More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0126 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  63.5 
 
 		 692 aa  901    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  100 
 
 		 685 aa  1409    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  32.61 
 
 		 729 aa  340  5e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  32.23 
 
 		 1135 aa  320  5e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  32.06 
 
 		 698 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  31.67 
 
 		 891 aa  313  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  29.9 
 
 		 745 aa  310  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  32.72 
 
 		 700 aa  307  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  32.97 
 
 		 711 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  31.06 
 
 		 726 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  29.18 
 
 		 747 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  31.55 
 
 		 1139 aa  300  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  32.39 
 
 		 739 aa  295  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  30.53 
 
 		 694 aa  290  5.0000000000000004e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  31.64 
 
 		 1143 aa  289  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  29.64 
 
 		 731 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  29.87 
 
 		 1055 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  28.83 
 
 		 749 aa  280  5e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  28.41 
 
 		 760 aa  261  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  28.12 
 
 		 764 aa  261  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  28.12 
 
 		 764 aa  261  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  28.12 
 
 		 764 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.32 
 
 		 754 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  27.67 
 
 		 764 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  26.94 
 
 		 764 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  27.06 
 
 		 761 aa  253  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  27.64 
 
 		 760 aa  250  7e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  27.36 
 
 		 791 aa  247  6.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  27 
 
 		 760 aa  244  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  27.96 
 
 		 760 aa  243  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  28.12 
 
 		 731 aa  242  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  27.44 
 
 		 760 aa  239  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  29.48 
 
 		 899 aa  239  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  26.78 
 
 		 760 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  27.84 
 
 		 738 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  27.4 
 
 		 747 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  28.2 
 
 		 722 aa  236  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  28.38 
 
 		 739 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  28.06 
 
 		 720 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  26.52 
 
 		 758 aa  232  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  30.78 
 
 		 737 aa  230  7e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  30.43 
 
 		 739 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  27.83 
 
 		 730 aa  229  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  26.75 
 
 		 758 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  27.67 
 
 		 734 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  26.47 
 
 		 758 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  27.27 
 
 		 738 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  26.47 
 
 		 758 aa  227  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  26.61 
 
 		 758 aa  227  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  26.47 
 
 		 758 aa  227  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  27.13 
 
 		 695 aa  226  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.46 
 
 		 688 aa  224  4e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  25.76 
 
 		 753 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  26.61 
 
 		 756 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  25.21 
 
 		 717 aa  223  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.1 
 
 		 688 aa  223  8e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  29.08 
 
 		 691 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  27.08 
 
 		 739 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  29.08 
 
 		 691 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  29.08 
 
 		 691 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  29.07 
 
 		 691 aa  220  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.53 
 
 		 893 aa  220  7e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  29.26 
 
 		 936 aa  219  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  28.82 
 
 		 703 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0345  nitrate reductase  27.97 
 
 		 731 aa  219  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  28.98 
 
 		 726 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  28.03 
 
 		 691 aa  218  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  26.79 
 
 		 777 aa  218  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  26.13 
 
 		 776 aa  218  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  27.06 
 
 		 741 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.43 
 
 		 685 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  27.34 
 
 		 687 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  29.65 
 
 		 670 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  25.29 
 
 		 764 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  28.75 
 
 		 726 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  28.99 
 
 		 688 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  28.28 
 
 		 691 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  27.79 
 
 		 691 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  26.95 
 
 		 737 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.69 
 
 		 677 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  26.9 
 
 		 747 aa  213  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.11 
 
 		 1130 aa  213  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.32 
 
 		 724 aa  212  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  29.24 
 
 		 750 aa  211  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  27.19 
 
 		 731 aa  211  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  28.33 
 
 		 726 aa  211  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  27.92 
 
 		 691 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  25.96 
 
 		 761 aa  209  1e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  26.8 
 
 		 759 aa  209  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  27.92 
 
 		 691 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.93 
 
 		 674 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  28.82 
 
 		 698 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.79 
 
 		 674 aa  208  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  27.54 
 
 		 698 aa  208  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  25.72 
 
 		 744 aa  208  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  27.5 
 
 		 698 aa  208  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  24.89 
 
 		 704 aa  208  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.14 
 
 		 687 aa  208  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.79 
 
 		 674 aa  207  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  28.1 
 
 		 691 aa  207  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>