More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0242 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  59.57 
 
 		 733 aa  939    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  59.84 
 
 		 733 aa  941    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  90.51 
 
 		 738 aa  1418    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 737 aa  1550    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  92.94 
 
 		 737 aa  1429    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  38.12 
 
 		 734 aa  490  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  35.29 
 
 		 763 aa  431  1e-119  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  33.43 
 
 		 688 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  33.67 
 
 		 690 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  33.52 
 
 		 703 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  31.18 
 
 		 691 aa  365  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  32.4 
 
 		 697 aa  362  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  32.42 
 
 		 691 aa  361  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  32.42 
 
 		 691 aa  361  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  32.42 
 
 		 691 aa  361  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  31.65 
 
 		 691 aa  360  7e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  31.18 
 
 		 691 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  33.86 
 
 		 703 aa  356  7.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  32.95 
 
 		 701 aa  354  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  32.32 
 
 		 691 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  32.23 
 
 		 698 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  33.57 
 
 		 671 aa  352  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  30.99 
 
 		 692 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  30.6 
 
 		 691 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  32.03 
 
 		 684 aa  350  6e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  32.66 
 
 		 666 aa  350  7e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  32.37 
 
 		 698 aa  349  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  30.75 
 
 		 691 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  30.75 
 
 		 691 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  31.47 
 
 		 692 aa  347  5e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  31.18 
 
 		 670 aa  346  8e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  32.22 
 
 		 694 aa  344  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  32.56 
 
 		 698 aa  343  5.999999999999999e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  32.47 
 
 		 671 aa  342  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  32.7 
 
 		 662 aa  340  7e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  30.37 
 
 		 692 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  32.47 
 
 		 676 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  31.73 
 
 		 688 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  31.69 
 
 		 688 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  30.58 
 
 		 692 aa  336  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  32.46 
 
 		 703 aa  334  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  31.62 
 
 		 673 aa  334  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  31.02 
 
 		 727 aa  333  7.000000000000001e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  31.98 
 
 		 705 aa  331  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  31.5 
 
 		 688 aa  331  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  31.84 
 
 		 668 aa  331  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  30.59 
 
 		 674 aa  328  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  31.26 
 
 		 695 aa  326  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  29.82 
 
 		 708 aa  326  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  30.78 
 
 		 708 aa  326  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  32.13 
 
 		 668 aa  325  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  30.39 
 
 		 726 aa  319  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  31.12 
 
 		 728 aa  318  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  30.14 
 
 		 726 aa  317  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  30.97 
 
 		 718 aa  317  4e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  30.59 
 
 		 709 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  31.32 
 
 		 667 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  30.56 
 
 		 718 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  30.56 
 
 		 718 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  30.63 
 
 		 679 aa  315  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  29.66 
 
 		 726 aa  313  6.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  31.42 
 
 		 667 aa  312  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  31.03 
 
 		 667 aa  310  8e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  29.86 
 
 		 707 aa  309  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  27.96 
 
 		 710 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  28.08 
 
 		 720 aa  308  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  30.87 
 
 		 680 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  29.51 
 
 		 674 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  31.59 
 
 		 669 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  29.96 
 
 		 763 aa  301  3e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  28.27 
 
 		 712 aa  298  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  29.93 
 
 		 693 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  30.46 
 
 		 693 aa  288  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  28.99 
 
 		 647 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  30.22 
 
 		 703 aa  283  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  27.83 
 
 		 666 aa  280  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  30.01 
 
 		 710 aa  277  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  28.92 
 
 		 679 aa  277  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  29.58 
 
 		 695 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  29.47 
 
 		 708 aa  270  7e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  29.17 
 
 		 751 aa  265  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  27.91 
 
 		 708 aa  264  4.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  28.93 
 
 		 732 aa  264  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  27.96 
 
 		 706 aa  263  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  28.53 
 
 		 743 aa  262  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  27.29 
 
 		 712 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  27.76 
 
 		 708 aa  261  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2242  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  27.6 
 
 		 750 aa  261  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.514414  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  27.8 
 
 		 759 aa  261  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  28.25 
 
 		 759 aa  260  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  27.46 
 
 		 734 aa  260  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  28.25 
 
 		 759 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  28.12 
 
 		 759 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  29.17 
 
 		 704 aa  259  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  28.71 
 
 		 758 aa  254  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  28.85 
 
 		 703 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  28.81 
 
 		 720 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  29.2 
 
 		 673 aa  253  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  28.77 
 
 		 692 aa  251  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  28.31 
 
 		 703 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>