More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0547 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  46.21 
 
 
751 aa  699    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  50.81 
 
 
759 aa  797    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  56.64 
 
 
758 aa  865    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  50.94 
 
 
759 aa  797    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  50.67 
 
 
759 aa  794    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
732 aa  1530    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  50.81 
 
 
759 aa  797    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  53.62 
 
 
743 aa  830    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2242  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  52.55 
 
 
750 aa  816    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.514414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0550  Nitrate reductase  42.96 
 
 
680 aa  599  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  40.61 
 
 
678 aa  580  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  40.29 
 
 
677 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  37.39 
 
 
691 aa  520  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2348  molybdopterin oxidoreductase  34.78 
 
 
663 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.316134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0478  molybdopterin oxidoreductase  33.48 
 
 
670 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  32.08 
 
 
666 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  34.28 
 
 
690 aa  353  5.9999999999999994e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  34.62 
 
 
688 aa  343  5e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  33.2 
 
 
703 aa  340  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  32.21 
 
 
669 aa  335  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  33.19 
 
 
691 aa  332  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  31.39 
 
 
734 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  31.24 
 
 
673 aa  330  6e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  32.55 
 
 
691 aa  327  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  32.55 
 
 
691 aa  327  6e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  32.55 
 
 
691 aa  327  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  32.87 
 
 
691 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  31.61 
 
 
668 aa  325  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  31.88 
 
 
688 aa  323  7e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  32.19 
 
 
709 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  31.88 
 
 
688 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  31.46 
 
 
697 aa  321  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  32.59 
 
 
691 aa  320  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1215  Nitrate reductase  31.86 
 
 
643 aa  318  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0607485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  30.98 
 
 
694 aa  318  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  32.96 
 
 
691 aa  317  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  30.58 
 
 
688 aa  317  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  31.55 
 
 
692 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  31.99 
 
 
692 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  33.52 
 
 
708 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  32.73 
 
 
691 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  32.73 
 
 
691 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  30.61 
 
 
727 aa  313  5.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  32.23 
 
 
718 aa  313  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  32.59 
 
 
691 aa  313  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  31.95 
 
 
718 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  31.95 
 
 
718 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  32.37 
 
 
728 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  32.69 
 
 
703 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  32.02 
 
 
703 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1799  molybdopterin oxidoreductase  29.44 
 
 
662 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  31.89 
 
 
708 aa  308  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  32.23 
 
 
701 aa  306  9.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  31.31 
 
 
698 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  31.23 
 
 
692 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  28.94 
 
 
662 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  30.79 
 
 
698 aa  304  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  32.11 
 
 
673 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  30.89 
 
 
698 aa  300  7e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  31.27 
 
 
692 aa  300  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2933  Nitrate reductase  32.24 
 
 
677 aa  298  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.529596  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  30.03 
 
 
705 aa  295  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  31.95 
 
 
670 aa  295  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  30.86 
 
 
684 aa  291  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  30.35 
 
 
695 aa  290  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  30.26 
 
 
710 aa  290  8e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  29 
 
 
720 aa  289  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  29.37 
 
 
800 aa  287  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  29.78 
 
 
726 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  30.11 
 
 
726 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  29.83 
 
 
712 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  29.76 
 
 
680 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  29.78 
 
 
726 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  31 
 
 
674 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  28.68 
 
 
733 aa  280  7e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  28.55 
 
 
733 aa  278  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  29.63 
 
 
671 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  29.21 
 
 
662 aa  276  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2563  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  29.91 
 
 
794 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000909986  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1386  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE  28.54 
 
 
799 aa  273  6e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  28.9 
 
 
667 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  29.52 
 
 
763 aa  264  4.999999999999999e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  29.21 
 
 
676 aa  263  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  28.19 
 
 
654 aa  263  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  29.78 
 
 
679 aa  263  8e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  28.93 
 
 
947 aa  263  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.94 
 
 
671 aa  259  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  28.7 
 
 
737 aa  259  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  28.59 
 
 
674 aa  258  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  29.55 
 
 
669 aa  259  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  29.22 
 
 
737 aa  257  6e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  28.39 
 
 
668 aa  256  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  28.71 
 
 
707 aa  254  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  28.68 
 
 
738 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  27.2 
 
 
818 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  28.94 
 
 
667 aa  253  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0362  molybdopterin oxidoreductase  28.54 
 
 
857 aa  253  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196674  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  28.8 
 
 
667 aa  253  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  29.78 
 
 
708 aa  252  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0127  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  28.63 
 
 
799 aa  252  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>