More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2738 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  59.4 
 
 		 667 aa  793    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  57.36 
 
 		 669 aa  780    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  78.39 
 
 		 671 aa  1090    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 671 aa  1374    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  51.27 
 
 		 662 aa  684    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  65.28 
 
 		 668 aa  900    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  60.3 
 
 		 667 aa  794    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  59.7 
 
 		 667 aa  795    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  64.42 
 
 		 668 aa  904    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  61.54 
 
 		 666 aa  808    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  70.1 
 
 		 676 aa  989    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  42.77 
 
 		 690 aa  544  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  43.8 
 
 		 697 aa  525  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  41.1 
 
 		 692 aa  525  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  41.94 
 
 		 691 aa  519  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  41.72 
 
 		 691 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  44.06 
 
 		 688 aa  514  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  43.23 
 
 		 703 aa  515  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  42.15 
 
 		 691 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  41.42 
 
 		 691 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  41.42 
 
 		 691 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  41.42 
 
 		 691 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  40.93 
 
 		 691 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  41.07 
 
 		 691 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  40.93 
 
 		 691 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  40.93 
 
 		 691 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  40.72 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  40.43 
 
 		 692 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  41.41 
 
 		 670 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  40.75 
 
 		 698 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  40.43 
 
 		 698 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  40.29 
 
 		 698 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  40.52 
 
 		 692 aa  467  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  39.83 
 
 		 703 aa  465  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  37.07 
 
 		 709 aa  463  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  39.77 
 
 		 701 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  37.87 
 
 		 710 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  40.26 
 
 		 679 aa  456  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  40.36 
 
 		 684 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  39.62 
 
 		 688 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  39.62 
 
 		 688 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  37.18 
 
 		 708 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  37.34 
 
 		 708 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  38 
 
 		 688 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  37.91 
 
 		 718 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  37.69 
 
 		 728 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  36.84 
 
 		 720 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  38.39 
 
 		 705 aa  438  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  37.62 
 
 		 718 aa  438  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  39.94 
 
 		 695 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  37.62 
 
 		 718 aa  438  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  38.7 
 
 		 694 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  36.66 
 
 		 712 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  36.4 
 
 		 726 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  38.22 
 
 		 674 aa  435  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  38.85 
 
 		 727 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  36.12 
 
 		 726 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  36.45 
 
 		 726 aa  432  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  36.6 
 
 		 677 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  38.52 
 
 		 680 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  38.12 
 
 		 674 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  36.97 
 
 		 703 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  37.67 
 
 		 673 aa  413  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  36.7 
 
 		 693 aa  402  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  34.32 
 
 		 734 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  37.27 
 
 		 707 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  35.5 
 
 		 703 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  35.06 
 
 		 703 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  36.1 
 
 		 708 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  33.96 
 
 		 695 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  34.54 
 
 		 702 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4922  molybdopterin oxidoreductase  35.92 
 
 		 700 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400406  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3302  molybdopterin oxidoreductase  34 
 
 		 697 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  35.43 
 
 		 703 aa  372  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  31.92 
 
 		 733 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  31.77 
 
 		 733 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  35.32 
 
 		 689 aa  365  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  34.81 
 
 		 720 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  36.05 
 
 		 679 aa  362  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1053  molybdopterin oxidoreductase  34.11 
 
 		 701 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62402  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  33.09 
 
 		 708 aa  357  5e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.09 
 
 		 708 aa  355  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4362  molybdopterin oxidoreductase  34.82 
 
 		 699 aa  353  5e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  32.85 
 
 		 706 aa  352  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  31.86 
 
 		 704 aa  346  6e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  31.6 
 
 		 712 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  31.8 
 
 		 738 aa  331  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  30.52 
 
 		 734 aa  331  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  32.29 
 
 		 710 aa  331  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  30.89 
 
 		 693 aa  330  7e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  32.47 
 
 		 737 aa  328  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  31.9 
 
 		 737 aa  319  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  29.79 
 
 		 763 aa  316  9.999999999999999e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0064  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  30.19 
 
 		 635 aa  313  5.999999999999999e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  30.93 
 
 		 666 aa  303  9e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  32.23 
 
 		 678 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  31.21 
 
 		 673 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  29.62 
 
 		 763 aa  282  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1215  Nitrate reductase  30.16 
 
 		 643 aa  281  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0607485  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  32.34 
 
 		 647 aa  277  4e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>