More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0448 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0448  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
661 aa  1330    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468926 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1523  molybdopterin oxidoreductase  57.19 
 
 
642 aa  722    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3195  molybdopterin oxidoreductase  44.43 
 
 
637 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0177  molybdopterin oxidoreductase  44.68 
 
 
633 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2090  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  43.35 
 
 
645 aa  482  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0753  Nitrate reductase  38.76 
 
 
639 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  29.84 
 
 
666 aa  300  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  33.38 
 
 
654 aa  298  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  29.09 
 
 
669 aa  286  5.999999999999999e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  31.14 
 
 
673 aa  282  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2933  Nitrate reductase  33.98 
 
 
677 aa  278  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.529596  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  29.26 
 
 
668 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  32.19 
 
 
947 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3449  molybdopterin oxidoreductase  31.68 
 
 
650 aa  257  5e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1215  Nitrate reductase  27.16 
 
 
643 aa  257  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0607485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  26.82 
 
 
662 aa  254  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1799  molybdopterin oxidoreductase  26.68 
 
 
662 aa  246  9e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  30.14 
 
 
678 aa  219  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  27.93 
 
 
677 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  27.44 
 
 
758 aa  213  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  30.33 
 
 
684 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  27.82 
 
 
691 aa  207  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  29.26 
 
 
759 aa  207  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.8 
 
 
671 aa  206  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  28.55 
 
 
674 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  28.93 
 
 
759 aa  203  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  28.18 
 
 
673 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  29.1 
 
 
759 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  30.4 
 
 
667 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  28.93 
 
 
759 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  28.21 
 
 
662 aa  201  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2242  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  25.67 
 
 
750 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.514414  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.73 
 
 
679 aa  198  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2348  molybdopterin oxidoreductase  26.02 
 
 
663 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.316134  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  26.87 
 
 
743 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  27.33 
 
 
674 aa  194  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  29.71 
 
 
667 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  27.84 
 
 
671 aa  192  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  27.61 
 
 
676 aa  192  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  29.56 
 
 
667 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  28.08 
 
 
692 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  24.54 
 
 
732 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  29.37 
 
 
718 aa  188  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  29.37 
 
 
718 aa  188  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 
691 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  26.32 
 
 
691 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 
691 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  27.65 
 
 
751 aa  187  5e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  27.39 
 
 
693 aa  187  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  29.81 
 
 
666 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0550  Nitrate reductase  27.77 
 
 
680 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  26.22 
 
 
691 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  29 
 
 
718 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  26.69 
 
 
691 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  27.46 
 
 
690 aa  183  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  28.73 
 
 
691 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  29.22 
 
 
698 aa  178  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  28.73 
 
 
691 aa  178  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  29.69 
 
 
670 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  25.84 
 
 
708 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  29.1 
 
 
703 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0064  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  27.57 
 
 
635 aa  176  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  27.83 
 
 
669 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  28.91 
 
 
691 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  28.47 
 
 
728 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  28.51 
 
 
703 aa  175  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  25.62 
 
 
709 aa  173  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  28.36 
 
 
691 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  28.36 
 
 
691 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  30.3 
 
 
698 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  30.64 
 
 
698 aa  170  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  31.01 
 
 
697 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0478  molybdopterin oxidoreductase  25.56 
 
 
670 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  27.73 
 
 
694 aa  169  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  25.25 
 
 
734 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  30.33 
 
 
680 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  26.45 
 
 
692 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  27.09 
 
 
688 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  28.95 
 
 
701 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  27.04 
 
 
692 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  27.09 
 
 
688 aa  164  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  25.66 
 
 
708 aa  164  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  26.31 
 
 
688 aa  163  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  27.59 
 
 
726 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  28.31 
 
 
692 aa  162  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  30.93 
 
 
727 aa  162  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  26.59 
 
 
668 aa  160  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  28.22 
 
 
720 aa  160  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  27.46 
 
 
693 aa  158  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  27.26 
 
 
677 aa  158  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  27.83 
 
 
668 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  27.24 
 
 
726 aa  157  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  27.1 
 
 
726 aa  156  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  28.33 
 
 
712 aa  156  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  26.75 
 
 
695 aa  154  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  26.26 
 
 
703 aa  154  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  27.45 
 
 
647 aa  152  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  24.86 
 
 
705 aa  151  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  26.6 
 
 
710 aa  150  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  26.73 
 
 
688 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>