More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3420 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3420  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  100 
 
 		 234 aa  490  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  76 
 
 		 718 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  76 
 
 		 718 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  76 
 
 		 718 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  74.67 
 
 		 728 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  63.36 
 
 		 710 aa  332  3e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  63.44 
 
 		 709 aa  321  6e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  60.7 
 
 		 712 aa  316  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  61.57 
 
 		 726 aa  309  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  61.14 
 
 		 726 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  59.13 
 
 		 720 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  60.7 
 
 		 726 aa  305  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  59.19 
 
 		 708 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  57.59 
 
 		 708 aa  292  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  46.05 
 
 		 690 aa  230  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  45.61 
 
 		 688 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  48.03 
 
 		 701 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  45.61 
 
 		 698 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  47.6 
 
 		 703 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  45.18 
 
 		 698 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  44.74 
 
 		 698 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  44.69 
 
 		 680 aa  215  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  47.56 
 
 		 674 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  45.95 
 
 		 694 aa  209  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  47.53 
 
 		 673 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  42.22 
 
 		 691 aa  207  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  44.26 
 
 		 691 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  44.75 
 
 		 662 aa  206  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  41.78 
 
 		 691 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  41.78 
 
 		 691 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  41.78 
 
 		 691 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  45.74 
 
 		 692 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  42.98 
 
 		 692 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  43.56 
 
 		 688 aa  204  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  43.36 
 
 		 688 aa  204  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  41.81 
 
 		 705 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  42.55 
 
 		 691 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  41.81 
 
 		 691 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  41.33 
 
 		 727 aa  200  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  41.7 
 
 		 688 aa  200  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  41.78 
 
 		 697 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  42.22 
 
 		 703 aa  199  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  43.4 
 
 		 691 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  42.98 
 
 		 691 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  42.98 
 
 		 691 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  40.95 
 
 		 692 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  40.52 
 
 		 692 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  43.04 
 
 		 707 aa  191  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  39.56 
 
 		 703 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  44.89 
 
 		 684 aa  190  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  41.44 
 
 		 671 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  41.33 
 
 		 668 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  41.33 
 
 		 668 aa  185  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  40.53 
 
 		 695 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  37.72 
 
 		 671 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  40.18 
 
 		 679 aa  181  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  41.1 
 
 		 734 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  36.94 
 
 		 669 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  37.17 
 
 		 666 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  37.5 
 
 		 676 aa  174  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  36.61 
 
 		 667 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  36.09 
 
 		 674 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  38.08 
 
 		 693 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  36.16 
 
 		 667 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  36.16 
 
 		 667 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  39.02 
 
 		 670 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  40.09 
 
 		 677 aa  168  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  37.44 
 
 		 693 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  42.24 
 
 		 732 aa  158  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  35.11 
 
 		 738 aa  153  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  35.16 
 
 		 763 aa  152  5e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  36 
 
 		 654 aa  150  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  35.16 
 
 		 737 aa  149  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  35.98 
 
 		 695 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  34.25 
 
 		 737 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  37.95 
 
 		 763 aa  148  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  34.45 
 
 		 703 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  35.02 
 
 		 702 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  34.78 
 
 		 720 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  37.23 
 
 		 677 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  34.51 
 
 		 669 aa  142  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  31.7 
 
 		 733 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  31.7 
 
 		 733 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  35.71 
 
 		 689 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  35.11 
 
 		 666 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  33.62 
 
 		 712 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  36.32 
 
 		 691 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1799  molybdopterin oxidoreductase  33.63 
 
 		 662 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  33.62 
 
 		 734 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  32.6 
 
 		 662 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  35.56 
 
 		 668 aa  135  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  34.75 
 
 		 703 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  38.22 
 
 		 679 aa  135  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  38.33 
 
 		 759 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  38.33 
 
 		 759 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  38.33 
 
 		 759 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  38.33 
 
 		 759 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  36.24 
 
 		 818 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02420  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  35.65 
 
 		 824 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 		 703 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>