More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3548 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
673 aa  1402    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2933  Nitrate reductase  40.75 
 
 
677 aa  461  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.529596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  37.71 
 
 
666 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  37.35 
 
 
669 aa  429  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1215  Nitrate reductase  37.6 
 
 
643 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0607485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  37.05 
 
 
668 aa  415  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1799  molybdopterin oxidoreductase  32.54 
 
 
662 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  32.09 
 
 
662 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  34.78 
 
 
947 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  33.19 
 
 
684 aa  343  5e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  35.6 
 
 
654 aa  339  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3449  molybdopterin oxidoreductase  34.02 
 
 
650 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  32.67 
 
 
759 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  31.24 
 
 
732 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  32.52 
 
 
759 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  33.48 
 
 
691 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  32.52 
 
 
759 aa  327  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  32.37 
 
 
759 aa  326  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  33.19 
 
 
691 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  32.71 
 
 
691 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  32.61 
 
 
690 aa  322  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  33.19 
 
 
691 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  33.19 
 
 
691 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2242  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  32.64 
 
 
750 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.514414  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  33.28 
 
 
678 aa  321  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  32.7 
 
 
703 aa  320  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  32.27 
 
 
691 aa  319  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  32.42 
 
 
691 aa  316  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  32.99 
 
 
692 aa  316  9e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  31.6 
 
 
693 aa  315  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  33.28 
 
 
743 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  31.69 
 
 
691 aa  312  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0550  Nitrate reductase  32.13 
 
 
680 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  32.61 
 
 
698 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  31.9 
 
 
691 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  31.25 
 
 
692 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  31.61 
 
 
691 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  32.86 
 
 
674 aa  309  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  31.61 
 
 
691 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  30.22 
 
 
758 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  33.24 
 
 
718 aa  306  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  32.38 
 
 
701 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  33.1 
 
 
718 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  33.1 
 
 
718 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  30.99 
 
 
677 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  30.67 
 
 
692 aa  302  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  32.46 
 
 
703 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  32.27 
 
 
708 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  31.71 
 
 
670 aa  301  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  32.45 
 
 
688 aa  300  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  32.61 
 
 
697 aa  299  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  31.08 
 
 
698 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  32.39 
 
 
751 aa  296  7e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  30.14 
 
 
734 aa  294  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  33.04 
 
 
662 aa  293  7e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  30.84 
 
 
698 aa  293  9e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  32.86 
 
 
695 aa  292  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  33 
 
 
703 aa  291  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  32.04 
 
 
728 aa  291  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  30.28 
 
 
692 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  29.65 
 
 
708 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  31.88 
 
 
727 aa  287  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  32.08 
 
 
688 aa  286  7e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  32.13 
 
 
668 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  30.62 
 
 
720 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  31.93 
 
 
688 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  31.21 
 
 
671 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  29.97 
 
 
673 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0448  molybdopterin oxidoreductase  31.14 
 
 
661 aa  282  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468926 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  31.58 
 
 
694 aa  281  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  31.35 
 
 
688 aa  281  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  31.65 
 
 
679 aa  279  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  29.93 
 
 
674 aa  278  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  31.68 
 
 
666 aa  278  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  29.87 
 
 
710 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  31.01 
 
 
709 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2348  molybdopterin oxidoreductase  32.02 
 
 
663 aa  275  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.316134  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  32.08 
 
 
668 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  31.88 
 
 
705 aa  272  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.09 
 
 
671 aa  270  7e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3195  molybdopterin oxidoreductase  29.77 
 
 
637 aa  270  8e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  32.21 
 
 
680 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  30.71 
 
 
676 aa  267  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  29.36 
 
 
712 aa  264  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  31.88 
 
 
707 aa  262  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  31.47 
 
 
669 aa  261  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  29.36 
 
 
726 aa  260  6e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1523  molybdopterin oxidoreductase  30.93 
 
 
642 aa  259  8e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  30.57 
 
 
711 aa  258  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  30.12 
 
 
667 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  30.45 
 
 
667 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0177  molybdopterin oxidoreductase  31.64 
 
 
633 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  28.79 
 
 
726 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  28.79 
 
 
726 aa  254  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  29.97 
 
 
667 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  28.37 
 
 
763 aa  254  4.0000000000000004e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  28.31 
 
 
729 aa  252  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  29.37 
 
 
737 aa  249  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  29.4 
 
 
647 aa  248  4e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2922  molybdopterin oxidoreductase  29.63 
 
 
777 aa  244  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.811962  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>