41.35 
 
 
679 aa  489  1e-137  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  41.06 
 
 
671 aa  463  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  40.78 
 
 
693 aa  465  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  38 
 
 
671 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  38.94 
 
 
676 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  39.35 
 
 
668 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  37.98 
 
 
668 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  32.89 
 
 
734 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  37.13 
 
 
669 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  38.71 
 
 
666 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  39.39 
 
 
667 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  39.27 
 
 
667 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  39.27 
 
 
667 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4362  molybdopterin oxidoreductase  38.77 
 
 
699 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481133  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  38.4 
 
 
689 aa  391  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  35.52 
 
 
702 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4922  molybdopterin oxidoreductase  37.68 
 
 
700 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400406  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  36.36 
 
 
708 aa  378  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  35.46 
 
 
720 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  35.69 
 
 
703 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  36.26 
 
 
677 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  35.55 
 
 
695 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  35.24 
 
 
703 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  35.81 
 
 
712 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1053  molybdopterin oxidoreductase  34.28 
 
 
701 aa  366  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62402  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  37.39 
 
 
679 aa  363  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  35.93 
 
 
703 aa  362  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3302  molybdopterin oxidoreductase  34.05 
 
 
697 aa  359  7e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  34.78 
 
 
734 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  35.62 
 
 
706 aa  355  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  33.67 
 
 
704 aa  354  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  34.64 
 
 
693 aa  353  5e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  31.5 
 
 
733 aa  349  9e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  34.34 
 
 
710 aa  347  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  34.87 
 
 
708 aa  347  6e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  31.36 
 
 
733 aa  347  6e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  34.97 
 
 
708 aa  342  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  31.44 
 
 
666 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  31.71 
 
 
763 aa  324  3e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  30.58 
 
 
738 aa  323  8e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  31.62 
 
 
737 aa  318  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  28.95 
 
 
763 aa  318  2e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  30.58 
 
 
732 aa  317  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  31.56 
 
 
737 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  32.45 
 
 
673 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  31.71 
 
 
678 aa  299  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  30.68 
 
 
647 aa  296  7e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  30.81 
 
 
691 aa  288  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>