More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1130 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  59.16 
 
 
691 aa  824    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  60.18 
 
 
670 aa  808    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  61.74 
 
 
698 aa  836    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  59.48 
 
 
692 aa  826    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  60.29 
 
 
703 aa  834    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  59.06 
 
 
691 aa  812    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  59.05 
 
 
691 aa  826    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  65.41 
 
 
707 aa  870    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  58.98 
 
 
692 aa  819    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  60.03 
 
 
691 aa  822    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  67.43 
 
 
703 aa  973    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  71.74 
 
 
705 aa  1024    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  58.73 
 
 
692 aa  824    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  61.07 
 
 
701 aa  850    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  58.87 
 
 
691 aa  823    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  73.7 
 
 
688 aa  1051    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  61.24 
 
 
698 aa  857    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  59.31 
 
 
691 aa  829    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  61.67 
 
 
698 aa  859    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  58.87 
 
 
691 aa  823    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
727 aa  1495    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  75.79 
 
 
694 aa  1079    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  73.7 
 
 
688 aa  1054    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  72.7 
 
 
688 aa  1037    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  67.64 
 
 
680 aa  922    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  71.41 
 
 
695 aa  978    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  59.06 
 
 
691 aa  812    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  59.06 
 
 
691 aa  812    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  48.41 
 
 
690 aa  650    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  53.8 
 
 
692 aa  686    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  58.76 
 
 
691 aa  826    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  45.87 
 
 
708 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  43.68 
 
 
708 aa  558  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  42.64 
 
 
718 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  42.5 
 
 
718 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  42.5 
 
 
718 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  42.05 
 
 
728 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  45.15 
 
 
684 aa  538  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  41.99 
 
 
726 aa  532  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  42.77 
 
 
673 aa  525  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  40.47 
 
 
726 aa  520  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  41.54 
 
 
726 aa  521  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  41.36 
 
 
674 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  39.3 
 
 
710 aa  498  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  39.09 
 
 
720 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  38.76 
 
 
709 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  42.32 
 
 
693 aa  489  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  41.13 
 
 
688 aa  491  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  40.99 
 
 
703 aa  477  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  37.76 
 
 
712 aa  475  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  40.03 
 
 
679 aa  471  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  41.21 
 
 
697 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  39.16 
 
 
674 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  40.29 
 
 
662 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  40.89 
 
 
671 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  39.94 
 
 
668 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  38.96 
 
 
676 aa  438  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  38.85 
 
 
671 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  39.5 
 
 
668 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  33.24 
 
 
734 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  37.91 
 
 
669 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  38.6 
 
 
666 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  38.87 
 
 
667 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  37.92 
 
 
689 aa  398  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  38.28 
 
 
667 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  38.28 
 
 
667 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  37.85 
 
 
708 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  35.46 
 
 
702 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  36.82 
 
 
720 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  35.14 
 
 
703 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  36.14 
 
 
712 aa  379  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  34.37 
 
 
677 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4922  molybdopterin oxidoreductase  38.31 
 
 
700 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400406  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  35.26 
 
 
734 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  35.12 
 
 
695 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4362  molybdopterin oxidoreductase  38.31 
 
 
699 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481133  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  34.81 
 
 
710 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  34.88 
 
 
703 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  38.07 
 
 
679 aa  365  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1053  molybdopterin oxidoreductase  34.68 
 
 
701 aa  364  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62402  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3302  molybdopterin oxidoreductase  33.48 
 
 
697 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  34.77 
 
 
703 aa  357  5.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  34.74 
 
 
706 aa  355  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  34.33 
 
 
693 aa  355  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  34.27 
 
 
704 aa  349  8e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  30.71 
 
 
733 aa  347  4e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  30.57 
 
 
733 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  34.12 
 
 
708 aa  341  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  33.98 
 
 
708 aa  337  5e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  30.4 
 
 
738 aa  335  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  31.35 
 
 
763 aa  332  1e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  31.57 
 
 
737 aa  326  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  31.17 
 
 
737 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  30.61 
 
 
732 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  31.47 
 
 
666 aa  313  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  30.46 
 
 
691 aa  292  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  30.17 
 
 
751 aa  291  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  32.79 
 
 
647 aa  290  7e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  31.86 
 
 
678 aa  290  8e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  27.16 
 
 
763 aa  289  2e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>