More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3483 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  57.95 
 
 
692 aa  753    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  69.57 
 
 
698 aa  1006    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  68.45 
 
 
703 aa  967    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  79.88 
 
 
691 aa  1172    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  78.32 
 
 
691 aa  1145    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  59.25 
 
 
707 aa  786    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  69.42 
 
 
698 aa  1005    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  77.65 
 
 
670 aa  1093    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  79.71 
 
 
691 aa  1161    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  60.03 
 
 
695 aa  805    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  60.46 
 
 
703 aa  827    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  62.34 
 
 
705 aa  862    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  92.34 
 
 
692 aa  1333    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  68.69 
 
 
701 aa  987    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  79.05 
 
 
691 aa  1143    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  59.48 
 
 
727 aa  826    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  78.18 
 
 
691 aa  1135    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  79.05 
 
 
691 aa  1143    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  84.52 
 
 
692 aa  1228    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  61.19 
 
 
694 aa  851    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  61.81 
 
 
688 aa  856    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  62.06 
 
 
688 aa  862    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
692 aa  1427    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  61.61 
 
 
680 aa  828    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  79.86 
 
 
691 aa  1155    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  79.19 
 
 
691 aa  1144    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  79.88 
 
 
691 aa  1172    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  79.88 
 
 
691 aa  1172    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  54.78 
 
 
690 aa  753    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  61.95 
 
 
688 aa  857    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  69.86 
 
 
698 aa  1003    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  47.73 
 
 
684 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  44.19 
 
 
708 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  43.4 
 
 
708 aa  563  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  42.17 
 
 
726 aa  554  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  42.02 
 
 
718 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  42.17 
 
 
726 aa  551  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  41.88 
 
 
718 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  41.74 
 
 
726 aa  548  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  41.88 
 
 
718 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  43.95 
 
 
688 aa  542  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  41.28 
 
 
728 aa  542  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  42.84 
 
 
673 aa  537  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  40.97 
 
 
720 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  42.78 
 
 
697 aa  523  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  42.31 
 
 
703 aa  524  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  43.07 
 
 
674 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  39.41 
 
 
710 aa  513  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  39.3 
 
 
712 aa  511  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  39.3 
 
 
709 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  42.79 
 
 
671 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  41.79 
 
 
662 aa  501  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  40.43 
 
 
671 aa  498  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  41.12 
 
 
679 aa  495  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  41.16 
 
 
676 aa  498  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  41.17 
 
 
693 aa  492  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  41.4 
 
 
668 aa  492  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  36.46 
 
 
734 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  40.35 
 
 
674 aa  491  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  41.78 
 
 
669 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  41.31 
 
 
668 aa  478  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  40.55 
 
 
666 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  42.04 
 
 
667 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  41.31 
 
 
667 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  41.11 
 
 
667 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  38.21 
 
 
689 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4922  molybdopterin oxidoreductase  37.7 
 
 
700 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400406  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  36.76 
 
 
703 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  34.51 
 
 
702 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  34.8 
 
 
695 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4362  molybdopterin oxidoreductase  36.83 
 
 
699 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481133  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  35.66 
 
 
708 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  37.48 
 
 
679 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  35.88 
 
 
703 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  34.58 
 
 
677 aa  379  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  33.99 
 
 
720 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1053  molybdopterin oxidoreductase  33.86 
 
 
701 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62402  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3302  molybdopterin oxidoreductase  33.14 
 
 
697 aa  360  6e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  34.22 
 
 
703 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  30.7 
 
 
733 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  30.56 
 
 
733 aa  351  3e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  32.4 
 
 
710 aa  349  8e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.81 
 
 
708 aa  349  1e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  31.98 
 
 
712 aa  346  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  33.81 
 
 
708 aa  346  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  32.67 
 
 
706 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  31.71 
 
 
693 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  31.61 
 
 
734 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  29.58 
 
 
763 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  32.3 
 
 
704 aa  334  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  31.39 
 
 
763 aa  326  1e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  29.91 
 
 
738 aa  325  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  30.58 
 
 
737 aa  320  6e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  31.34 
 
 
666 aa  319  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  30.35 
 
 
669 aa  312  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  30.21 
 
 
737 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  30.67 
 
 
673 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  31.27 
 
 
732 aa  300  9e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0064  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  28.8 
 
 
635 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  30.13 
 
 
647 aa  281  2e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>