More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3000 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  60.29 
 
 
727 aa  834    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  80.46 
 
 
698 aa  1147    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  63.14 
 
 
707 aa  832    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
703 aa  1442    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  69.18 
 
 
691 aa  972    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  68.99 
 
 
670 aa  937    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  68.35 
 
 
691 aa  965    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  63.91 
 
 
688 aa  871    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  57.72 
 
 
690 aa  803    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  68.74 
 
 
691 aa  961    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  62.28 
 
 
703 aa  845    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  65.31 
 
 
705 aa  903    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  67.98 
 
 
692 aa  959    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  85.69 
 
 
701 aa  1234    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  68.64 
 
 
691 aa  960    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  79.31 
 
 
698 aa  1135    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  68.64 
 
 
691 aa  965    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  68.64 
 
 
691 aa  960    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  68.07 
 
 
692 aa  958    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  58.93 
 
 
692 aa  770    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  78.87 
 
 
698 aa  1134    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  68.5 
 
 
691 aa  954    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  64.19 
 
 
694 aa  891    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  63.77 
 
 
688 aa  869    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  64.09 
 
 
688 aa  876    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  68.45 
 
 
692 aa  967    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  65.8 
 
 
680 aa  889    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  69.18 
 
 
691 aa  972    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  69.18 
 
 
691 aa  972    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  63.23 
 
 
695 aa  854    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  69.08 
 
 
691 aa  971    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  46.92 
 
 
708 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  48.77 
 
 
684 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  46.22 
 
 
708 aa  609  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  44.7 
 
 
726 aa  601  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  43.99 
 
 
726 aa  597  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  44.13 
 
 
726 aa  596  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  43.64 
 
 
720 aa  581  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  45.21 
 
 
718 aa  581  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  45.13 
 
 
728 aa  580  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  45.21 
 
 
718 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  45.21 
 
 
718 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  42.64 
 
 
712 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  43.67 
 
 
673 aa  555  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  41.75 
 
 
710 aa  550  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  44.89 
 
 
697 aa  547  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  43.4 
 
 
674 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  41.09 
 
 
709 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  44.68 
 
 
703 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  43.3 
 
 
679 aa  528  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  42.12 
 
 
674 aa  523  1e-147  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  43.04 
 
 
688 aa  523  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  41.57 
 
 
693 aa  489  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.11 
 
 
671 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  41.7 
 
 
676 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  36.11 
 
 
734 aa  475  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  41.25 
 
 
662 aa  471  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  40.12 
 
 
668 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  39.83 
 
 
671 aa  465  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  39.45 
 
 
668 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  40.64 
 
 
666 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  40.93 
 
 
667 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  38.84 
 
 
669 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  40.64 
 
 
667 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  39.88 
 
 
689 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  40.49 
 
 
667 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4922  molybdopterin oxidoreductase  39.12 
 
 
700 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400406  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  37.44 
 
 
695 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  36.38 
 
 
712 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  36.67 
 
 
703 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  36.66 
 
 
677 aa  392  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  36.55 
 
 
702 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  35.31 
 
 
734 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  33.76 
 
 
733 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  33.62 
 
 
733 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  37.61 
 
 
708 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4362  molybdopterin oxidoreductase  38.99 
 
 
699 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481133  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  36.36 
 
 
720 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  36.28 
 
 
703 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  36.22 
 
 
703 aa  378  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3302  molybdopterin oxidoreductase  35.69 
 
 
697 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  36.87 
 
 
706 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1053  molybdopterin oxidoreductase  35.19 
 
 
701 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62402  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  36.54 
 
 
708 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  37.97 
 
 
679 aa  369  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  36.54 
 
 
708 aa  368  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  34.59 
 
 
710 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  33.85 
 
 
763 aa  363  6e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  35.1 
 
 
704 aa  362  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  30.49 
 
 
763 aa  360  5e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  33.48 
 
 
738 aa  355  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  31.5 
 
 
666 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  33.52 
 
 
693 aa  348  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  33.98 
 
 
737 aa  345  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  33.63 
 
 
737 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  32.7 
 
 
673 aa  320  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  32.69 
 
 
732 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  29.28 
 
 
669 aa  306  7e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  30.99 
 
 
647 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0064  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  29.46 
 
 
635 aa  295  1e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>