More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2470 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
751 aa  1565    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2242  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  55.13 
 
 
750 aa  849    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.514414  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  53.14 
 
 
759 aa  825    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  57.87 
 
 
743 aa  897    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  46.21 
 
 
732 aa  704    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  57.67 
 
 
758 aa  913    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  53 
 
 
759 aa  824    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  52.87 
 
 
759 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  53.27 
 
 
759 aa  828    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0550  Nitrate reductase  38.18 
 
 
680 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  37.9 
 
 
678 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  37.72 
 
 
677 aa  481  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  35.41 
 
 
691 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2348  molybdopterin oxidoreductase  31.49 
 
 
663 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.316134  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  32.08 
 
 
669 aa  362  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0478  molybdopterin oxidoreductase  32.46 
 
 
670 aa  355  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  32.94 
 
 
666 aa  354  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  30.97 
 
 
688 aa  303  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  30.97 
 
 
688 aa  301  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  30.1 
 
 
734 aa  300  8e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  32.39 
 
 
673 aa  296  8e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  32.49 
 
 
703 aa  294  5e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1215  Nitrate reductase  28.44 
 
 
643 aa  292  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0607485  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  31.29 
 
 
692 aa  292  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  29.67 
 
 
690 aa  291  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  30.17 
 
 
727 aa  291  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  32.16 
 
 
684 aa  291  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1799  molybdopterin oxidoreductase  29.19 
 
 
662 aa  288  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  31.26 
 
 
673 aa  283  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  29.83 
 
 
694 aa  280  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  30.91 
 
 
703 aa  280  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  32.57 
 
 
688 aa  280  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  28.15 
 
 
662 aa  280  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  30.19 
 
 
698 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  29.97 
 
 
698 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  31.88 
 
 
708 aa  279  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  32.02 
 
 
718 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  32.02 
 
 
718 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  31.28 
 
 
697 aa  278  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  31.91 
 
 
708 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  32.02 
 
 
718 aa  277  5e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  29.4 
 
 
733 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  29.33 
 
 
698 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  29.94 
 
 
668 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  29.26 
 
 
733 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  32.18 
 
 
728 aa  273  9e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2933  Nitrate reductase  29.7 
 
 
677 aa  272  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.529596  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  28.65 
 
 
688 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  30.04 
 
 
726 aa  269  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  28.61 
 
 
691 aa  265  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  29.09 
 
 
737 aa  264  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  28.15 
 
 
691 aa  263  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  29.11 
 
 
692 aa  262  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  28.65 
 
 
674 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  28.85 
 
 
692 aa  261  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  28.76 
 
 
691 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  29.97 
 
 
726 aa  260  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  29.42 
 
 
709 aa  259  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  28.13 
 
 
691 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  28.79 
 
 
737 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  28.71 
 
 
701 aa  258  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  29.1 
 
 
695 aa  258  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  27.71 
 
 
691 aa  257  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  27.71 
 
 
691 aa  257  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  27.71 
 
 
691 aa  257  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  29.67 
 
 
726 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  29.39 
 
 
654 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  30.34 
 
 
662 aa  255  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  29.37 
 
 
703 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  27.68 
 
 
705 aa  254  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  28.49 
 
 
691 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  27.73 
 
 
738 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  28.35 
 
 
691 aa  254  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  28.35 
 
 
691 aa  254  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  28.82 
 
 
947 aa  253  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.07 
 
 
671 aa  251  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  30.46 
 
 
667 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  30.18 
 
 
667 aa  250  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3449  molybdopterin oxidoreductase  28.68 
 
 
650 aa  249  9e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  30.82 
 
 
671 aa  249  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  29.44 
 
 
680 aa  249  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  27.81 
 
 
692 aa  248  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  29.7 
 
 
679 aa  248  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  30.62 
 
 
666 aa  247  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  31.13 
 
 
667 aa  245  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  29.25 
 
 
676 aa  244  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  28.68 
 
 
710 aa  244  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  27.96 
 
 
720 aa  243  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  27.9 
 
 
670 aa  241  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  28.43 
 
 
712 aa  241  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  29.65 
 
 
668 aa  240  8e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  28.99 
 
 
668 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  29.29 
 
 
763 aa  239  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  28.57 
 
 
669 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  27.94 
 
 
695 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  29.06 
 
 
674 aa  236  8e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  26.64 
 
 
818 aa  236  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1386  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE  28.85 
 
 
799 aa  234  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1612  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  30.09 
 
 
820 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  28.04 
 
 
747 aa  228  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>