More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2365 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
777 aa  1616    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  46.99 
 
 
753 aa  709    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  52.71 
 
 
776 aa  840    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  49.87 
 
 
794 aa  768    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  46.06 
 
 
747 aa  629  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  46.46 
 
 
744 aa  618  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  43.87 
 
 
756 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  41.07 
 
 
755 aa  538  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  39.77 
 
 
791 aa  537  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  33.47 
 
 
729 aa  379  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  35.02 
 
 
747 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  32.98 
 
 
745 aa  363  9e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  32.38 
 
 
698 aa  352  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  32.43 
 
 
739 aa  348  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  31.97 
 
 
891 aa  342  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  33.06 
 
 
700 aa  340  5.9999999999999996e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  32.83 
 
 
726 aa  317  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  31.05 
 
 
1055 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  32.23 
 
 
711 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  30.97 
 
 
1139 aa  301  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  32.51 
 
 
1135 aa  296  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  30.9 
 
 
1143 aa  296  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  28.76 
 
 
791 aa  266  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  29.28 
 
 
749 aa  265  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  29.43 
 
 
731 aa  258  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  29.05 
 
 
734 aa  258  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  28.77 
 
 
898 aa  249  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  28.32 
 
 
759 aa  243  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  28.18 
 
 
759 aa  242  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  28.18 
 
 
759 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  28.05 
 
 
694 aa  239  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  28.29 
 
 
709 aa  238  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  27.94 
 
 
759 aa  238  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  29.31 
 
 
718 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  28.67 
 
 
761 aa  235  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  29.31 
 
 
718 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  29.55 
 
 
718 aa  234  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  28.61 
 
 
732 aa  231  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  28.99 
 
 
728 aa  228  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  27.57 
 
 
691 aa  228  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  27.57 
 
 
691 aa  228  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  27.57 
 
 
691 aa  228  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  25.76 
 
 
692 aa  227  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  29.12 
 
 
751 aa  226  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  27.72 
 
 
691 aa  225  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  28.54 
 
 
807 aa  224  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  26.98 
 
 
673 aa  224  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  28.67 
 
 
708 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  27.49 
 
 
691 aa  221  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  28.05 
 
 
720 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  27.54 
 
 
690 aa  219  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  27.07 
 
 
691 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  26.79 
 
 
685 aa  218  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  28.04 
 
 
743 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  26.38 
 
 
698 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  27.13 
 
 
692 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2242  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  27.03 
 
 
750 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.514414  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  27.27 
 
 
692 aa  213  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  25.71 
 
 
758 aa  213  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  26.52 
 
 
698 aa  211  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  27.4 
 
 
708 aa  211  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  26.1 
 
 
698 aa  211  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  26.54 
 
 
703 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  26.83 
 
 
684 aa  208  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  28.35 
 
 
803 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  27.73 
 
 
759 aa  207  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  26.71 
 
 
692 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  26.83 
 
 
691 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  26.83 
 
 
691 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  27.41 
 
 
731 aa  204  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  26.83 
 
 
691 aa  204  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  25.9 
 
 
674 aa  203  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  26.56 
 
 
701 aa  203  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  28.23 
 
 
730 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  27.02 
 
 
739 aa  201  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  25.69 
 
 
691 aa  201  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3747  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  28.21 
 
 
793 aa  200  7e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  26.11 
 
 
670 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.3 
 
 
685 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  26.07 
 
 
726 aa  198  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  26.91 
 
 
712 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  27.72 
 
 
899 aa  196  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  25.46 
 
 
726 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  25.21 
 
 
688 aa  196  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  25.71 
 
 
726 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0422  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.24 
 
 
806 aa  196  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0580651  decreased coverage  0.000000000595111 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  25.21 
 
 
688 aa  195  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  27.21 
 
 
758 aa  195  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  26.34 
 
 
692 aa  195  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2256  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.18 
 
 
816 aa  194  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2788  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.54 
 
 
792 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2900  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.54 
 
 
792 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735186  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3153  molybdopterin oxidoreductase  25.72 
 
 
689 aa  193  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27350  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  31.32 
 
 
1023 aa  193  9e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  25.95 
 
 
695 aa  193  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  27.07 
 
 
758 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2725  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.54 
 
 
792 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2769  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.54 
 
 
792 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  27.07 
 
 
758 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2297  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.68 
 
 
798 aa  192  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000563804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>