More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1245 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3449  molybdopterin oxidoreductase  71.52 
 
 		 650 aa  917    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 947 aa  1929    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  33.68 
 
 		 666 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  37.18 
 
 		 654 aa  389  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  34.78 
 
 		 673 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  31.72 
 
 		 669 aa  350  6e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  31.79 
 
 		 668 aa  337  5e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1215  Nitrate reductase  32.65 
 
 		 643 aa  328  3e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0607485  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  33.53 
 
 		 684 aa  318  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  28.87 
 
 		 662 aa  311  4e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1799  molybdopterin oxidoreductase  28.72 
 
 		 662 aa  306  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2933  Nitrate reductase  33.28 
 
 		 677 aa  300  7e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.529596  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  31.3 
 
 		 674 aa  293  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1523  molybdopterin oxidoreductase  33.13 
 
 		 642 aa  286  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  32.29 
 
 		 697 aa  285  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0177  molybdopterin oxidoreductase  32.14 
 
 		 633 aa  282  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  30.81 
 
 		 673 aa  281  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  32.42 
 
 		 698 aa  279  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3195  molybdopterin oxidoreductase  32.42 
 
 		 637 aa  278  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  30.12 
 
 		 678 aa  278  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  31.09 
 
 		 703 aa  275  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  30.1 
 
 		 708 aa  275  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  29.9 
 
 		 709 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  28.7 
 
 		 759 aa  273  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  28.89 
 
 		 690 aa  272  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  32.74 
 
 		 671 aa  272  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  30.48 
 
 		 708 aa  272  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  30.81 
 
 		 674 aa  271  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2242  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  28.98 
 
 		 750 aa  271  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.514414  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  31.21 
 
 		 701 aa  271  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0448  molybdopterin oxidoreductase  32.19 
 
 		 661 aa  271  5e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468926 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  28.55 
 
 		 759 aa  270  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  28.4 
 
 		 759 aa  270  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  28.4 
 
 		 759 aa  269  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  29.08 
 
 		 743 aa  268  4e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  28.93 
 
 		 732 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  30.92 
 
 		 698 aa  265  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  31.6 
 
 		 693 aa  265  3e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  29.67 
 
 		 726 aa  265  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  30.6 
 
 		 703 aa  264  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  30.85 
 
 		 698 aa  263  8e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  30.43 
 
 		 679 aa  261  4e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  32.28 
 
 		 671 aa  259  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  28.83 
 
 		 726 aa  259  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2090  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  31.34 
 
 		 645 aa  259  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  29.2 
 
 		 720 aa  258  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  27.74 
 
 		 758 aa  258  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  28.68 
 
 		 726 aa  257  7e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  30.7 
 
 		 662 aa  257  8e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  30.17 
 
 		 712 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  32.64 
 
 		 666 aa  254  7e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  28.77 
 
 		 751 aa  253  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  29.3 
 
 		 691 aa  252  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  30.81 
 
 		 692 aa  250  8e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  32.99 
 
 		 667 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  28.65 
 
 		 710 aa  249  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  29.72 
 
 		 691 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  29.72 
 
 		 691 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  29.72 
 
 		 691 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  29.69 
 
 		 688 aa  248  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  32.84 
 
 		 667 aa  248  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  32.84 
 
 		 667 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0550  Nitrate reductase  30.56 
 
 		 680 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  28.91 
 
 		 718 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  28.91 
 
 		 718 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  28.91 
 
 		 718 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  29.03 
 
 		 728 aa  246  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  30.32 
 
 		 676 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  28.51 
 
 		 691 aa  244  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  29.32 
 
 		 688 aa  241  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  27.72 
 
 		 734 aa  240  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  29.84 
 
 		 688 aa  240  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  29.69 
 
 		 688 aa  239  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  29.17 
 
 		 691 aa  238  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  28.18 
 
 		 691 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  26.49 
 
 		 691 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0753  Nitrate reductase  27.94 
 
 		 639 aa  233  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  30.47 
 
 		 668 aa  231  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  28.1 
 
 		 669 aa  230  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  30.03 
 
 		 668 aa  230  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  28.47 
 
 		 677 aa  230  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  28.82 
 
 		 680 aa  229  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  28.47 
 
 		 691 aa  228  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  29.96 
 
 		 695 aa  228  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  28.32 
 
 		 692 aa  226  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  28.18 
 
 		 691 aa  225  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  28.18 
 
 		 691 aa  225  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  29.59 
 
 		 694 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  28.15 
 
 		 692 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  28.99 
 
 		 670 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  28.2 
 
 		 712 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3238  molybdopterin oxidoreductase  30.03 
 
 		 679 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  28.14 
 
 		 704 aa  216  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  27.19 
 
 		 703 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  28.05 
 
 		 705 aa  215  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  26.71 
 
 		 733 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  27.18 
 
 		 692 aa  214  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.76 
 
 		 763 aa  213  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  27.59 
 
 		 734 aa  213  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  26.43 
 
 		 733 aa  213  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>