More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2348 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2348  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
663 aa  1380    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.316134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  44.41 
 
 
677 aa  543  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  34.78 
 
 
732 aa  442  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  33.79 
 
 
759 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  33.94 
 
 
759 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  33.79 
 
 
759 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  33.79 
 
 
759 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  34.56 
 
 
678 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  33.18 
 
 
743 aa  405  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  34.59 
 
 
691 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  32.16 
 
 
758 aa  391  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2242  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  31.22 
 
 
750 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.514414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  31.49 
 
 
751 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0550  Nitrate reductase  38.87 
 
 
680 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0478  molybdopterin oxidoreductase  32.15 
 
 
670 aa  342  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  29.61 
 
 
669 aa  298  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  29.41 
 
 
666 aa  296  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  32.46 
 
 
673 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  28.61 
 
 
668 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1215  Nitrate reductase  31.49 
 
 
643 aa  266  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0607485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  28.28 
 
 
734 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  30.9 
 
 
654 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  29.25 
 
 
709 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2933  Nitrate reductase  29.01 
 
 
677 aa  238  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.529596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1799  molybdopterin oxidoreductase  28.21 
 
 
662 aa  233  9e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  28.81 
 
 
662 aa  233  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  28.7 
 
 
710 aa  231  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  32.49 
 
 
688 aa  228  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  26.53 
 
 
708 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  30.61 
 
 
690 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  31.06 
 
 
671 aa  223  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  28.08 
 
 
947 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  30.85 
 
 
692 aa  219  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  28.47 
 
 
718 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  28.32 
 
 
718 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  27.12 
 
 
726 aa  219  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  28.32 
 
 
718 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  31.24 
 
 
708 aa  219  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0064  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  30.72 
 
 
635 aa  218  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3195  molybdopterin oxidoreductase  30.17 
 
 
637 aa  217  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  28.37 
 
 
662 aa  217  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  30.19 
 
 
684 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  32.07 
 
 
728 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  30.33 
 
 
697 aa  214  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  28.44 
 
 
674 aa  213  7.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0448  molybdopterin oxidoreductase  26.02 
 
 
661 aa  211  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  30.77 
 
 
726 aa  209  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  29.44 
 
 
673 aa  209  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  30.61 
 
 
703 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  30.57 
 
 
726 aa  209  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  28.52 
 
 
737 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  26.55 
 
 
679 aa  207  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  31.14 
 
 
712 aa  207  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.03 
 
 
671 aa  207  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3449  molybdopterin oxidoreductase  26.58 
 
 
650 aa  206  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  31.38 
 
 
720 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  28.57 
 
 
737 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  26.34 
 
 
691 aa  204  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  25.99 
 
 
763 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  27 
 
 
698 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  26.24 
 
 
647 aa  201  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  25.32 
 
 
691 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  25.32 
 
 
691 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  25.32 
 
 
691 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  27.97 
 
 
733 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  25.6 
 
 
698 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  26.28 
 
 
698 aa  198  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  26.06 
 
 
676 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  28.9 
 
 
674 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  30.06 
 
 
667 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  30.27 
 
 
667 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  30.27 
 
 
667 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  27.59 
 
 
733 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  26.83 
 
 
738 aa  193  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  25.42 
 
 
677 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3153  molybdopterin oxidoreductase  26.05 
 
 
689 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  27.18 
 
 
695 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  24.71 
 
 
692 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  25.67 
 
 
688 aa  191  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  25.42 
 
 
703 aa  190  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  25.43 
 
 
691 aa  190  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  26.66 
 
 
689 aa  190  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0177  molybdopterin oxidoreductase  28.33 
 
 
633 aa  189  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  28.23 
 
 
701 aa  188  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  25.19 
 
 
694 aa  188  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  28.66 
 
 
668 aa  187  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  26.14 
 
 
669 aa  187  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  26.66 
 
 
777 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  26.95 
 
 
666 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0753  Nitrate reductase  28.72 
 
 
639 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  24.7 
 
 
691 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  26.46 
 
 
693 aa  183  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  26.87 
 
 
695 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  24.53 
 
 
688 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  27.77 
 
 
776 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  24.53 
 
 
688 aa  180  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  25.04 
 
 
691 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  23.97 
 
 
692 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  25.14 
 
 
691 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 
703 aa  177  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>