More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2168 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 693 aa  1424    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  34.06 
 
 		 690 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  34.89 
 
 		 673 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  34 
 
 		 698 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  34.14 
 
 		 698 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  33.38 
 
 		 708 aa  365  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  34.28 
 
 		 698 aa  362  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  34.11 
 
 		 692 aa  362  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  34.72 
 
 		 703 aa  360  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  34.15 
 
 		 701 aa  360  7e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  31.91 
 
 		 718 aa  357  5e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  34.78 
 
 		 692 aa  356  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  34.33 
 
 		 727 aa  355  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  31.77 
 
 		 726 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  32.17 
 
 		 718 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  32.17 
 
 		 718 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  34.64 
 
 		 688 aa  353  5e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  34.59 
 
 		 694 aa  353  5.9999999999999994e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  32.71 
 
 		 691 aa  353  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  34.74 
 
 		 674 aa  352  8.999999999999999e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  32.48 
 
 		 708 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  32.95 
 
 		 691 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  34.73 
 
 		 684 aa  350  5e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  34.96 
 
 		 688 aa  350  7e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  35.26 
 
 		 695 aa  349  8e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  32.14 
 
 		 691 aa  349  8e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  32.14 
 
 		 691 aa  349  8e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  33.72 
 
 		 705 aa  349  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  32.84 
 
 		 668 aa  348  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  33.52 
 
 		 703 aa  348  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  34.96 
 
 		 688 aa  348  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  32.14 
 
 		 691 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  32.05 
 
 		 691 aa  348  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  32.08 
 
 		 692 aa  347  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  32.61 
 
 		 691 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  30.64 
 
 		 726 aa  345  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  33.57 
 
 		 679 aa  344  2.9999999999999997e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  31.66 
 
 		 712 aa  343  5e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  32.02 
 
 		 720 aa  342  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  30.64 
 
 		 726 aa  342  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  32.71 
 
 		 691 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  31.71 
 
 		 692 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  32.71 
 
 		 691 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  32.71 
 
 		 691 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  31.12 
 
 		 728 aa  341  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  30.24 
 
 		 709 aa  340  5e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  34.78 
 
 		 707 aa  339  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  32.54 
 
 		 668 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  32.27 
 
 		 693 aa  337  2.9999999999999997e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  32.04 
 
 		 703 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  30.13 
 
 		 688 aa  335  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  33.09 
 
 		 680 aa  335  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  32.06 
 
 		 662 aa  332  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  30.89 
 
 		 671 aa  330  7e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  31.76 
 
 		 670 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  29.58 
 
 		 733 aa  326  9e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  32.05 
 
 		 671 aa  325  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  29.29 
 
 		 733 aa  323  7e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  33.73 
 
 		 667 aa  323  8e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  31.73 
 
 		 674 aa  323  9.000000000000001e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  33.43 
 
 		 667 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  33.28 
 
 		 667 aa  321  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  33.82 
 
 		 666 aa  321  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  30.2 
 
 		 697 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  31.07 
 
 		 676 aa  312  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  31.39 
 
 		 708 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  28.95 
 
 		 710 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  28.26 
 
 		 734 aa  294  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  30.24 
 
 		 669 aa  294  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  31.32 
 
 		 677 aa  290  4e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  29.39 
 
 		 702 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  29.44 
 
 		 695 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1053  molybdopterin oxidoreductase  28.76 
 
 		 701 aa  287  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  30.24 
 
 		 737 aa  286  8e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  29.77 
 
 		 737 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  28.43 
 
 		 738 aa  280  7e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27.22 
 
 		 763 aa  277  4e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  28.83 
 
 		 703 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  28.63 
 
 		 703 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3302  molybdopterin oxidoreductase  28.28 
 
 		 697 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  28.24 
 
 		 706 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  27.87 
 
 		 720 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  30.3 
 
 		 679 aa  266  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  30.71 
 
 		 647 aa  265  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4922  molybdopterin oxidoreductase  30.18 
 
 		 700 aa  264  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  27.79 
 
 		 708 aa  262  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  27.79 
 
 		 708 aa  260  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  29.34 
 
 		 689 aa  257  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4362  molybdopterin oxidoreductase  29.59 
 
 		 699 aa  257  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  28.14 
 
 		 712 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  28.36 
 
 		 704 aa  254  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  25 
 
 		 763 aa  250  5e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  28.71 
 
 		 703 aa  248  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  26.71 
 
 		 666 aa  248  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  27.45 
 
 		 734 aa  248  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  28.37 
 
 		 710 aa  247  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0064  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  26.11 
 
 		 635 aa  234  3e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  27.79 
 
 		 677 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0127  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  28.33 
 
 		 799 aa  229  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  27.55 
 
 		 668 aa  228  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>