More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0336 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  60.29 
 
 		 692 aa  815    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  60.03 
 
 		 692 aa  822    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  71.41 
 
 		 727 aa  994    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  62.9 
 
 		 698 aa  844    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  59.27 
 
 		 691 aa  815    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  63.23 
 
 		 703 aa  867    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  61.86 
 
 		 691 aa  832    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  59.73 
 
 		 670 aa  786    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  59.12 
 
 		 691 aa  809    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  52.73 
 
 		 690 aa  697    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  62.24 
 
 		 691 aa  831    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  71.28 
 
 		 703 aa  1020    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  58.52 
 
 		 691 aa  803    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  74.56 
 
 		 705 aa  1066    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  59.91 
 
 		 692 aa  816    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  62.43 
 
 		 701 aa  848    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  58.37 
 
 		 691 aa  805    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  62.12 
 
 		 698 aa  851    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  55.8 
 
 		 692 aa  697    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  58.95 
 
 		 691 aa  811    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  58.37 
 
 		 691 aa  805    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  73.86 
 
 		 688 aa  1038    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  65.55 
 
 		 707 aa  853    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 695 aa  1424    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  73.96 
 
 		 694 aa  1024    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  73.56 
 
 		 688 aa  1033    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  74.15 
 
 		 688 aa  1030    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  67.95 
 
 		 680 aa  914    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  61.96 
 
 		 698 aa  846    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  61.86 
 
 		 691 aa  832    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  61.86 
 
 		 691 aa  832    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  48.53 
 
 		 684 aa  587  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  44.89 
 
 		 673 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  44.74 
 
 		 674 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  42.88 
 
 		 708 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  42.11 
 
 		 708 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  41.23 
 
 		 726 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  43.65 
 
 		 679 aa  514  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  40.81 
 
 		 726 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  43.81 
 
 		 688 aa  514  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  43.27 
 
 		 697 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  42.02 
 
 		 726 aa  515  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  41.71 
 
 		 710 aa  509  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  40.69 
 
 		 728 aa  510  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  43.56 
 
 		 703 aa  509  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  41.35 
 
 		 718 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  43.26 
 
 		 674 aa  503  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  40.93 
 
 		 718 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  40.93 
 
 		 718 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  43.08 
 
 		 693 aa  500  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  40.42 
 
 		 720 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  38.96 
 
 		 709 aa  488  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  39.77 
 
 		 712 aa  477  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  41.77 
 
 		 671 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  41.26 
 
 		 662 aa  454  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  39.94 
 
 		 671 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  34.61 
 
 		 734 aa  435  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  39.2 
 
 		 676 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  39.82 
 
 		 668 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  38.92 
 
 		 668 aa  429  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  40.42 
 
 		 666 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  40.47 
 
 		 667 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  39.07 
 
 		 669 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  39.91 
 
 		 667 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  39.56 
 
 		 667 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  39.14 
 
 		 689 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  36.83 
 
 		 702 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  37.76 
 
 		 703 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  37.46 
 
 		 703 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  37.77 
 
 		 708 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  36.12 
 
 		 720 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4922  molybdopterin oxidoreductase  38.66 
 
 		 700 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400406  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  37.41 
 
 		 712 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4362  molybdopterin oxidoreductase  39.05 
 
 		 699 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  35.67 
 
 		 677 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  37.19 
 
 		 734 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  36.66 
 
 		 710 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  35.26 
 
 		 693 aa  365  1e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  35.79 
 
 		 704 aa  365  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  36.27 
 
 		 703 aa  361  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  36.68 
 
 		 706 aa  360  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  35.71 
 
 		 695 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1053  molybdopterin oxidoreductase  34.93 
 
 		 701 aa  356  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3302  molybdopterin oxidoreductase  34.05 
 
 		 697 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  36.51 
 
 		 708 aa  350  4e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  38.81 
 
 		 679 aa  350  7e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  36.36 
 
 		 708 aa  347  5e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  28.92 
 
 		 733 aa  332  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  28.77 
 
 		 733 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  30.29 
 
 		 738 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  32.03 
 
 		 763 aa  327  4.0000000000000003e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  31.42 
 
 		 737 aa  327  6e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  34.64 
 
 		 647 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  30.03 
 
 		 763 aa  318  2e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  31.36 
 
 		 737 aa  318  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  31.45 
 
 		 666 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  32.95 
 
 		 678 aa  302  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  32.86 
 
 		 673 aa  302  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  30.35 
 
 		 732 aa  299  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2933  Nitrate reductase  33.09 
 
 		 677 aa  288  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.529596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>