More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0478 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0478  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
670 aa  1384    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  35.82 
 
 
678 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  35.52 
 
 
677 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  33.48 
 
 
732 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0550  Nitrate reductase  35.87 
 
 
680 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  32.57 
 
 
758 aa  381  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  33.19 
 
 
691 aa  379  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  32.72 
 
 
743 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  32.1 
 
 
759 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  32.1 
 
 
759 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  32.1 
 
 
759 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  32.1 
 
 
759 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2242  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  31.6 
 
 
750 aa  360  7e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.514414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  32.46 
 
 
751 aa  355  2e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2348  molybdopterin oxidoreductase  32.15 
 
 
663 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.316134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  30.19 
 
 
666 aa  276  8e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  30.16 
 
 
669 aa  266  7e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  27.67 
 
 
726 aa  241  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  27.85 
 
 
726 aa  239  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1215  Nitrate reductase  27.83 
 
 
643 aa  238  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0607485  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  27.53 
 
 
726 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  28.33 
 
 
701 aa  233  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  27.3 
 
 
691 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  27.3 
 
 
691 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  27.3 
 
 
691 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  27.6 
 
 
691 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2933  Nitrate reductase  29.31 
 
 
677 aa  231  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.529596  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  27.08 
 
 
691 aa  230  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  27.4 
 
 
691 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  30.04 
 
 
666 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  28.03 
 
 
708 aa  226  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  27.12 
 
 
691 aa  227  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  27.12 
 
 
691 aa  227  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  27.7 
 
 
671 aa  225  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  28.21 
 
 
688 aa  224  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  26.91 
 
 
691 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  26.71 
 
 
691 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  27.25 
 
 
703 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  27.16 
 
 
688 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  27.16 
 
 
688 aa  221  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  27.2 
 
 
698 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  27.11 
 
 
674 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  28.65 
 
 
667 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  28.16 
 
 
703 aa  221  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  27.64 
 
 
673 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  26.82 
 
 
676 aa  219  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.01 
 
 
671 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  25.56 
 
 
692 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  26.54 
 
 
698 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  26.87 
 
 
720 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  25.98 
 
 
734 aa  217  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  27.97 
 
 
703 aa  217  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  27.21 
 
 
698 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  28.51 
 
 
667 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  25.07 
 
 
692 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  26.97 
 
 
728 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  27.61 
 
 
709 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  28.36 
 
 
667 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  26.83 
 
 
727 aa  214  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  27.58 
 
 
703 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  26.37 
 
 
708 aa  214  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  26.38 
 
 
688 aa  214  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  27.25 
 
 
718 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  27.25 
 
 
718 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  27.25 
 
 
718 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  27.32 
 
 
669 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  26.04 
 
 
668 aa  212  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  26.38 
 
 
695 aa  212  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  28.3 
 
 
684 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  29.4 
 
 
668 aa  211  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  27.46 
 
 
662 aa  210  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  25.24 
 
 
692 aa  210  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  26.44 
 
 
680 aa  210  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  26.63 
 
 
662 aa  210  7e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  26.94 
 
 
670 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  28.04 
 
 
947 aa  209  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  27.12 
 
 
710 aa  209  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  26.19 
 
 
673 aa  208  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  26.6 
 
 
694 aa  208  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  28.67 
 
 
668 aa  208  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  26.17 
 
 
712 aa  208  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3449  molybdopterin oxidoreductase  29 
 
 
650 aa  207  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  26.57 
 
 
720 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  27.45 
 
 
697 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1799  molybdopterin oxidoreductase  26.39 
 
 
662 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.25 
 
 
679 aa  207  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  25.92 
 
 
703 aa  207  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  26.78 
 
 
706 aa  205  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  26.77 
 
 
690 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  27.1 
 
 
674 aa  203  9e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  25.78 
 
 
702 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  25.97 
 
 
708 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  27.51 
 
 
705 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  25.39 
 
 
703 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  26.7 
 
 
693 aa  201  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  26.25 
 
 
710 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 
692 aa  201  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  26.01 
 
 
708 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  26.04 
 
 
763 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  26.93 
 
 
679 aa  195  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>