More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2090 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2090  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
645 aa  1325    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1523  molybdopterin oxidoreductase  48.34 
 
 
642 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3195  molybdopterin oxidoreductase  45.2 
 
 
637 aa  520  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0448  molybdopterin oxidoreductase  43.35 
 
 
661 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468926 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0177  molybdopterin oxidoreductase  42.65 
 
 
633 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0753  Nitrate reductase  40.94 
 
 
639 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3449  molybdopterin oxidoreductase  30.93 
 
 
650 aa  282  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  29.42 
 
 
666 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  32.43 
 
 
654 aa  267  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  31.55 
 
 
947 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  30.65 
 
 
673 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2933  Nitrate reductase  30.87 
 
 
677 aa  257  6e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.529596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  28.05 
 
 
669 aa  249  8e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  29.06 
 
 
668 aa  247  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  25.71 
 
 
662 aa  243  6e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1799  molybdopterin oxidoreductase  25.85 
 
 
662 aa  239  9e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1215  Nitrate reductase  27.62 
 
 
643 aa  237  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0607485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  28.01 
 
 
671 aa  212  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  27.54 
 
 
674 aa  211  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  27.25 
 
 
678 aa  207  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.74 
 
 
679 aa  201  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  28.64 
 
 
666 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  26.67 
 
 
702 aa  193  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.44 
 
 
671 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  27.48 
 
 
667 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  24.96 
 
 
732 aa  191  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0550  Nitrate reductase  26.66 
 
 
680 aa  187  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  24.86 
 
 
759 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  27.23 
 
 
691 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  27.63 
 
 
691 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  26.06 
 
 
691 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  27.52 
 
 
684 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  28.04 
 
 
667 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  27.89 
 
 
667 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  25.98 
 
 
676 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  25 
 
 
759 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  27.02 
 
 
691 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  26.64 
 
 
690 aa  184  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  27.79 
 
 
692 aa  184  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  24.72 
 
 
759 aa  183  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  26.52 
 
 
662 aa  183  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0478  molybdopterin oxidoreductase  27 
 
 
670 aa  183  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  24.57 
 
 
759 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  26.79 
 
 
668 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 
691 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  26.92 
 
 
691 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 
691 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  27.1 
 
 
668 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  26.7 
 
 
691 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  26.7 
 
 
691 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1630  molybdopterin oxidoreductase  28.9 
 
 
677 aa  181  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.693715  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  26.43 
 
 
674 aa  180  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  27.25 
 
 
698 aa  179  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  26.54 
 
 
703 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  27.56 
 
 
693 aa  179  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  24.36 
 
 
758 aa  179  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  26.89 
 
 
693 aa  178  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  24.71 
 
 
677 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  26.82 
 
 
688 aa  177  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  26.82 
 
 
688 aa  177  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  26.55 
 
 
691 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  25.74 
 
 
669 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  25.55 
 
 
673 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  25.47 
 
 
708 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  25.78 
 
 
703 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  27.06 
 
 
692 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  26.83 
 
 
698 aa  173  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  26.6 
 
 
698 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  27.23 
 
 
727 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  27.15 
 
 
708 aa  172  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  27.55 
 
 
695 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  26.75 
 
 
691 aa  171  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  26.24 
 
 
670 aa  170  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  27.75 
 
 
688 aa  170  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  25.5 
 
 
688 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  25.35 
 
 
712 aa  169  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  25.5 
 
 
697 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  25.98 
 
 
692 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3302  molybdopterin oxidoreductase  24.82 
 
 
697 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  24.86 
 
 
703 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  27.35 
 
 
751 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0064  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  23.54 
 
 
635 aa  164  5.0000000000000005e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  24.86 
 
 
720 aa  164  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1026  molybdopterin oxidoreductase  28.17 
 
 
630 aa  163  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0299626 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  26.44 
 
 
708 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  23.3 
 
 
734 aa  163  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2348  molybdopterin oxidoreductase  27.18 
 
 
663 aa  162  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.316134  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1053  molybdopterin oxidoreductase  25.39 
 
 
701 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62402  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  24.89 
 
 
695 aa  160  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  26.04 
 
 
703 aa  160  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  26.26 
 
 
703 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  25.63 
 
 
694 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  24.75 
 
 
720 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  22.96 
 
 
763 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  26.5 
 
 
679 aa  157  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  24.66 
 
 
743 aa  156  9e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0159  molybdopterin oxidoreductase  25.08 
 
 
608 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2242  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  23.66 
 
 
750 aa  154  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.514414  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  26.73 
 
 
709 aa  154  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  23.77 
 
 
738 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>