More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2208 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 726 aa  1511    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  56.76 
 
 		 708 aa  836    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  56.21 
 
 		 709 aa  839    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  58.2 
 
 		 718 aa  863    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  60.25 
 
 		 720 aa  911    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  57.18 
 
 		 708 aa  837    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  60.49 
 
 		 712 aa  896    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  95.18 
 
 		 726 aa  1451    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  58.2 
 
 		 718 aa  863    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  58.2 
 
 		 718 aa  862    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  57.35 
 
 		 728 aa  847    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  98.9 
 
 		 726 aa  1493    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  60.6 
 
 		 710 aa  904    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  45.42 
 
 		 690 aa  631  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  43.99 
 
 		 703 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  43.81 
 
 		 698 aa  595  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  43.79 
 
 		 701 aa  594  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  42.96 
 
 		 698 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  43 
 
 		 698 aa  588  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  43.58 
 
 		 691 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  42.88 
 
 		 691 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  43.3 
 
 		 691 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  42.88 
 
 		 691 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  43.3 
 
 		 691 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  43.3 
 
 		 691 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  42.74 
 
 		 691 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  42.74 
 
 		 691 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  42.74 
 
 		 691 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  43.34 
 
 		 688 aa  565  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  43.59 
 
 		 688 aa  565  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  42.74 
 
 		 692 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  42.74 
 
 		 691 aa  559  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  42.88 
 
 		 692 aa  561  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  43.57 
 
 		 684 aa  559  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  43.3 
 
 		 688 aa  561  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  42.74 
 
 		 692 aa  554  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  42.17 
 
 		 692 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  42.82 
 
 		 674 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  43.1 
 
 		 694 aa  550  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  42.49 
 
 		 670 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  41.97 
 
 		 705 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  41.73 
 
 		 673 aa  532  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  41.89 
 
 		 703 aa  520  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  41.54 
 
 		 727 aa  521  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  41.73 
 
 		 703 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  41.23 
 
 		 695 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  40.09 
 
 		 680 aa  505  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  41.18 
 
 		 688 aa  499  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  40.85 
 
 		 697 aa  495  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  39.52 
 
 		 707 aa  488  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  38.2 
 
 		 671 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  36.59 
 
 		 662 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  34.25 
 
 		 734 aa  445  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  36.4 
 
 		 671 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  36.8 
 
 		 679 aa  435  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  36.49 
 
 		 693 aa  433  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  36.59 
 
 		 676 aa  435  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  35.32 
 
 		 674 aa  426  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  35.74 
 
 		 669 aa  422  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  36.13 
 
 		 668 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  35.28 
 
 		 668 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  35.51 
 
 		 666 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  34.94 
 
 		 677 aa  391  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  35.91 
 
 		 667 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  35.34 
 
 		 667 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  32.72 
 
 		 720 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  35.05 
 
 		 667 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  34.15 
 
 		 712 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  33.19 
 
 		 702 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  33.81 
 
 		 703 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  34.46 
 
 		 689 aa  371  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  33.01 
 
 		 703 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  33.83 
 
 		 695 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  33 
 
 		 734 aa  366  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  33.29 
 
 		 708 aa  363  6e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  34.32 
 
 		 679 aa  361  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  32.85 
 
 		 703 aa  349  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3302  molybdopterin oxidoreductase  31.44 
 
 		 697 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4922  molybdopterin oxidoreductase  33.61 
 
 		 700 aa  346  8e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400406  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  30.64 
 
 		 693 aa  345  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  31.64 
 
 		 704 aa  344  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  33.71 
 
 		 710 aa  343  7e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1053  molybdopterin oxidoreductase  31.65 
 
 		 701 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4362  molybdopterin oxidoreductase  34.18 
 
 		 699 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  29.27 
 
 		 763 aa  335  1e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  28.63 
 
 		 733 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  28.49 
 
 		 733 aa  320  7e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  30.26 
 
 		 706 aa  318  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  30.26 
 
 		 763 aa  309  1.0000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  30.38 
 
 		 737 aa  308  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3420  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  61.14 
 
 		 234 aa  306  7e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.2 
 
 		 708 aa  306  7e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  30.06 
 
 		 708 aa  301  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  30.67 
 
 		 666 aa  301  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  29.86 
 
 		 737 aa  300  6e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  31.39 
 
 		 678 aa  299  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  28.88 
 
 		 738 aa  298  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  29.62 
 
 		 691 aa  286  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  30.69 
 
 		 677 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  29.78 
 
 		 732 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>