More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2511 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  50 
 
 
794 aa  778    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
776 aa  1619    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  52.71 
 
 
777 aa  840    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  45.38 
 
 
747 aa  656    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  49.53 
 
 
753 aa  750    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  46.43 
 
 
744 aa  625  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  44.18 
 
 
756 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  41.36 
 
 
791 aa  558  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  39.28 
 
 
755 aa  496  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  36.28 
 
 
745 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  35.29 
 
 
747 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  34.49 
 
 
729 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  31.12 
 
 
698 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  32.36 
 
 
739 aa  342  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  32.15 
 
 
700 aa  332  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  31.24 
 
 
726 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  29.54 
 
 
891 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  30.49 
 
 
1139 aa  293  8e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  30.98 
 
 
1143 aa  293  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  31.09 
 
 
711 aa  291  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  29.72 
 
 
749 aa  284  6.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  31.45 
 
 
1135 aa  279  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  29.54 
 
 
731 aa  279  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  27.49 
 
 
1055 aa  274  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  27.45 
 
 
791 aa  264  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  26.42 
 
 
692 aa  242  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  25.68 
 
 
761 aa  241  5e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  27.56 
 
 
694 aa  241  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  27.67 
 
 
728 aa  235  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  27.44 
 
 
708 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  26.98 
 
 
709 aa  232  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  26.34 
 
 
718 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  26.34 
 
 
718 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  26.68 
 
 
718 aa  230  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  27.72 
 
 
703 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  26.92 
 
 
691 aa  229  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 
691 aa  229  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 
691 aa  229  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  26.35 
 
 
691 aa  227  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  26.09 
 
 
698 aa  227  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  28.93 
 
 
751 aa  226  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  28.17 
 
 
734 aa  225  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  27.26 
 
 
701 aa  225  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.91 
 
 
759 aa  224  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  26.25 
 
 
691 aa  224  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.91 
 
 
759 aa  224  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  26.59 
 
 
708 aa  223  8e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 
691 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 
691 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 
691 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  25.88 
 
 
691 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.76 
 
 
759 aa  223  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.83 
 
 
759 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  25.85 
 
 
698 aa  219  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  26.13 
 
 
685 aa  218  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  27.46 
 
 
691 aa  217  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  26 
 
 
670 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  26.24 
 
 
732 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  29.02 
 
 
730 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  25.68 
 
 
698 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  25.94 
 
 
692 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  25.75 
 
 
726 aa  212  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  26.21 
 
 
691 aa  212  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  26.02 
 
 
726 aa  211  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  28.63 
 
 
739 aa  211  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2242  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  26.86 
 
 
750 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.514414  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  26.16 
 
 
726 aa  209  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  26.83 
 
 
720 aa  208  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  27.12 
 
 
692 aa  207  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  26.1 
 
 
692 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  25.29 
 
 
673 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  26.12 
 
 
688 aa  206  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  27.53 
 
 
690 aa  205  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  26.16 
 
 
688 aa  203  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  26.16 
 
 
688 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  24.9 
 
 
666 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  28.02 
 
 
731 aa  201  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.03 
 
 
879 aa  201  5e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.64 
 
 
893 aa  201  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  24.46 
 
 
692 aa  200  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  27.47 
 
 
677 aa  200  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  26.84 
 
 
697 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  24.79 
 
 
684 aa  197  9e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  27.03 
 
 
743 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3747  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.96 
 
 
793 aa  196  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3153  molybdopterin oxidoreductase  24.46 
 
 
689 aa  196  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  27.49 
 
 
712 aa  195  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  25.51 
 
 
703 aa  195  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2900  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.16 
 
 
792 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735186  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2788  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.16 
 
 
792 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27350  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  30.46 
 
 
1023 aa  193  9e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.72 
 
 
724 aa  193  9e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 
758 aa  193  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1687  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  26.52 
 
 
817 aa  192  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914371  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  27.06 
 
 
757 aa  192  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.68 
 
 
814 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.68 
 
 
814 aa  191  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.68 
 
 
814 aa  191  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  26.61 
 
 
899 aa  191  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.68 
 
 
814 aa  191  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>